Молекулярное силовое поле Merck - Merck molecular force field
Поле молекулярных сил Merck (MMFF) это семья химические силовые поля разработан Исследовательские лаборатории Merck. Они основаны на силовом поле MM3. MMFF не оптимизирован для одноразового использования, например для моделирования белки или маленький молекулы, но старается хорошо работать в широком диапазоне органическая химия расчеты. Параметры силового поля были получены из расчетных данных, состоящих из примерно 2800 структур, охватывающих широкий диапазон химических классов.[1]
Первое опубликованное силовое поле в семействе - MMFF94.[1] Набор молекулярных структур и соответствующие выходные данные реализации MMFF94 Халгрена представлены в Computational Chemistry List для проверки других реализаций MMFF.[2]
Одним из вариантов MMFF94 является MMFF94, который имеет разные параметры изгиба вне плоскости и двугранного кручения для планаризации делокализованных тригональных атомов азота, например в анилине.[3] «S» в MMFF94s означает «статический», поскольку MMFF94s лучше отражает усредненную по времени геометрию, чем MMFF94.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б Молекулярное силовое поле Merck. I. Основа, форма, объем, параметризация и производительность MMFF94, Томас А. Халгрен, J. Comput. Chem.; 1996; 490-519, Дои:10.1002 / (SICI) 1096-987X (199604) 17: 5/6 <490 :: AID-JCC1> 3.0.CO; 2-P
- ^ Кирсли, Саймон (июнь 1999). «Пакет проверки MMFF94». CCL.net. Список Вычислительной Химии, ООО. Получено 17 сентября 2016.
- ^ MMFF VI. Вариант MMFF94s для исследований по минимизации энергии, Томас А. Халгрен, J. Comput. Chem.; 1999; 720-729, Дои:10.1002 / (SICI) 1096-987X (199905) 20: 7 <720 :: AID-JCC7> 3.0.CO; 2-X
 | Этот химия -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |