Майкл Кристофер Вендл - Michael Christopher Wendl - Wikipedia

Майкл Вендл
Национальность	Американец
Известен	Вызов базы Phred Поток Куэтта[1] Теория секвенирования ДНК
Научная карьера
Поля	Вычислительная биология Вероятность
Докторант	Рамеш К. Агарвал[2]
Интернет сайт	Wendl.weebly.com

Майкл Кристофер Вендл математик и биомедицинский инженер, который работал над Теория секвенирования ДНК,^[3] покрывает и согласовывает проблемы вероятности, теоретической механики жидкости и соавторы Фред.^[4] Он был ученым на Проект "Геном человека" и занимался биоинформатикой и биостатистикой в ​​области рака. Вендл имеет этническое немецкое происхождение и является сыном аэрокосмического инженера. Майкл Дж. Вендл.^[5]

Поисковая работа

Теоретическая механика жидкости

Проблема течения с малым числом Рейнольдса в зазоре между двумя бесконечными цилиндрами, так называемая Поток Куэтта, была решена в 1845 г. Стокса.^[6] Вендль сообщил об обобщении этого решения для цилиндров конечной длины:^[1][7] который действительно может быть построен для экспериментальных работ в 1999 году в виде серии модифицированные функции Бесселя ${\displaystyle I_{1}}$ и ${\displaystyle K_{1}}$. Он также исследовал множество других вращательных устройств с низким числом Рейнольдса и устройств с приводом от сдвига, включая общую форму задачи о нестационарном дисковом потоке, для которой профиль скорости имеет следующий вид:^[8]

${\displaystyle u(r,z,t)=\Re \left(e^{i\sigma t}\left[{\frac {r\cdot \sinh(1+i)\beta z}{\sinh(1+i)\beta \phi }}\right]+{\frac {2}{\phi }}\sum _{j=1}^{\infty }{\frac {(-1)^{j}\cdot \alpha _{j}^{2}\cdot \sin(\alpha _{j}z)\cdot I_{1}\left({\sqrt {iR\sigma +\alpha _{j}^{2}}}r\right)}{(iR\sigma +\alpha _{j}^{2})\cdot I_{1}\left({\sqrt {iR\sigma +\alpha _{j}^{2}}}\right)}}\right)}$

куда ${\displaystyle \sigma }$, ${\displaystyle R}$, ${\displaystyle \beta }$, и ${\displaystyle \phi }$ физические параметры, ${\displaystyle \alpha _{j}}$ - собственные значения, а ${\displaystyle (r,z,t)}$ координаты. Этот результат объединил ранее опубликованные частные случаи для стационарного потока, бесконечных дисков и т. Д.^[8]

Проблемы покрытия и сопоставления в вероятности

Вендл исследовал ряд проблем сопоставления и покрытия комбинаторной вероятности, особенно когда эти проблемы применимы к молекулярной биологии. Он определил распределение количества совпадений пар целых чисел мультимножества с точки зрения Полиномы Белла,^[9] проблема, имеющая непосредственное отношение к физическое картирование ДНК. До этого исследователи использовали ряд специальных количественных показателей, таких как Счет Сулстона, который идеализировал матчевые испытания как независимые. Его результат для предложение на день рождения для нескольких групп^[10] решает различные связанные «проблемы столкновения», например некоторые виды P2P поиск.^[11] Он также исследовал множество одномерных задач покрытия (см. Обзор автора Кирилл Домб^[12]), обобщая базовую конфигурацию на формы, относящиеся к молекулярной биологии.^[13][14] Его прикрытие исследования редких вариантов ДНК с Ричард К. Уилсон^[15] сыграл роль в разработке Проект 1000 геномов.^[16]

Биоинформатика и биостатистика

Wendl в соавторстве Фред, широко используемый анализатор следов ДНК, который преобразовывал исходный выходной поток ранних машин для создания последовательностей ДНК в последовательности последовательностей.^[17][18] Он также внес большой вклад в биостатистический анализ исследований рака.^[19][20]

внешняя ссылка

• Майкл Кристофер Вендл на Проект "Математическая генеалогия"
• Майкл Кристофер Вендл публикации, проиндексированные Google ученый

Рекомендации

1. Бордаг Л.А. и соавт. (2005) Взаимодействие вращательного движения и осевого потока в малых геометриях для задачи Тейлора – Куэтта , J. Жидкости и структуры 20(5), 621–641. Авторы прямо комментируют решение Вендля, появившееся так долго после классической проблемы, обсуждавшейся Стоксом в 1845 году: «Также немного удивительно, что точное аналитическое решение для азимутальной составляющей профиля течения Тейлора – Куэтта с граничными условиями на крышках цилиндров было полученные совсем недавно в работе Wendl (1999). Его результаты показывают сильное влияние заглушек на профили потока ».
2. https://www.genealogy.math.ndsu.nodak.edu/id.php?id=37582
3. Дорман, Н (2006) Длинное и короткое из этого, Биотехнологии 41(4), стр. 367.
4. Юинг, Б., Хиллер, Л., Wendl, M.C., и Грин, П. (1998) Вызов базы данных автоматического секвенсора с использованием phred. I. Оценка точности. Геномные исследования 8(3), 175–185. PMID  9521921 полная статья
5. П. Хуммель и Н. Фури: «Закельхаузен им Банат», том 3, опубликованный Heimatsortsgemeinschaft Sackelhausen, Ройтлинген, ФРГ, 2007, страницы 2236-2237.
6. Г.Г. Стокса (1845) `` О теориях внутреннего трения движущихся жидкостей, а также о равновесии и движении упругих тел. in Mathematical and Physical Papers, стр. 102-104, Кембридж, Великобритания: Cambridge University Press, 1880.
7. Вендл MC (1999) Общее решение для профиля потока Куэтта, Физический обзор E 60(5), 6192–6194.
8. Wendl MC (2001) Математический анализ коаксиальных дисковых ячеистых устройств нагрузки сдвигом, Review of Scientific Instruments 72 (11), 4212-4217.
9. Wendl MC (2005) Вероятностная оценка перекрытий клонов при картировании ДНК-отпечатков пальцев с помощью априорных моделей, J. Comp. Биол. 12 (3), 283-297.
10. Вендл MC (2003) Вероятность столкновения между наборами случайных величин, Стат. Вероятность. Lett. 64(3), 249–254.
11. Хаутакорпи, Дж. И Шульц, Г. (2010) Технико-экономическое обоснование произвольного поиска в структурированных одноранговых сетях, IEEE Computer Communications and Networks, Proc ICCCN, pp 1–8.
12. Кирилл Домб (1989) Покрытие случайными интервалами и протекание одномерного континуума, J. Stat. Phys. 55, 441-460.
13. Wendl MC (2008) Случайное покрытие нескольких одномерных конечных доменов с приложением к секвенированию ДНК, SIAM J. Appl. Математика. 68 (3), 890-905.
14. Wendl MC, Kota K, Weinstock GM и Mitreva M (2013) Теории покрытия для метагеномного секвенирования ДНК, основанные на обобщении теоремы Стивенса, J. ​​Math. Биол. 67 (5), 1141-1161.
15. Wendl MC и Wilson RK (2009) Теория обнаружения редких вариантов посредством секвенирования ДНК, BMC Genomics 10 art. 485.
16. Альтшулер Д.М. и соавт. (2010) Карта вариаций генома человека по результатам популяционного секвенирования, Nature 467 (7319), 1061-1073.
17. Кобольдт, Д. К. и Миллер, Р. Д. (2011) Идентификация полиморфных маркеров для генетического картирования, глава 2 книги «Геномика: основные методы», John Wiley and Sons.
18. Хайсмит, У. Э. (2006) Электрофоретические методы обнаружения мутаций и секвенирования ДНК, глава 9 в "Молекулярной диагностике для клинических лаборантов", Humana Press
19. Wendl MC et al. (2011) PathScan: инструмент для определения мутационной значимости в группах предполагаемых онкологических генов, Bioinformatics 27 (12), 1595-1602.
20. Лу Ц., Се М., Вендл М.К. и др. (2015) Модели и функциональные последствия редких вариантов зародышевой линии при 12 типах рака, Nature Comm. 6 арт. 10086.