Многоволновая аномальная дисперсия - Multi-wavelength anomalous dispersion

Многоволновая аномальная дифракция (иногда Многоволновая аномальная дисперсия; сокращенный СУМАСШЕДШИЙ) - техника, используемая в Рентгеновская кристаллография что облегчает определение трехмерной структуры биологических макромолекул (например, ДНК, рецепторов лекарств) с помощью раствора фазовая проблема.^[1]

MAD был разработан Уэйн Хендриксон работая в качестве постдокторант под Джером Карл на Лаборатория военно-морских исследований США.^[2] Математика, на которой MAD ​​(и ее прародитель Аномальная дисперсия на одной длине волны ) были разработаны Джером Карл, работа, за которую он был награжден 1985 г. Нобелевская премия по химии (вместе с Герберт Хауптман ).

Смотрите также

Аномальная дисперсия

• Многоволновая аномальная дисперсия (MAD)
• Аномальная дисперсия на одной длине волны (ГРУСТНЫЙ)

Изоморфное замещение

Два метода получения необходимой информации о фазировке путем введения тяжелых атомов в изоморфные кристаллы:

• Множественная изоморфная замена (МИР); и
• Единичная изоморфная замена с аномальным сигналом (СИРАС)

Другой

• Аномальное рассеяние
• Аномальное рассеяние рентгеновских лучей
• Карта Паттерсона

Рекомендации

1. Хендриксон В., Огата С. (1997). «Определение фазы из измерений многоволновой аномальной дифракции». Методы в энзимологии. 276: 494–523. Дои:10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9. ISBN  978-0-12-182177-7. PMID  27799111.
2. Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на множестве длин волн». Сделки ACA. 21.

дальнейшее чтение

• Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на множестве длин волн». Сделки ACA. 21.
• Карл Дж (1980). "Некоторые разработки в области аномальной дисперсии для структурного исследования макромолекулярных систем в биологии". Международный журнал квантовой химии: симпозиум по квантовой биологии. 7: 357–367. Дои:10.1002 / qua.560180734.
• Карл Дж (1989). «Линейный алгебраический анализ конструкций с одним преобладающим типом аномального рассеивателя». Acta Crystallographica A. 45 (4): 303–307. Дои:10.1107 / s0108767388013042. PMID  2559755.
• Палер А., Смит Дж. Л., Хендриксон В. А. (1990). "Вероятностное представление фазовой информации от многоволновой аномальной дисперсии". Acta Crystallographica A. 46 (7): 537–540. Дои:10.1107 / s0108767390002379.
• Тервиллигер TC (1994). «MAD Phasing: байесовские оценки FA». Acta Crystallographica D. 50: 11–16. Дои:10.1107 / s0907444993008224.
• Тервиллигер TC (1994). «Стадия MAD: рассмотрение дисперсионных различий как информации об изоморфном замещении». Acta Crystallographica D. 50 (Пт 1): 17–23. Дои:10.1107 / s0907444993008236. PMID  15299472.
• Fourme R, Shepard W., Kahn R, l'Hermite G, de La Sierra, Иллинойс (1995). «Метод многоволновой аномальной контрастности растворителя (MASC) в макроколекулярной кристаллографии». Журнал синхротронного излучения. 2 (Пт 1): 36–48. Дои:10.1107 / S0909049594006680. PMID  16714785.
• de la Fortelle E, Bricogne G (1997). "Уточнение параметров тяжелых атомов с максимальной вероятностью для методов множественного изоморфного замещения и методов многоволновой аномальной дифракции". Методы в энзимологии. 276: 472–494. Дои:10.1016 / S0076-6879 (97) 76073-7. ISBN  978-0-12-182177-7. PMID  27799110.
• Хендриксон WA, Огата CM (1997). «Определение фазы из измерений аномальной дифракции на многих длинах волн». Методы в энзимологии. 276: 494–523. Дои:10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9. ISBN  978-0-12-182177-7. PMID  27799111.
• Белла Дж, Россманн MG (1998). «Общий алгоритм фазирования для множественных данных MAD и MIR». Acta Crystallographica D. 54 (2): 159–174. Дои:10.1107 / s0907444997010469. PMID  9761882.
• Гусс Дж. М., Мерритт Е. А., Физакерли Р. П., Хедман Б., Мурата М., Ходжсон К.О., Freeman HC (1989). «Определение фазы с помощью дифракции рентгеновских лучей с множеством длин волн: кристаллическая структура основного синего белка меди из огурцов». Наука. 241 (4867): 806–811. Bibcode:1988Sci ... 241..806G. Дои:10.1126 / science.3406739. PMID  3406739.

внешняя ссылка

• MAD фазировка - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.
• HHMI Bio для Уэйна Хендриксона
• Домашняя страница Уэйна Хендриксона
• Хендриксон Лаборатория Резюме исследований
• Джером Карл Нобель биография
• Признание NRL Нобелевской премии

Компьютерные программы

• Пакет поглощения SSRL — Бреннан С., Коуэн П.Л. (1992). «Набор программ для расчета характеристик поглощения, отражения и дифракции рентгеновских лучей для различных материалов на произвольных длинах волн». Обзор научных инструментов. 63 (1): 850. Bibcode:1992RScI ... 63..850B. Дои:10.1063/1.1142625.
• CHOOCH — Эванс Г., Петтифер РФ (2001). "CHOOCH: программа для определения факторов аномального рассеяния из спектров рентгеновской флуоресценции". Журнал прикладной кристаллографии. 34: 82–86. Дои:10.1107 / S0021889800014655.
• Встряхнуть и испечь (SnB) — Смит Г.Д., Нагар Б., Рини Дж. М., Хауптман Г. А., Благословение Р. Х. (1998). «Использование Snb для определения субструктуры аномального рассеяния». Acta Crystallographica D. 54 (Pt 5): 799–804. Дои:10.1107 / S0907444997018805. PMID  9757093.
• ШЕЛКС — Шелдрик GM (1998). «ШЕЛКС: приложения к макромолекулам». В С. Фортье (ред.). Прямые методы решения макромолекулярных структур. Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. С. 401–411. ISBN  0-7923-4949-0.

Учебники и примеры

• Эванс, Гвиндаф (октябрь 1994 г.). «Метод множественной аномальной дифракции длин волн с использованием синхротронного излучения при оптимальных энергиях рентгеновского излучения: применение в кристаллографии белков». Кандидатская диссертация. Уорикский университет.