Тип NC10 - NC10 phylum

NC10 это бактериальный тип с кандидат status, что означает, что его члены до сих пор остаются некультурными. Сложность получения лабораторных культур может быть связана с низкой скоростью роста и другими ограничивающими факторами роста.[1][2][3][4].

Метиломирабилис оксифера, член филума NC10, является первым организмом, способным спаривать окисление метана к сокращению нитрит к диазот (N2)[5]. Это важно по нескольким причинам. Во-первых, известно только три других биологических пути производства кислорода (фотосинтез, хлоратное дыхание, и детоксикация активные формы кислорода ). Во-вторых, анаэробное окисление метана (AMO) в сочетании с восстановлением нитрита связывает глобальные углерод и азотные циклы, и таким образом денитрифицировать метанотрофы в типе NC10 может влиять на содержание метана в атмосфере[1]. В-третьих, это открытие открывает возможность того, что кислород был доступен в атмосфере до эволюции кислородный фотосинтез и Великое окислительное событие[6], который ставит под сомнение определенные аспекты современных теорий относительно эволюции ранней жизни на Земле.

Тип NC10 был впервые предложен в 2003 году на основе сильно расходящихся последовательностей гена 16S рРНК из водных микробных образований в затопленных пещерах (пещеры Налларбор, Австралия).[7]. Первые сведения о геноме этого типа были опубликованы в 2010 г.[6]. Члены филума NC10 были обнаружены в окружающей среде, включая торфяники Brunssummerheide (Лимбург, Нидерланды).[8], глубокое стратифицированное озеро Цуг (Центральная Швейцария)[9], и рисовое поле с длительным удобрением (Ханчжоу, Китай)[10]

На сегодняшний день предложенные виды NC10 включают Метиломирабилис оксифера[5] и Methylomirabilis lanthanidiphila[11]

Рекомендации

  1. ^ а б Он, Чжаньфэй; Цай, Чаоян; Ван, Цзяци; Сюй, Синьхуа; Чжэн, Пин; Jetten, Mike S.M .; Ху, Баолань (2016-09-01). «Новый денитрифицирующий метанотроф филума NC10 и его микроколонии». Научные отчеты. 6 (1): 32241. Bibcode:2016НатСР ... 632241H. Дои:10.1038 / srep32241. ISSN  2045-2322. ЧВК  5007514. PMID  27582299.
  2. ^ Raghoebarsing, Ashna A .; Поль, Арьян; van de Pas-Schoonen, Katinka T .; Smolders, Alfons J.P .; Ettwig, Katharina F .; Rijpstra, W. Irene C .; Схоутен, Стефан; Дамсте, Яап С. Синнингхе; Op den Camp, Huub J.M .; Jetten, Mike S.M .; Строус, Марк (апрель 2006 г.). «Консорциум микробов сочетает анаэробное окисление метана с денитрификацией». Природа. 440 (7086): 918–921. Bibcode:2006Натура.440..918R. Дои:10.1038 / природа04617. ISSN  1476-4687. PMID  16612380.
  3. ^ Ettwig, Katharina F .; Шима, Сейго; Пас ‐ Шунен, Катинка Т. Ван Де; Кант, Йорг; Medema, Marnix H .; Кэмп, Хуб Дж. М. Оп Дэн; Jetten, Mike S.M .; Строус, Марк (2008). «Денитрифицирующие бактерии анаэробно окисляют метан в отсутствие архей». Экологическая микробиология. 10 (11): 3164–3173. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2008.01724.x. ISSN  1462-2920. PMID  18721142.
  4. ^ Wu, Ming L .; Ettwig, Katharina F .; Jetten, Mike S.M .; Строус, Марк; Кельтьенс, Ян Т .; Нифтрик, Лаура ван (01.02.2011). «Новый внутриаэробный метаболизм у нитрит-зависимой анаэробной метанокисляющей бактерии Methylomirabilis oxyfera Candidatus»'". Сделки Биохимического Общества. 39 (1): 243–248. Дои:10.1042 / BST0390243. ISSN  0300-5127. PMID  21265781.
  5. ^ а б Ettwig, Katharina F .; Батлер, Маргарет К .; Ле Пелье, Дени; Пеллетье, Эрик; Мангено, Софи; Kuypers, Marcel M. M .; Шрайбер, Франк; Dutilh, Bas E .; Зеделиус, Иоганнес; де Бир, Дирк; Глерих, Джолейн (март 2010 г.). «Анаэробное окисление метана под действием нитритов кислородными бактериями». Природа. 464 (7288): 543–548. Bibcode:2010Натура.464..543E. Дои:10.1038 / природа08883. ISSN  1476-4687. PMID  20336137.
  6. ^ а б Ettwig, Katharina F .; Батлер, Маргарет К .; Ле Пелье, Дени; Пеллетье, Эрик; Мангено, Софи; Kuypers, Marcel M. M .; Шрайбер, Франк; Dutilh, Bas E .; Зеделиус, Иоганнес; де Бир, Дирк; Глерих, Джолейн (март 2010 г.). «Анаэробное окисление метана под действием нитритов кислородными бактериями». Природа. 464 (7288): 543–548. Bibcode:2010Натура.464..543E. Дои:10.1038 / природа08883. ISSN  1476-4687. PMID  20336137.
  7. ^ Раппе, Майкл С .; Джованнони, Стивен Дж. (Октябрь 2003 г.). «Культурное микробное большинство». Ежегодный обзор микробиологии. 57 (1): 369–394. Дои:10.1146 / annurev.micro.57.030502.090759. ISSN  0066-4227. PMID  14527284.
  8. ^ Чжу, Баоли; ван Дейк, Гийс; Фриц, Кристиан; Smolders, Alfons J.P .; Поль, Арьян; Jetten, Mike S.M .; Эттвиг, Катарина Ф. (05.10.2012). «Анаэробное окисление метана в минеротрофном торфянике: обогащение нитрит-зависимых метанокисляющих бактерий». Прикладная и экологическая микробиология. 78 (24): 8657–8665. Дои:10.1128 / aem.02102-12. ISSN  0099-2240. PMID  23042166.
  9. ^ Graf, Jon S .; Mayr, Magdalena J .; Marchant, Hannah K .; Тинкен, Даниэла; Hach, Philipp F .; Бренд, Андреас; Schubert, Carsten J .; Kuypers, Marcel M. M .; Милуцка, Яна (2018). «Цветение денитрифицирующего метанотрофа 'Candidatus Methylomirabilis limnetica' в глубоком стратифицированном озере». Экологическая микробиология. 20 (7): 2598–2614. Дои:10.1111/1462-2920.14285. ISSN  1462-2920. PMID  29806730.
  10. ^ Он, Чжаньфэй; Цай, Чен; Шен, Лидонг; Лу, Липин; Чжэн, Пин; Сюй, Синьхуа; Ху, Баолань (01.01.2015). «Влияние источников инокулята на обогащение нитрит-зависимых анаэробных метанокисляющих бактерий». Прикладная микробиология и биотехнология. 99 (2): 939–946. Дои:10.1007 / s00253-014-6033-8. ISSN  1432-0614. PMID  25186148.
  11. ^ Версантвоорт, Воутер; Герреро-Крус, Саймон; Speth, Daan R .; Фрэнк, Джерун; Гамбелли, Лавиния; Кремерс, Герт; ван Ален, Тео; Jetten, Mike S.M .; Картал, Боран; Op den Camp, Huub J.M .; Рейманн, Иоахим (2018). «Сравнительная геномика видов Candidatus Methylomirabilis и описание Ca. Methylomirabilis Lanthanidiphila». Границы микробиологии. 9. Дои:10.3389 / fmicb.2018.01672. ISSN  1664-302X. PMID  30140258.