Неван Кроган - Nevan Krogan

Неван Кроган
NevanJKrogan.jpg
Академическое образование
ОбразованиеУниверситет Регины
Университет Торонто
ТезисБелковые комплексы и эпистатические профили мини-массивов (E-MAP) выявляют пути, участвующие в функции хроматина.  (2006)
ДокторантДжек Гринблатт
Академическая работа
УчрежденияКалифорнийский университет в Сан-Франциско (UCSF)
Институты Дж. Дэвида Гладстона

Неван Дж. Кроган,[1] канадец молекулярный биолог, профессор кафедры клеточной и молекулярной фармакологии Калифорнийский университет в Сан-Франциско (UCSF) и старший следователь Институты Дж. Дэвида Гладстона. Он также является директором Института количественных биологических наук (QBI),[2] который фокусируется на разработке и использовании количественных подходов для изучения основных биологических механизмов, часто связанных с областями болезней. Он является директором Центра HARC, совместной группы, финансируемой Национальным институтом здравоохранения, которая занимается структурной характеристикой белковых комплексов ВИЧ-человека. Исследования Крогана сосредоточены на использовании количественных системных подходов для понимания сложных биологических и биомедицинских проблем. Автор более 250 статей.[3] в области молекулярной биологии и прочитал более 300 лекций и семинаров по всему миру.

ранняя жизнь и образование

Кроган получил степень бакалавра химии в Университет Регины в 1997 году. в 1999 году в Университете Регины Кроган получил степень доктора философии. на Университет Торонто с Джек Гринблатт как его научный руководитель.

Во время своей кандидатской диссертации он руководил проектом, который систематически идентифицировал белковые комплексы в Saccharomyces cerevisiae через тандемная аффинная очистка /масс-спектрометрии (AP-MS) стратегия. Это привело к характеристике более 500 комплексов, включающих более 4000 белков. В течение этого времени он работал над разработкой подхода, названного E-MAP, для генерации высокой пропускной способности и количественного анализа данных генетического взаимодействия.[4] Объединение генетических данных и данных белок-белкового взаимодействия привело к более глубокому пониманию взаимосвязи между физическими и генетическими данными.[5] а также понимание широкого спектра биологических процессов, включая функцию хроматина, транскрипцию, перенос белков и процессинг РНК.[6][7][8][9]

Карьера

В июле 2011 года Кроган начал работать в Институте вирусологии и иммунологии Гладстона (GIVI) и Институте сердечных заболеваний Гладстона (GICD) в качестве младшего исследователя. В 2012 году он провел комплексное исследование с использованием AP-MS для систематического выявления белок-белковых взаимодействий между ВИЧ и клетками-хозяевами.[10] Было идентифицировано 497 различных белок-белковых взаимодействий ВИЧ-человека,[11] только 19 из которых ранее были описаны в литературе. .[12]

Кроган был назначен директором UCSF-QB3 в июле 2013 г.[13] В том же году его повысили до старшего следователя GIVI и GICD. Он создал Центр научной масс-спектрометрии Thermo Fisher для обнаружения целевых заболеваний в Институте Дж. Дэвида Гладстона и является его директором.[14] Кроган вместе с Трей Идекер в UCSD запустил инициативу по картированию раковых клеток (CCMI) в UCSF в 2015 году.[15] Группа, в которую входят многие исследователи из UCSF и UCSD, специализируется на использовании системных подходов и сетевой биологии для интерпретации геномных данных рака.[16]

Награды и отличия

  • 2004 - Мемориальная премия Ханны Фаркас-Химсли и Александра[нужна цитата ]
  • 2005 - Премия Л. В. Макферсона по микробиологии[нужна цитата ]
  • 2008 - 25 лучших авторов важных статей по молекулярной биологии и генетике с 2002 по 2006 гг.[17]
  • 2009-2012 - исследователь Сирла, Фонд Сирла[18]
  • 2009-2014 - Заслуженный молодой ученый Кека, Фонд В. М. Кека[нужна цитата ]
  • 2017 - Премия Родденберри, Фонд Родденберри

Рекомендации

  1. ^ «Кроган Лаб». kroganlab.ucsf.edu. Получено 8 января 2018.
  2. ^ «UCSF создает Институт количественных биологических наук». Калифорнийский университет в Сан-Франциско. Получено 2017-02-01.
  3. ^ "Неван Кроган - цитирование ученых Google". scholar.google.com. Получено 2017-02-02.
  4. ^ Шульдинер, Майя; Коллинз, Шон Р .; Томпсон, Натали Дж .; Деник, Владимир; Бхамидипати, Арунашри; Пунна, Тануджа; Ихмелс, Ян; Эндрюс, Бренда; Бун, Чарльз (2005-11-04). «Изучение функции и организации раннего секреторного пути дрожжей с помощью эпистатического профиля миниатюрного массива». Клетка. 123 (3): 507–519. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.031. ISSN  0092-8674. PMID  16269340. S2CID  5686200.
  5. ^ Коллинз, Шон Р .; Миллер, Кайл М .; Maas, Nancy L .; Рогуев, Ассен; Филлингем, Джеффри; Chu, Clement S .; Шульдинер, Майя; Геббиа, Маринелла; Рехт, Джудит (2007-04-12). «Функциональное рассечение белковых комплексов, участвующих в биологии дрожжевых хромосом с использованием карты генетического взаимодействия». Природа. 446 (7137): 806–810. Дои:10.1038 / природа05649. ISSN  1476-4687. PMID  17314980. S2CID  4419709.
  6. ^ Krogan, Nevan J .; Пэн, Вэнь-Тао; Кэгни, Джерард; Робинсон, Марк Д .; Хау, Робин; Чжун, Гуцин; Го, Синхуа; Чжан, Синь; Канадиен, Вероника (30 января 2004). «Макромолекулярный состав дрожжевых РНК-процессинговых комплексов высокой четкости». Молекулярная клетка. 13 (2): 225–239. Дои:10.1016 / с1097-2765 (04) 00003-6. ISSN  1097-2765. PMID  14759368.
  7. ^ Krogan, Nevan J .; Кио, Майкл-Кристофер; Датта, Нира; Сава, Чика; Райан, Оуэн В .; Дин, Хуйминь; Haw, Robin A .; Путулал, Джеффри; Тонг, Эми (2003-12-01). «АТФазный комплекс семейства Snf2, необходимый для рекрутирования варианта гистона H2A Htz1». Молекулярная клетка. 12 (6): 1565–1576. Дои:10.1016 / с1097-2765 (03) 00497-0. ISSN  1097-2765. PMID  14690608.
  8. ^ Кио, Майкл-Кристофер; Kurdistani, Siavash K .; Моррис, Стефани А .; Ан, Сон Хун; Подольный, Владимир; Коллинз, Шон Р .; Шульдинер, Майя; Чин, Каю; Пунна, Тануджа (18 ноября 2005 г.). «Котранскрипционное метилирование set2 гистона H3 лизина 36 рекрутирует репрессивный комплекс Rpd3». Клетка. 123 (4): 593–605. Дои:10.1016 / j.cell.2005.10.025. ISSN  0092-8674. PMID  16286008. S2CID  16129409.
  9. ^ Кио, Майкл-Кристофер; Ким, Юнг-Э; Дауни, Майкл; Филлингем, Джеффри; Чоудхури, Дипанджан; Харрисон, Джейкоб С .; Ониши, Мэгуми; Датта, Нира; Галиция, Сара (26 января 2006 г.). «Комплекс фосфатазы, который дефосфорилирует гаммаН2АХ, регулирует восстановление контрольной точки повреждения ДНК». Природа. 439 (7075): 497–501. Дои:10.1038 / природа04384. ISSN  1476-4687. PMID  16299494. S2CID  4317517.
  10. ^ «Как ВИЧ захватывает механизмы клетки-хозяина | Статья о взаимодействии белков». Биотехнологии. Получено 2017-02-01.
  11. ^ Егер, Стефани; Цимерманчич, Питер; Гульбахче, Натали; Джонсон, Джеффри Р .; Макговерн, Кэтрин Э .; Clarke, Starlynn C .; Шалес, Майкл; Mercenne, Gaelle; Паче, Ларс (21 декабря 2011 г.). «Глобальный ландшафт белковых комплексов ВИЧ-человека». Природа. 481 (7381): 365–370. Дои:10.1038 / природа10719. ISSN  1476-4687. ЧВК  3310911. PMID  22190034.
  12. ^ Егер, Стефани; Ким, Дон Ён; Халтквист, Джадд Ф .; Синдо, Кейсуке; LaRue, Rebecca S .; Квон, Ынджу; Ли, Мин; Андерсон, Бретт Д.; Йен, Линда (2011-12-21). "Vif захватывает CBF-β, чтобы разрушить APOBEC3G и способствовать заражению ВИЧ-1". Природа. 481 (7381): 371–375. Дои:10.1038 / природа10693. ISSN  1476-4687. ЧВК  3310910. PMID  22190037.
  13. ^ «Известный молекулярный биолог назначен новым директором QB3-UCSF». Калифорнийский университет в Сан-Франциско. Получено 2017-02-01.
  14. ^ «В Гладстоне открывается центр протеомики Thermo Fisher для обнаружения целевых заболеваний». EurekAlert!. Получено 2017-02-01.
  15. ^ «Использование больших данных для выявления скрытых генетических слабостей рака». Получено 2017-02-01.
  16. ^ «UCSF, исследователи из Сан-Диего, оспаривающие статус-кво в лечении рака». Получено 2017-02-01.
  17. ^ "Самое горячее секвенирование биологии, 2002-06 гг.".
  18. ^ "Программа стипендиатов Сирла: Неван Дж. Кроган (2009)". www.searlescholars.net. Получено 2017-02-01.