OLE РНК - OLE RNA

Богато украшенная большая экстремофильная РНК
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности OLE
Идентификаторы
Символ	OLE
Рфам	RF01071
Прочие данные
РНК тип	Ген
Домен (ы)	Бактерии
ТАК	SO: 0001263
PDB структуры	PDBe

OLE РНК (Богато украшенная большая экстремофильная РНК) является сохраняющимся РНК структура присутствует в некоторых бактерии.^[1] РНК в среднем составляет примерно 610 нуклеотиды в длину. Единственные известные РНК, которые длиннее, чем OLE-РНК: рибозимы такой как интрон группы II и рибосомные РНК. Исключительная длина и высококонсервативная структура OLE-РНК подтолкнули к гипотезе о том, что OLE-РНК может быть рибозимом или иным образом выполнять сложную биохимическую задачу.

OLE-РНК преимущественно встречаются в порядке Clostridiales, но другие виды Фирмикуты также содержат OLE РНК. Организмы, содержащие OLE-РНК, преимущественно экстремофилы и анаэробы.

OLE-РНК транскрибируются как РНК, и эксперименты в Bacillus halodurans показать, что это записано в мРНК с 10 другими гены. Соседние гены консервативны в непосредственной близости от OLE РНК у большинства видов, содержащих ее, но у Desulfitobacterium hafniense они расположены в другом месте на хромосома. OLE-РНК процессируются из более крупного транскрипта в более короткую РНК, которая примерно соответствует консервативной, ~ 610-нуклеотидной структуре. Гены, кодирующие класс белков с неизвестной функцией, обычно расположены непосредственно ниже OLE РНК, и присутствие этого класса белков коррелирует у видов с присутствием OLE РНК. Эта корреляция предполагает возможную функциональную связь между РНК и белком.

Рекомендации

1. Пуэрта-Фернандес Э, Баррик Дж. Э., Рот А., Брейкер Р. Р. (декабрь 2006 г.). «Идентификация большой некодирующей РНК у экстремофильных эубактерий». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (51): 19490–19495. Дои:10.1073 / pnas.0607493103. ЧВК  1748253. PMID  17164334.

внешняя ссылка

• Страница для OLE_RNA в Рфам