Педобактер - Pedobacter
Педобактер | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Учебный класс: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Педобактер |
Педобактер это род из Грамотрицательный связанный с почвой бактерии. Виды в том числе Педобактер гепарин, ранее известный как Флавобактерии гепаринум, продуцируют гепариназу и способны использовать гепарин как их единственный источник углерода и азота.[1]
В молекулярной биологии Педобактер также был идентифицирован как загрязнитель реагентов набора для экстракции ДНК и систем сверхчистой воды, что может привести к его ошибочному отображению в микробиоте или наборах метагеномных данных.[2]
Разновидность
- Педобактер африканский
- Pedobacter agri
- Pedobacter alluvionis
- Педобактер арктический
- Pedobacter borealis
- Педобактерный криоконит
- Pedobacter ginsengisoli
- Педобактер гепарин
- Pedobacter insulae
- Pedobacter jejuensis
- Педобактер лентус
- Pedobacter nyackensis
- Pedobacter rhizosphaerae
- Pedobacter salans
- Pedobacter soli
- Педобактер террикола
Рекомендации
- ^ Шая, Д. (2006). «Кристаллическая структура гепариназы II из Pedobacter heparinus и ее комплекса с дисахаридным продуктом». J. Biol. Chem. 281 (22): 15525–35. Дои:10.1074 / jbc.m512055200. PMID 16565082.
- ^ Солтер, S; Кокс, М; Турек, Э; Калус, S; Куксон, Вт; Моффатт, М; Тернер, П; Parkhill, J; Ломан, N; Уокер, А (2014). «Загрязнение реагента может критически повлиять на анализ микробиома на основе последовательностей». bioRxiv 10.1101/007187.
дальнейшее чтение
- Кук, МуЧанг; Пак, Ёнджин; Йи, Тэ-Ху (2014). «Pedobacter jejuensis sp nov., Выделенный из почвы сосновой рощи, и исправленное описание рода Pedobacter». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 64 (Часть 5): 1789–1794. Дои:10.1099 / ijs.0.058024-0. PMID 24573158. Архивировано из оригинал на 2014-11-12. Получено 12 ноября 2014.