Типирование фага - Phage typing

Культура бактерий, инфицированная бактериофагами, «дырки» - это области, где бактерии были убиты вирусом. Диаметр культуры 10 см.

Типирование фага это метод, используемый для обнаружения одиночных напряжения из бактерии. Он используется для отслеживания источника вспышек инфекций.[1] В вирусы что инфекционные бактерии называются бактериофаги (сокращенно «фаги»), и некоторые из них могут инфицировать только один штамм бактерий. Эти фаги используются для идентификации различных штаммов бактерий в пределах одного вида.

Культуру штамма выращивают на агаре и сушат. На основе чашка Петри чтобы выделить разные регионы. Инокуляция каждого квадрата сетки осуществляется разными фагами. Фаговым каплям дают высохнуть и инкубируют: чувствительные фаговые области покажут круговое просветление, где бактерии были лизированы, и это используется для дифференциации.[2]Заметен на месте слияния бактерий

Рекомендации

  1. ^ Баггесен Д.Л., Соренсен Г., Нильсен Е.М., Вегенер Х.С. Фаговое типирование Salmonella Typhimurium - по-прежнему ли это полезный инструмент для эпиднадзора и расследования вспышек?. Евронаблюдение. 2010;15(4):19471. PMID  20122382.
  2. ^ Turbadkar SD, Ghadge DP, Patil S, Chowdhary AS, Bharadwaj R (апрель 2007 г.). «Циркулирующий фаг типа Vibrio cholerae в Мумбаи». Индийский журнал медицинской микробиологии. 25 (2): 177–8. Дои:10.4103/0255-0857.32738. PMID  17582202.

[1][2][3][4][5][6][7][8][9][10][11]

  1. ^ Аламиан, Дадар С., Солимани М., Бехрозихах С., Этемади. 2019. Случай подтверждения личности Brucella abortus S99 методами фагового типирования и ПЦР.
  2. ^ Коули Л.А., Лоу А.С., Пикард Д., Бойнетт С.Дж., Даллман Т.Дж., Дэй М, Перри Н., Галли Д.Л., Паркхилл Дж., Дженкинс С. и др. 2018. Секвенирование вставкой транспозона выясняет участие новых генов в чувствительности и устойчивости к фагам T4 и T7 в Escherichia coli.
  3. ^ Kaimal S, D’souza M, Sistla S, Parija SC. 2012. Фаготипирование при пустулезном дерматите и атрофическом дерматите: играет ли роль носитель стафилококков?
  4. ^ Лан Р., Стивенсон Дж., Донохо К., Уорд Л., Ривз ПР. 2007. Молекулярные маркеры, способные заменить фаговое типирование для Salmonella enterica serovar typhimurium. J Microbiol Methods.
  5. ^ Лиенеманн Т., Кюйхкинен А., Халкилахти Дж., Хаукка К., Сийтонен А. 2015. Характеристика изолятов Salmonella Typhimurium от внутренних инфекций в Финляндии с помощью фагового типирования, тестирования чувствительности к противомикробным препаратам, PFGE и MLVA. BMC Microbiol.
  6. ^ Prendergast DM, O'Grady D, Fanning S, Cormican M, Delappe N, Egan J, Mannion C, Fanning J, Gutierrez M. 2011. Применение анализа тандемных повторов (MLVA) с переменным числом множественных локусов, типирование фага и чувствительность к антимикробным препаратам тестирование на подтип Salmonella enterica, серовар Typhimurium, выделенный на свинофермах, скотобойнях и мясокомбинатах в Ирландии. Food Microbiol.
  7. ^ Schürch AC, van Soolingen D. 2012. ДНК-фингерпринтинг Mycobacterium tuberculosis: от фаготипирования до полногеномного секвенирования. Заразить Genet Evol.
  8. ^ Szymczak P, Vogensen FK, Janzen T. 2019. Новые изоляты бактериофагов Streptococcus thermophilus из группы 5093, идентифицированные с помощью улучшенного метода мультиплексного ПЦР-типирования. Int Dairy J.
  9. ^ Wiśniewska K, Szewczyk A, Piechowicz L, Bronk M, Samet A, wieć K. 2012. Использование спа и фагового типирования для характеристики клинических изолятов метициллин-резистентного Staphylococcus aureus в Университетском клиническом центре в Гданьске, Польша. Folia Microbiol (Прага).
  10. ^ Xu D, Zhang J, Liu J, Xu J, Zhou H, Zhang L, Zhu J, Kan B. 2014. OmpW белка внешней мембраны является рецептором для типирования фага VP5 в биотипе Vibrio cholerae O1 El Tor. J Virol.
  11. ^ Зибелл К., Чуй Л., Кинг Р., Джонсон С., Бурлин П., Джонсон Р.П. 2017. Подтипирование канадских изолятов Salmonella Enteritidis с использованием тандемного повторного анализа множественных локусов переменных чисел (MLVA) отдельно и в сочетании с гель-электрофорезом в импульсном поле (PFGE) и фаготипированием. J Microbiol Methods.