Внутренний сайт входа рибосомы пикорнавируса (IRES) - Picornavirus internal ribosome entry site (IRES) - Wikipedia

Внутренний сайт входа рибосомы пикорнавируса (IRES)
RF00229.jpg
Идентификаторы
СимволIRES_Picorna
РфамRF00229
Прочие данные
РНК типСнг; IRES
Домен (ы)Вирусы
ИДТИИДТИ: 0043022
ТАКТАК: 0000243
PDB структурыPDBe

Эта семья представляет Пикорнавирус внутренний сайт входа рибосомы (IRES) элемент присутствует в их 5'-нетранслируемой области.[1] Эти элементы были обнаружены у пикорнавирусов.[2] Они представляют собой цис-действующие последовательности РНК, которые принимают различные трехмерные структуры, задействуют механизм трансляции и часто действуют в ассоциации со специфическими РНК-связывающими белками.[2] Элементы IRES допускают независимость от крышки и конца перевод из мРНК в клетке-хозяине. Было обнаружено, что аутоантиген La (La) необходим для Coxsackievirus B3 (CVB3) IRES-опосредованная трансляция, и было высказано предположение, что La может потребоваться для эффективной трансляции вирусного РНК в поджелудочная железа.[3][4] По вторичной структуре пикорнавирусы IRES подразделяются на четыре основных типа. Тип I включает энтеро- и риновирусы IRES, а тип II, среди прочего, включает кардио- и афтовирусы. Тип III используется для обозначения IRES гепатита А.[2]

Рекомендации

  1. ^ Фернандес-Мирагалл, Ольга; Куинто, Соня Лопес де; Мартинес-Салас, Энкарнасьон (февраль 2009 г.). «Актуальность структуры РНК для активности элементов IRES пикорнавируса». Вирусные исследования. 139 (2): 172–182. Дои:10.1016 / j.virusres.2008.07.009. PMID  18692097.
  2. ^ а б c Мартинес-Салас, Энкарнасьон; Франсиско-Велилья, Росарио; Фернандес-Чаморро, Хавьер; Лозано, Глория; Диас-Толедано, Роза (август 2015 г.). «Элементы IRES пикорнавируса: структура РНК и взаимодействия белков хозяина». Вирусные исследования. 206: 62–73. Дои:10.1016 / j.virusres.2015.01.012. HDL:10261/140186. PMID  25617758.
  3. ^ Ray PS, Das S (октябрь 2002 г.). «La аутоантиген необходим для внутренней трансляции РНК вируса Коксаки В3, опосредованной сайтом входа в рибосомы». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (20): 4500–4508. Дои:10.1093 / nar / gkf583. ЧВК  137146. PMID  12384597.
  4. ^ Лю З., Карти С.М., Чунг П., Богунек Л., Уилсон Дж. Э., МакМанус Б. М., Ян Д. (декабрь 1999 г.). «Структурный и функциональный анализ 5 'нетранслируемой области РНК вируса Коксаки В3: исследования трансляции и инфекционности in vivo полноразмерных мутантов». Вирусология. 265 (2): 206–217. Дои:10.1006 / viro.1999.0048. PMID  10600593.

внешняя ссылка