Белки @ home - Proteins@home

Белки @ home («Белки дома») был одним из многих распределенных вычислений проекты, которые использовали BOINC архитектура. Проект осуществлялся кафедрой биологии г. École Polytechnique. Проект начался 28 декабря 2006 г. и завершился в июне 2008 г.

Цель

Proteins @ Home была крупной некоммерческой организацией. предсказание структуры белка проект, использующий распределенные вычисления для выполнения большого количества вычислений за небольшой промежуток времени. Со своего сайта:

Аминокислотная последовательность белка определяет его трехмерную структуру или «складку». И наоборот, трехмерная структура совместима с большим, но ограниченным набором аминокислотных последовательностей. Перечисление допустимых последовательностей для данной складки известно как «проблема обратной сворачивания белка». Мы работаем над решением этой проблемы для большого количества известных складок белка (репрезентативная подгруппа: около 1500 складок). Самый затратный шаг - создать базу данных энергетических функций, описывающих все эти структуры. Для каждой структуры мы рассматриваем все возможные последовательности аминокислот. Удивительно, но с вычислительной точки зрения это легко, потому что наши энергетические функции представляют собой суммы по парам взаимодействий. Как только это будет сделано, мы сможем быстро и эффективно исследовать пространство аминокислотных последовательностей и сохранить наиболее подходящие последовательности. Это крупномасштабное картирование пространства белковых последовательностей будет иметь приложения для прогнозирования структуры и функции белков, для понимания эволюции белков и для разработки новых белков. Присоединяясь к проекту, вы поможете создать базу данных энергетических функций и продвинуть важную область науки с потенциальными биомедицинскими приложениями.

Статистика

На 25 марта 2007 г. в Proteins @ Home активно участвовали 6040 из 9548 пользователей, в общей сложности участвовало 10405 из 15381 компьютеров. Было около 479 активных команд из 100 стран.

Смотрите также

Ряд других распределенных вычислений В идею сворачивания белков также вносят свой вклад проекты, среди которых:

внешняя ссылка