RAC: Репозиторий кассет устойчивости к антибиотикам - RAC: Repository of Antibiotic resistance Cassettes - Wikipedia
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | База данных сосредоточена на обнаружении и аннотации новых кассет генов и других мобильных элементов. |
| Типы данных захвачен | Кассеты генов и мобильные элементы |
| Организмы | Бактерии |
| Контакт | |
| Основное цитирование | PMID 22140215 |
| Доступ | |
| Интернет сайт | www2 |
| Разное | |
| Закладки сущности | да |
RAC иначе известный как рхранилище Аустойчивость к антибиотикам Cassettes - это база данных который использует автоматическую систему аннотаций Attacca для всестороннего аннотирования генные кассеты и сменные элементы упорядоченным образом и для открытия новых кассет генов.[1] Устойчивость к антибиотикам часто из-за горизонтальный перенос генов, что позволяет сопротивлению возникать за счет межклеточного взаимодействия.[2] Это представляет собой серьезную проблему в области устойчивости к антибиотикам. Следовательно, создание RAC, которое предоставит исследователям всеобъемлющий и уникальный инструмент для попытки документировать устойчивость, обусловленную кассетами генов и мобильными элементами. Attacca помогает обнаружить новые генные кассеты, когда происходят любые три из следующих событий, как указано в Цафнат и др., 2011 г.:
- эвристика обнаружения Attacca (19) идентифицирует разрыв в массиве кассет, который может соответствовать новой кассете;[1]
- обнаружена кассета, кодирующая потенциально новый вариант β-лактамазы;[1] или же
- тип представленной последовательности (например, изолированная кассета) предполагает, что кассета гена должна присутствовать, но кассета гена не обнаружена Attacca.[1]
Если произойдет какой-либо из этих случаев, кассета с геном будет отправлена на рассмотрение в Центр инфекционных болезней и микробиологии. Сиднейский университет для дальнейшего изучения.[1]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c d е Цафнат, Г .; Copty, J .; Партридж, С. Р. (2011-12-02). «RAC: Репозиторий кассет устойчивости к антибиотикам». База данных. 2011: bar054. Дои:10.1093 / база данных / bar054. ISSN 1758-0463. ЧВК 3229207. PMID 22140215.
- ^ Стокс, Хэтч В .; Жиллингс, Майкл Р. (сентябрь 2011 г.). «Поток генов, мобильные генетические элементы и набор генов устойчивости к антибиотикам в грамотрицательные патогены». Обзор микробиологии FEMS. 35 (5): 790–819. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2011.00273.x. ISSN 1574-6976. PMID 21517914.