РАЛА - RALA

РАЛА
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UAD, 1ZC3, 1ZC4, 2A78, 2А9К, 2BOV
Идентификаторы
Псевдонимы	РАЛА, RAL, RALA Ras как протоонкоген A, RAS как протоонкоген A
Внешние идентификаторы	OMIM: 179550 MGI: 1927243 ГомолоГен: 3942 Генные карты: РАЛА
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7п14.1 Начните 39,623,565 бп[1] Конец 39,708,120 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A2 | 13 6,05 см Начните 17,880,571 бп[2] Конец 17,944,239 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с рецептором лизофосфатидной кислоты Edg-2 • связывание нуклеотидов • Привязка к ВВП • связывание миозина • Связывание АТФазы • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • ГТФазная активность • связывание убиквитин-протеин-лигазы Сотовый компонент • мембрана • очаговая адгезия • миелин • клеточная мембрана • эндоцитарный пузырек • борозда декольте • внеклеточная экзосома • мембрана цитоплазматических везикул • поверхность клетки • Тело Флемминга • внутриклеточный Биологический процесс • реорганизация актинового цитоскелета • деление клеток • регуляция экзоцитоза • хемотаксис • закрытие нервной трубки • локализация мембранного рафта • клеточный цикл • мембранная организация • GO: 0022415 вирусный процесс • положительное регулирование сборки филоподия • преобразование сигнала • экзоцитоз • Передача сигнала белка Ras • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5898	56044
Ансамбль	ENSG00000006451	ENSMUSG00000008859
UniProt	P11233	P63321
RefSeq (мРНК)	NM_005402	NM_019491
RefSeq (белок)	NP_005393	NP_062364
Расположение (UCSC)	Chr 7: 39,62 - 39,71 Мб	Chr 13: 17,88 - 17,94 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Родственный Ras белок Ral-A (RalA) это белок что у людей кодируется РАЛА ген на хромосоме 7.^[5][6] Этот белок - один из двух паралоги белка Ral, другой RalB, и часть Рас GTPase семья.^[7] RalA функционирует как молекулярный переключатель, активирующий ряд биологических процессов, в основном клеточное деление и транспорт, через сигнальные пути.^[7][8][9] Его биологическая роль, таким образом, подразумевает его участие во многих раки.^[9]

Структура

Изоформы Ral имеют 80% -ное совпадение по аминокислотной последовательности и 100% -ное совпадение в их эффекторной связывающей области. Две изоформы в основном различаются С-концевой гипервариабельной областью, которая содержит множество сайтов для посттрансляционной модификации, приводящей к диверсификации субклеточной локализации и биологической функции. Например, фосфорилирование серина 194 на RalA киназа Aurora A приводит к перемещению RalA на внутренняя митохондриальная мембрана, где RalA помогает проводить деление митохондрий; тогда как фосфорилирование серина 198 на RalB киназой PKC приводит к перемещению RalB на другие внутренние мембраны и активации его онкогенной функции.^[9]

Функция

RalA является одним из двух белков в семействе Ral, которое само по себе является подсемейством в семействе Ras малых GTPases.^[7] Как Ras GTPase, RalA функционирует как молекулярный переключатель, который становится активным при связывании с GTP и неактивным при связывании с GDP. RalA может активироваться RalGEF и, в свою очередь, активировать эффекторы в путях передачи сигнала, приводя к биологическим результатам.^[7][8] Например, RalA взаимодействует с двумя компонентами экзоциста, Exo84 и Sec5, продвигать аутофагосома сборка, перемещение секреторных пузырьков и связывание. Другие последующие функции включают экзоцитоз, рецептор-опосредованного эндоцитоза, плотные контакты биогенез, филоподии образование, деление митохондрий и цитокинез.^[7][9][10] Ral-опосредованный экзоцитоз также вовлечен в такие биологические процессы, как тромбоцит активация, функции иммунных клеток, нейрональные пластичность, и регулирование инсулин действие.^[11]

Хотя вышеуказанные функции, по-видимому, являются общими для двух изоформ Ral, их различная субклеточная локализация приводит к их различному участию в определенных биологических процессах. В частности, RalA более вовлечен в независимый от закрепления рост клеток, перенос пузырьков и организацию цитоскелета.^[8][12] Более того, RalA специфически взаимодействует с Exo84 и Sec5, чтобы регулировать транспорт мембранных белков в поляризованных эпителиальных клетках и GLUT4 к плазматической мембране, а также делению митохондрий для деления клеток.^[7]

Клиническое значение

Белки Ral были связаны с прогрессированием нескольких видов рака, включая рак мочевого пузыря и рак простаты.^[9] Хотя точные механизмы остаются неясными, исследования показывают, что RalA способствует независимому от закрепления росту раковых клеток.^[8] В результате ингибирование RalA подавляет начало рака.^[9]

Из-за его экзоцитотической роли в тромбоцитах, иммунных клетках, нейронах и регуляции инсулина подавление Ral может привести к патологический такие условия как тромбоз и метаболический синдром. При хронической тромбоэмболии легочная гипертензия Было обнаружено, что у пациентов с Ral GTPases высокая активность в их тромбоцитах.^[11]

Взаимодействия

RalA был показан взаимодействовать с участием:

• EXOC8,^[7]
• Филамин,^[13]
• PLD1,^[14][15]
• Sec5,^[7][9] и
• RALBP1.^{[16][17][18][19]}

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006451 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000008859 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Руссо-Мерк М.Ф., Бернхейм А., Шарден П., Мильерина Р., Тавитиан А., Бергер Р. (июнь 1988 г.). «Связанный с ras ген ral отображается на хромосоме 7p15-22». Генетика человека. 79 (2): 132–6. Дои:10.1007 / BF00280551. PMID  3292391. S2CID  24522661.
6. «Ген Entrez: гомолог A вирусного онкогена обезьяньего лейкоза RALA v-ra (родственный ras)».
7. Симичек М., Ливенс С., Лага М., Гузенко Д., Аушев В.Н., Калев П., Байетти М.Ф., Стрелков С.В., Геверт К., Тавернье Дж., Саблина А.А. (октябрь 2013 г.). «Деубиквитилаза USP33 различает функции RALB в аутофагии и врожденном иммунном ответе». Природа клеточной биологии. 15 (10): 1220–30. Дои:10.1038 / ncb2847. PMID  24056301. S2CID  205287526.
8. Tecleab A, Zhang X, Sebti SM (ноябрь 2014 г.). «Снижение регуляции ГТФазы Ral стабилизирует и реактивирует р53, подавляя злокачественную трансформацию». Журнал биологической химии. 289 (45): 31296–309. Дои:10.1074 / jbc.M114.565796. ЧВК  4223330. PMID  25210032.
9. Kashatus DF (сентябрь 2013 г.). «Ral GTPases в онкогенезе: выходят из тени». Экспериментальные исследования клеток. 319 (15): 2337–42. Дои:10.1016 / j.yexcr.2013.06.020. ЧВК  4270277. PMID  23830877.
10. Hazelett CC, Sheff D, Yeaman C (декабрь 2011 г.). «RalA и RalB по-разному регулируют развитие плотных контактов эпителия». Молекулярная биология клетки. 22 (24): 4787–800. Дои:10.1091 / mbc.E11-07-0657. ЧВК  3237622. PMID  22013078.
11. Сиракава Р., Хориучи Х. (май 2015 г.). «Ral GTPases: важнейшие медиаторы экзоцитоза и онкогенеза». Журнал биохимии. 157 (5): 285–99. Дои:10.1093 / jb / mvv029. PMID  25796063.
12. Jeon H, Zheng LT, Lee S, Lee WH, Park N, Park JY, Heo WD, Lee MS, Suk K (август 2011). «Сравнительный анализ роли малых G белков в миграции и гибели клеток: цитопротекторные и промиграционные эффекты RalA». Экспериментальные исследования клеток. 317 (14): 2007–18. Дои:10.1016 / j.yexcr.2011.05.021. PMID  21645515.
13. Ohta Y, Suzuki N, Nakamura S, Hartwig JH, Stossel TP (март 1999 г.). «Малая GTPase RalA нацелена на филамин, чтобы вызвать филоподии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (5): 2122–8. Дои:10.1073 / pnas.96.5.2122. ЧВК  26747. PMID  10051605.
14. Луо Дж. К., Лю Х, Хаммонд С. М., Колли В. К., Фейг Л. А., Фроман М. А., Моррис А. Дж., Фостер Д. А. (июнь 1997 г.). «RalA непосредственно взаимодействует с Arf-зависимой, PIP2-зависимой фосфолипазой D1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 235 (3): 854–9. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6793. PMID  9207251.
15. Kim JH, Lee SD, Han JM, Lee TG, Kim Y, Park JB, Lambeth JD, Suh PG, Ryu SH (июль 1998 г.). «Активация фосфолипазы D1 прямым взаимодействием с фактором АДФ-рибозилирования 1 и RalA». Письма FEBS. 430 (3): 231–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00661-9. PMID  9688545. S2CID  36075513.
16. Москаленко С., Тонг С., Росс С., Мирей Г., Формстчер Е., Давиет Л., Камонис Дж., Уайт М.А. (декабрь 2003 г.). «ГТФазы Ral регулируют сборку экзоцист посредством взаимодействий двойных субъединиц». Журнал биологической химии. 278 (51): 51743–8. Дои:10.1074 / jbc.M308702200. PMID  14525976.
17. Жюльен-Флорес В., Дорсей О., Ромеро Ф., Летурнер Ф., Сарагости С., Бергер Р., Тавитиан А., Гакон Дж., Камонис Дж. Х. (сентябрь 1995 г.). «Связывание GTPase Ral с путями Rho. RLIP76, эффектор Ral с активностью белка, активирующего CDC42 / Rac GTPase». Журнал биологической химии. 270 (38): 22473–7. Дои:10.1074 / jbc.270.38.22473. PMID  7673236.
18. Кантор С.Б., Урано Т., Фейг Л.А. (август 1995 г.). «Идентификация и характеристика Ral-связывающего белка 1, потенциальной нижестоящей мишени Ral GTPases». Молекулярная и клеточная биология. 15 (8): 4578–84. Дои:10.1128 / mcb.15.8.4578. ЧВК  230698. PMID  7623849.
19. Икеда М., Исида О, Хинои Т., Кишида С., Кикучи А. (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика нового белка, взаимодействующего с Ral-связывающим белком 1, предполагаемым эффекторным белком Ral». Журнал биологической химии. 273 (2): 814–21. Дои:10.1074 / jbc.273.2.814. PMID  9422736.

дальнейшее чтение

• Кинселла Б.Т., Эрдман Р.А., Мальтийский штат Вашингтон (май 1991 г.). «Карбоксиконцевое изопренилирование ras-связанных GTP-связывающих белков, кодируемых rac1, rac2 и ralA». Журнал биологической химии. 266 (15): 9786–94. PMID  1903399.
• Полакис П.Г., Вебер Р.Ф., Невинс Б., Дидсбери Дж. Р., Эванс Т., Снайдерман Р. (октябрь 1989 г.). «Идентификация продуктов генов ral и rac1, низкомолекулярных GTP-связывающих белков из тромбоцитов человека». Журнал биологической химии. 264 (28): 16383–9. PMID  2550440.
• Шарден П., Тавитян А. (июнь 1989 г.). «Кодирующие последовательности кДНК человеческого ralA и ralB». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (11): 4380. Дои:10.1093 / nar / 17.11.4380. ЧВК  317954. PMID  2662142.
• Кантор С.Б., Урано Т., Фейг Л.А. (август 1995 г.). «Идентификация и характеристика Ral-связывающего белка 1, потенциальной нижестоящей мишени Ral GTPases». Молекулярная и клеточная биология. 15 (8): 4578–84. Дои:10.1128 / mcb.15.8.4578. ЧВК  230698. PMID  7623849.
• Жюльен-Флорес В., Дорсей О., Ромеро Ф., Летурнер Ф., Сарагости С., Бергер Р., Тавитиан А., Гакон Дж., Камонис Дж. Х. (сентябрь 1995 г.). «Связывание GTPase Ral с путями Rho. RLIP76, эффектор Ral с активностью белка, активирующего CDC42 / Rac GTPase». Журнал биологической химии. 270 (38): 22473–7. Дои:10.1074 / jbc.270.38.22473. PMID  7673236.
• Ван К.Л., Хан М.Т., Руфогалис Б.Д. (июнь 1997 г.). «Идентификация и характеристика кальмодулин-связывающего домена в Ral-A, Ras-родственном GTP-связывающем белке, очищенном от мембраны эритроцитов человека». Журнал биологической химии. 272 (25): 16002–9. Дои:10.1074 / jbc.272.25.16002. PMID  9188503.
• Луо Дж.К., Лю Х, Хаммонд С.М., Колли В.К., Фейг Л.А., Фроман М.А., Моррис А.Дж., Фостер Д.А. (июнь 1997 г.). «RalA непосредственно взаимодействует с Arf-зависимой, PIP2-зависимой фосфолипазой D1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 235 (3): 854–9. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6793. PMID  9207251.
• Икеда М., Исида О, Хинои Т., Кишида С., Кикучи А. (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика нового белка, взаимодействующего с Ral-связывающим белком 1, предполагаемым эффекторным белком Ral». Журнал биологической химии. 273 (2): 814–21. Дои:10.1074 / jbc.273.2.814. PMID  9422736.
• Ваввас Д., Ли Х, Авруч Дж, Чжан ХФ (март 1998 г.). «Идентификация Nore1 как потенциального эффектора Ras». Журнал биологической химии. 273 (10): 5439–42. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5439. PMID  9488663.
• Kim JH, Lee SD, Han JM, Lee TG, Kim Y, Park JB, Lambeth JD, Suh PG, Ryu SH (июль 1998 г.). «Активация фосфолипазы D1 прямым взаимодействием с фактором АДФ-рибозилирования 1 и RalA». Письма FEBS. 430 (3): 231–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00661-9. PMID  9688545. S2CID  36075513.
• Ohta Y, Suzuki N, Nakamura S, Hartwig JH, Stossel TP (март 1999 г.). «Малая GTPase RalA нацелена на филамин, чтобы вызвать филоподии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (5): 2122–8. Дои:10.1073 / pnas.96.5.2122. ЧВК  26747. PMID  10051605.
• Ван К.Л., Руфогалис Б.Д. (май 1999 г.). «Ca2 + / кальмодулин стимулирует связывание GTP с ras-родственным белком ral-A». Журнал биологической химии. 274 (21): 14525–8. Дои:10.1074 / jbc.274.21.14525. PMID  10329639.
• Судзуки Дж., Ямадзаки Ю., Ли Джи, Казиро Ю., Коиде Х., Гуан Л. (июль 2000 г.). «Участие Ras и Ral в хемотаксической миграции скелетных миобластов». Молекулярная и клеточная биология. 20 (13): 4658–65. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4658-4665.2000. ЧВК  85875. PMID  10848592.
• de Bruyn KM, de Rooij J, Wolthuis RM, Rehmann H, Wesenbeek J, Cool RH, Wittinghofer AH, Bos JL (сентябрь 2000 г.). «RalGEF2, домен гомологии плекстрина, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов на Ral». Журнал биологической химии. 275 (38): 29761–6. Дои:10.1074 / jbc.M001160200. PMID  10889189.
• Бримора А., Валова В.А., Ларсен М.Р., Руфогалис Б.Д., Робинсон П.Дж. (август 2001 г.). «Комплекс экзоцисты мозга взаимодействует с RalA GTP-зависимым образом: идентификация нового гена Sec3 млекопитающих и второго гена Sec15». Журнал биологической химии. 276 (32): 29792–7. Дои:10.1074 / jbc.C100320200. PMID  11406615.
• Сугихара К., Асано С., Танака К., Ивамацу А., Окава К., Охта И. (январь 2002 г.). «Комплекс экзоцисты связывает малую GTPase RalA, чтобы опосредовать образование филоподий». Природа клеточной биологии. 4 (1): 73–8. Дои:10.1038 / ncb720. PMID  11744922. S2CID  9528945.
• Клаф Р.Р., Сидху Р.С., Бхуллар Р.П. (август 2002 г.). «Кальмодулин связывает RalA и RalB и необходим для индуцированной тромбином активации Ral в тромбоцитах человека». Журнал биологической химии. 277 (32): 28972–80. Дои:10.1074 / jbc.M201504200. PMID  12034722.
• Сюй Л., Франкель П., Джексон Д., Ротонда Т., Бошанс Р. Л., Д'Суза-Шори С., Фостер Д.А. (январь 2003 г.). «Повышенная активность фосфолипазы D в H-Ras-, но не K-Ras-трансформированных клетках за счет синергетического действия RalA и ARF6». Молекулярная и клеточная биология. 23 (2): 645–54. Дои:10.1128 / MCB.23.2.645-654.2003. ЧВК  151535. PMID  12509462.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P11233 (Ras-родственный белок Ral-A) на PDBe-KB.