Secoviridae - Secoviridae

Secoviridae
CowpeaMosaicVirus3D.png
Структура Вирус мозаики коровьего гороха на базе ПДБ 2БФУ
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Пикорнавиралес
Семья:Secoviridae
Роды

Подсемейство: Comovirinae

Secoviridae это семья вирусы в порядке Пикорнавиралес. Растения служат естественными хозяевами. В настоящее время это семейство насчитывает 86 видов, разделенных на 8 родов или не отнесенных к роду.[1][2][3][4] Семья была создана в 2009 году путем объединения семей. Sequiviridae, теперь распущены, и Comoviridae, теперь подсемейство Comovirinaeвместе с неназначенными тогда родами Черавирус, Sadwavirus, и Торрадовирус.[4]

Структура

Вирусы в Secoviridae без оболочки, с геометрией икосаэдра и T = псевдо3-симметрией. Диаметр около 25-30 нм. Геномы бывают линейными и сегментированными, двудольными, длиной около 24-7 килобайт.[1][2][3]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
СеквивирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный
SadwavirusИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
НеповирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
FabavirusИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
КомовирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
ЧеравирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
ТоррадовирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйСегментированный
WaikavirusИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вхождение в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяин за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи механические.[1][2][3]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
СеквивирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханическая инокуляция: тля; Механическая инокуляция: Cavariella aegopodii; Механический посев: Cavariella pastinacae
SadwavirusРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаНематоды; клещи; трипсы
НеповирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаНематоды; клещи; трипсы
FabavirusРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханическая инокуляция: тля
КомовирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханическая инокуляция: жуки
ЧеравирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаНематоды; клещи; трипсы
ТоррадовирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный
WaikavirusЗлаковыеФлоэма; паренхима флоэмы; связка ноженВирусное движениеВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханическое поражение: тля; механическая защита: цикадки

Таксономия

Группа: оцРНК (+)

[1][2]

Эволюция

Подсемейство Comovirinae возникли около 1000 лет назад, а существующие виды разнообразились между 50 и 250 годами назад.[5] Этот период времени совпадает с интенсификацией сельскохозяйственных практик в индустриальных обществах.

Частота мутаций оценивается в 9,29 × 10−3 до 2,74 × 10−3 подписки / сайт / год.

Рекомендации

  1. ^ а б c d Томпсон, младший; Дасгупта, я; Fuchs, M; Iwanami, T; Карасев, А.В.; Петрзик, К; Sanfaçon, H; Цанетакис, я; van der Vlugt, R; Ветцель, Т; Йошикава, Н. Консорциум отчетов ICTV (апрель 2017 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Secoviridae". Журнал общей вирусологии. 98 (4): 529–531. Дои:10.1099 / jgv.0.000779. ЧВК  5657025. PMID  28452295.
  2. ^ а б c d "Secoviridae". Отчет ICTV Online (10).
  3. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  4. ^ а б «Таксономия». Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 25 марта 2020.
  5. ^ Томпсон, младший; Камат, N; Перри, KL (2014). «Эволюционный анализ семейства вирусов secoviridae». PLOS ONE. 9 (9): e106305. Дои:10.1371 / journal.pone.0106305. ЧВК  4152289. PMID  25180860.

внешняя ссылка