Семейство белков грибов - Shroom protein family

ASD1
Идентификаторы
СимволASD1
PfamPF08688
ИнтерПроIPR014800
ASD2
Идентификаторы
СимволASD2
PfamPF08687
ИнтерПроIPR014799

В молекулярной биологии Семейство белков грибов это небольшая группа связанных белки которые определены последовательность сходство и в большинстве случаев некоторая связь с актиновым цитоскелетом. Гриб (Шрм) белковая семья находится только в животные. Белки этого семейства, как предполагается, будут использоваться во множестве морфогенных процессов и процессов развития у животных. тип регулировать клетки форма или внутриклеточный архитектура актиновым и миозин-зависимым образом.[1] Хотя членом-основателем семейства Shrm является Shrm1 (ранее Apx), похоже, что этот белок встречается только в Xenopus.[2] В мышей и люди, Shrm семейство белков состоит из:

Это семейство белков основано на сохранение специфического расположения N-концевого домена PDZ, центрально расположенного мотив последовательности названный ASD1 (Apx / Shrm Domain 1) и C-концевой мотив названный ASD2.[1][2][3] Shrm2 и Shrm3 содержат все три домена, тогда как Shrm4 содержит домены PDZ и ASD2, но не имеет различимого элемента ASD1. На сегодняшний день элементы ASD1 и ASD2 были обнаружены только в связанных с Shrm белки и не появляются в сочетании с другими консервированный домены. ASD1 необходим для нацеливания на актин, тогда как ASD2 способен вызывать актомиозин событие сужения на основе.[1][2] ASD2 - самый очень консервативный последовательность элемент, общий для Shrm1, Shrm2, Shrm3 и Shrm4. Имеет колодец консервированный серия лейцин остатки, которые имеют интервалы, соответствующие таковому у лейциновая молния мотив.[1]

Shroom2 необходим и достаточен для управления локализацией пигментных гранул в апикальный поверхность эпителиальные клетки. Shroom2 - центральный регулятор пигментации РПЭ. Несмотря на их разнообразные биологический ролей, белки семейства Shroom разделяют общую активность. Поскольку локус кодирование человек SHROOM2 находится в критической области для двух различных форм глазного альбинизма, возможно, что SHROOM2 мутации может способствовать расстройствам зрительной системы человека.[4]

Рекомендации

  1. ^ а б c d Dietz ML, Bernaciak TM, Vendetti F, Kielec JM, Hildebrand JD (июль 2006 г.). «Дифференциальная актин-зависимая локализация модулирует эволюционно консервативную активность белков семейства Shroom». J. Biol. Chem. 281 (29): 20542–54. Дои:10.1074 / jbc.M512463200. PMID  16684770.
  2. ^ а б c Йодер М., Хильдебранд Дж. Д. (январь 2007 г.). «Shroom4 (Kiaa1202) представляет собой связанный с актином белок, участвующий в организации цитоскелета». Cell Motil. Цитоскелет. 64 (1): 49–63. CiteSeerX  10.1.1.521.7263. Дои:10.1002 / см. 20167. PMID  17009331.
  3. ^ Хильдебранд Дж. Д., Сориано П. (ноябрь 1999 г.). «Shroom, актин-связывающий белок, содержащий PDZ-домен, необходим для морфогенеза нервной трубки у мышей». Клетка. 99 (5): 485–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81537-8. PMID  10589677. S2CID  17185521.
  4. ^ Fairbank PD, Lee C, Ellis A, Hildebrand JD, Gross JM, Wallingford JB (октябрь 2006 г.). «Shroom2 (APXL) регулирует биогенез меланосом и локализацию в пигментном эпителии сетчатки». Разработка. 133 (20): 4109–18. Дои:10.1242 / dev.02563. PMID  16987870.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR014799