Набор инструментов для спинного мозга - Spinal Cord Toolbox
Набор инструментов для спинного мозга (SCT) [1] это набор инструментов анализа, оптимизированный для спинной мозг изображения, полученные с помощью магнитно-резонансная томография. Основные функции включают сегментацию, регистрацию и расчет анатомических показателей.
Функции
- Propseg Автоматическая сегментация спинного мозга.[2]
- В Шаблон PAM50 представляет собой анатомический шаблон спинного мозга, который полностью покрывает спинной мозг и ствол мозга и доступен для МРТ-контрастов, взвешенных по T1, T2 и T2 *. Шаблон PAM50 включает вероятностную сегментацию белого вещества, серого вещества, CSF, а также вероятностные атласы подобластей серого вещества и путей распространения белого вещества.[3][4] Шаблон также включает сегментацию позвоночника для автоматической оценки показателей в определенных местах.[5]
- А Атлас белого вещества в том числе 29 масок частичного объема, из которых участки материи.[6]
Рекомендации
- ^ Де Леенер Б., Леви С., Дюпон С.М., Фонов В.С., Стиков Н., Луи Коллинз Д. и др. SCT: Spinal Cord Toolbox, программное обеспечение с открытым исходным кодом для обработки данных МРТ спинного мозга. Нейроизображение. 2017; 145: 24–43. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2016.10.009
- ^ Де Линер Б., Коэн-Адад Дж., Кадури С. Автоматическая сегментация спинного мозга и спинномозгового канала в сочетании с маркировкой позвонков. Медицинская визуализация, IEEE Transactions on (в печати). DOI: 10.1109 / TMI.2015.2437192
- ^ Fonov V, Le Troter A, Taso M, De Leener B, Leveque G, Benhamou M, Sdika M, Benali H, Pradat PF, Collins DL, Callot V, Cohen-Adad J. Рамки интегрированного среднего значения МРТ белого спинного мозга и серое вещество: шаблон MNI-Poly-AMU. Neuroimage 2014. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2014.08.057
- ^ Де Линер Б., Фонов В., Коллинз Д.Л., Калло В., Стиков Н., Коэн-Адад Дж. PAM50: Мультимодальный шаблон ствола головного и спинного мозга, совместимый с пространством ICBM152. Материалы 25-го ежегодного собрания ISMRM, Гонолулу, США. 2017 г.
- ^ Cadotte DW, Cadotte A, Cohen-Adad J, Fleet D, Livne M, Mikulis D, Fehlings MG. Устранение анатомической изменчивости шейного отдела спинного мозга человека: решение для облегчения расширенной нейронной визуализации. Материалы 22-го ежегодного собрания ISMRM, Милан, Италия, 2014: 1719.
- ^ Леви С., Бенхаму М., Нааман С., Рейнвилл П., Калло В., Коэн-Адад Дж. Атлас белого вещества спинного мозга человека с оценкой эффекта частичного объема. Нейроизображение. 2015; 119: 262–271. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.040
