Переносной домен, связанный со StAR - StAR-related transfer domain - Wikipedia

НАЧНИТЕ
PDB 1em2 EBI.jpg
звездчатый липидный транспортный домен mln64
Идентификаторы
СимволНАЧНИТЕ
PfamPF01852
Pfam кланCL0209
ИнтерПроIPR002913
УМНАЯНАЧНИТЕ
SCOP21em2 / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство138
Белок OPM1ln1
Мембранома564
START домен
Идентификаторы
СимволНАЧНИТЕ
PfamPF01852
ИнтерПроIPR002913
УМНАЯНАЧНИТЕ
SCOP21em2 / Объем / СУПФАМ
TCDB9.B.64
CDDcd00177

НАЧНИТЕ (Связанный со StAR перенос липидов) представляет собой липид-связывающий домен в StAR, HD-ZIP и сигнальных белках.[1] Архетипический домен находится в StAR (Стероидогенный белок острой регуляции ), митохондриальный белок, который синтезируется в стероидный препарат -продуцирующие клетки.[2] StAR инициирует производство стероидов, опосредуя доставку холестерина к первому ферменту стероидогенного пути. Домен START имеет решающее значение для этой активности, возможно, через связывание холестерина. После открытия StAR 15 белков, содержащих СТАРТ-домен (обозначенных от STARD1 до STARD15), были впоследствии идентифицированы в позвоночные а также другие связанные.

Тысячи белков, содержащих хотя бы один START-домен, были определены в беспозвоночные, бактерии и растения чтобы сформировать более крупное суперсемейство, известное как START, Ставка v1 -like или SRPBCC (START / RHOalphaC /PITP / Bet v1 / CoxG / CalC) белки домена, все из которых связывают гидрофобные лиганды. В случае растений многие белки START попадают в категорию предполагаемых факторов транскрипции липид / стерол-связывающего гомеодомена (HD) или белков HD-START.[3]

Представители доменного семейства START связывают разные вещества или лиганды Такие как стеролы (например, StAR или STARD1) и липиды, такие как фосфатидилхолин (белок-переносчик фосфатидилхолина, также называемый PCTP или STARD2) и обладают ферментативной активностью. Связывание лиганда доменом START в многодоменных белках также может регулировать активность других доменов, таких как RhoGAP домен, то гомеодомен и тиоэстераза домен.[1][4]

Структура

Кристаллическая структура домена START человека MLN64 показывает альфа / бета складку, построенную вокруг U-образного неполного бета-ствола. Наиболее важно то, что внутренняя часть белка включает гидрофобный туннель размером 26 × 12 × 11 ангстрем, который, по-видимому, достаточно велик, чтобы связывать единственную молекулу холестерина.[5] Структура домена START обнаружила неожиданное сходство с таковой у аллергена пыльцы березы Bet v 1 и с бактериальной пыльцой. поликетид циклазы / ароматазы.[4][5]

Белки человека, содержащие домен START

Белки, содержащие домен START, у человека делятся на пять подсемейств. Исключение составляет StarD9, активность которого остается неизвестной. Другие белки также существуют у человека с доменами, которые являются членами суперсемейства на основе START, такими как PITP, но не являются частью самого домена START.

Мутации в STAR D9 (KIF16A ) были связаны с синдромом, который включает тяжелую ID, характерные особенности, эпилепсию, приобретенную микроцефалию и слепоту.[6] Ген STAR D9 кодирует аминокислотный белок 4,7 кДальтон, который является членом кинезин надсемейство. Укороченные на С-конце мутанты STAR D9, как известно из экспериментальных работ, вызывают дефекты сборки веретена. В описанном случае были обнаружены несколько митотических дефектов, включая формирование мультиполярного веретена, фрагментацию перицентриолярных материалов и амплификацию центросом.

Подсемейство StarD1 / D3, связывающее холестерин / оксистерин

Эти белки в первую очередь связаны с транспортом холестерина.

ЗВЕЗДА (STARD1)
MLN64 (STARD3 )

Подсемейство StarD4

Эти белки участвуют в транспорте холестерина и оксистерина.

STARD4
STARD5
STARD6

Подсемейство StarD2, связывающее фосфолипиды / сфинголипиды

Белок-переносчик фосфатидилхолина (PCTP / STARD2)
STARD7
STARD10
Альфа-3-связывающий белок коллагена IV типа (COL4A3BP / белок-переносчик церамидов (CERT) / STARD11)

Подсемейство SAM-RhoGAP-START

Эти белки содержат как домен START, так и сигнальную активность Rho-GTPase.

STARD8 (DLC-3)
DLC1 (STARD12)
STARD13 (DLC-2)

Подсемейство ацил-КоА тиоэстераз

Члены этого подсемейства обладают СТАРТ-доменом и тиоэстеразной активностью.

ACOT11 (STARD14)
ACOT12 (STARD15)

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Понтинг CP, Аравинд Л. (1999). «START: липид-связывающий домен в StAR, HD-ZIP и сигнальных белках». Trends Biochem. Наука. 24 (4): 130–132. Дои:10.1016 / S0968-0004 (99) 01362-6. PMID  10322415.
  2. ^ Кларк Б.Дж., Уэллс Дж., Король С.Р., Stocco DM (1994). «Очистка, клонирование и экспрессия нового митохондриального белка, индуцированного лютеинизирующим гормоном, в опухолевых клетках мышей Лейдига MA-10. Характеристика стероидогенного острого регуляторного белка (StAR)». J. Biol. Chem. 269 (45): 28314–28322. PMID  7961770.
  3. ^ Шрик К., Нгуен Д., Карловски В.М., Майер К.Ф. (2004). «Липид / стеролсвязывающие домены START амплифицируются в растениях и преимущественно связаны с факторами транскрипции гомеодомена». Геном Биол. 5 (6): R41. Дои:10.1186 / gb-2004-5-6-r41. ЧВК  463074. PMID  15186492.
  4. ^ а б Кунин Э.В., Аравинд Л., Айер Л.М. (2001). «Адаптация складки спирального захвата для связывания лиганда и катализа в суперсемействе домена START». Белки. 43 (2): 134–144. Дои:10.1002 / 1097-0134 (20010501) 43: 2 <134 :: AID-PROT1025> 3.0.CO; 2-I. PMID  11276083.
  5. ^ а б Херли JH, Tsujishita Y (2000). «Структура и механизм транспорта липидов в StAR-родственном домене». Nat. Struct. Биол. 7 (5): 408–414. Дои:10.1038/75192. PMID  10802740. S2CID  10806665.
  6. ^ Okamoto N, Tsuchiya Y, Miya F, Tsunoda T, Yamashita K, Boroevich KA, Kato M, Saitoh S, Yamasaki M, Kanemura Y, Kosaki K, Kitagawa D (2017) Новый генетический синдром с мутацией STARD9 и аномальной морфологией веретена. Am J Med Genet
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR002913