Streptomycetaceae - Streptomycetaceae

Streptomycetaceae
Streptomyces sp 01.png
Слайд-культура Streptomyces виды
Научная классификация
Королевство:
Тип:
Класс:
Актинобактерии
Порядок:
Подотряд:
Streptomycineae

Рейни и другие. 1997
Семья:
Streptomycetaceae

Ваксман и Хенрици, 1943 г.
Роды[требуется проверка ]

Китасатоспора
Streptomyces
Streptoverticillium

В Streptomycetaceae площадь семья из Актинобактерии, до монотипный подотряд Streptomycineae. Он включает важный род Streptomyces. Это был первоисточник многих антибиотики, а именно стрептомицин, первый антибиотик против туберкулез.

Геномика

Выравнивание последовательностей актинобактериальный геномов привели к идентификации трех сохраненные индели подписи которые уникальны для отряда Streptomycetales. Фермент PBGD содержит вставку из четырех аминокислот, которая присутствует во всех Streptomyces виды и Китасатоспора щетинки, но не другие актинобактерии. Точно так же вставка из одной аминокислоты присутствует в консервативной области аденилаткиназа и встречается во всех Streptomyces виды и К. щетинки, но не обнаружен ни в каких других актинобактериях. Также были идентифицированы пять консервативных сигнатурных белков, которые присутствуют в различных секвенированных Streptomyces видов, но не в К. щетинки; однако, поскольку полный геном К. щетинки еще не секвенировано, эти белки могут присутствовать в К. щетинки. Кроме того, было идентифицировано 11 консервативных сигнатурных белков, которые обнаруживаются во всех секвенированных Streptomyces виды и К. щетинки. Считается, что эти белки уникальны для отряда Streptomycetales, поэтому обеспечивают молекулярные маркеры которые можно использовать, чтобы отличить эту группу от остальных актинобактерий. Филогенетические деревья указывают на то, что порядок Catenulisporales тесно связан с отрядом Streptomycetales. Этот вывод подтверждается консервативной сигнатурой indel, состоящей из одной аминокислоты, которая уникально обнаруживается у всех видов Streptomycetales и Catenulisporales acidiphilia, единственный вид Catenulisporales, чей полный геном секвенирован. Кроме того, были идентифицированы три консервативных сигнатурных белка, которые обнаруживаются у всех видов Streptomycetales и C. acidiphilia. И консервативные сигнатуры indel, и консервативные сигнатурные белки подтверждают, что отряды Streptomycetales и Catenulisporales тесно связаны.[1]

использованная литература

  1. ^ Gao, B .; Гупта, Р. С. (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для основных кладов филума актинобактерий». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 76 (1): 66–112. Дои:10.1128 / MMBR.05011-11. ЧВК  3294427. PMID  22390973.

внешние ссылки