Подавление субтрактивной гибридизации - Suppression subtractive hybridization - Wikipedia

Субтрактивная гибридизация это технология, которая позволяет На основе ПЦР усиление только кДНК фрагменты, различающиеся между контрольным (драйвером) и экспериментальным транскриптом. кДНК производится из мРНК. Выделены различия в относительном количестве транскриптов, а также генетические различия между видами. Этот метод основан на удалении дцДНК, образованной в результате гибридизации между контрольным и тестовым образцами, таким образом устраняя кДНК или гДНК сходного количества и сохраняющие дифференциально экспрессируемые или вариабельные по последовательности транскрипты или геномные последовательности.

Подавляющая субтрактивная гибридизация также успешно использовалась для идентификации штаммов или видоспецифичных последовательностей ДНК в различных бактериях, включая Вибрион разновидность (Метагеномика ).

Смотрите также

• Анализ представительных различий

внешняя ссылка

• Обзор на evrogen.com
• Munir, S .; Singh, S .; Kaur, K .; Капур, В. (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация в сочетании с анализом микрочипов для изучения дифференциальной экспрессии генов в инфицированных вирусом клетках». Биологические процедуры онлайн. 6: 94–104. Дои:10,1251 / bpo77. ЧВК  420231. PMID  15181476.
• Дьяченко, Л. (1996). «Подавляющая субтрактивная гибридизация: метод создания дифференциально регулируемых или тканеспецифичных зондов и библиотек кДНК». Труды Национальной академии наук. 93 (12): 6025–6030. Дои:10.1073 / пнас.93.12.6025. ЧВК  39182. PMID  8650213.
• Гэлбрейт, Э. А .; Антонопулос, Д. А .; Уайт, Б.А. (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация как инструмент для определения генетического разнообразия в метагеноме окружающей среды: рубец как модель». Экологическая микробиология. 6 (9): 928–937. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2004.00575.x. PMID  15305918.