Синэкспрессия - Synexpression

Синэкспрессия это тип неслучайных эукариотический ген организация. Гены в группе синэкспрессии могут не быть физически сцепленными, но они вовлечены в один и тот же процесс и координированно экспрессируются. Ожидается, что гены, которые функционируют в одном процессе, регулируются координированно. Группы синэкспрессии, в частности, представляют собой гены, которые одновременно подвергаются повышающей или понижающей регуляции, часто потому, что их генные продукты необходимы в стехиометрический суммы или белок -сложные субъединицы.[1] Вполне вероятно, что эти генные группы имеют общие СНГ- и транс-действующие элементы управления для достижения координатного выражения.

Группы синэкспрессии определяются в основном путем анализа профилей экспрессии, составленных с использованием ДНК-микрочипы.[1] Использование этой технологии помогает исследователям отслеживать изменения в паттернах экспрессии большого количества генов в конкретном эксперименте. Анализ профилей экспрессии микрочипов ДНК привел к открытию ряда генов, которые тесно ко-регулируются.[1]

Идентификация

Идентификация групп синэкспрессии повлияла на взгляд некоторых ученых на эволюционные изменения у высших эукариот.[1] Поскольку группы генов, участвующих в одном и том же биологическом процессе, часто имеют один или несколько общих элементов управления, было высказано предположение, что дифференциальная экспрессия этих групп синэкспрессии в разных тканях организмов может способствовать совместной эволюции тканей, органов и придатков.[1] Сегодня принято считать, что эволюционируют не сами генные продукты, а управляющие сети для групп генов, которые вносят наибольший вклад в эволюцию высших эукариот.[1]

Разработка

Процессы развития представляют собой пример того, как изменения в сетях контроля синэкспрессии могут значительно повлиять на способность организма развиваться и эффективно адаптироваться. У животных часто бывает полезно, чтобы придатки эволюционировали вместе, и было замечено, что передние и задние конечности разделяют экспрессию Hox-гены рано в многоклеточный разработка.[1] Таким образом, изменения в регуляторных паттернах этих генов будут влиять на развитие как передних, так и задних конечностей, облегчая совместную эволюцию.

Пример

Один упрощенный пример группы синэкспрессии - это гены cdc6, cdc3, cdc46, и swi4 в дрожжи, которые все коэкспрессируются в начале G-1 этап клеточного цикла.,[1][2] Эти гены имеют один общий СНГ-регуляторный элемент, называемый ECB, который служит сайтом связывания для MCM1 транс-действующий белок. Хотя эти гены пространственно не сгруппированы, совместная регуляция, по-видимому, достигается за счет этого общего СНГ и транс механизм управления. Большинство групп синэкспрессии более сложны, чем группа ECB у дрожжей, включая бесчисленное множество СНГ и транс элементы управления.[1][2]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я Нирс, К. и Поллет, Николас. Группы синэкспрессии у эукариот. Природа 1999 2 декабря; 402: 483–487.
  2. ^ а б Mai, B. et al. Характеристика связывающего комплекса ECB, ответственного за M / G1-специфическую транскрипцию CLN3 и SW14. Молекулярная и клеточная биология 2002 Янв; 430-441.