Тиоалкаливибрио - Thioalkalivibrio

Thioalkalivibrio nitratis
Научная классификация
Королевство:	Бактерии
Тип:	Протеобактерии
Класс:	Гаммапротеобактерии
Порядок:	Chromatiales
Семья:	Ectothiorhodospiraceae
Род:	Тиоалкаливибрио Сорокин и др. 2001 г.[1]
Типовой вид
Thioalkalivibrio versutus[1]
Разновидность[1]
T. denitrificans Т. halophilus Т. jannaschii T. nitratireducens Т. nitratis Т. парадокс Т. сульфидифилус Т. thiocyanodenitrificans Т. thiocyanoxidans T. versutus
Синонимы
Тиоалькаловибрион[2]

Тиоалкаливибрио это Грамотрицательный, главным образом галофильный бактериальный род семейства Ectothiorhodospiraceae.^[1][2][3][4]

Вхождение

В последнее десятилетие несколько видов Тиоалкаливибрио были обнаружены, но эти хемолитоавтотрофные галоалкалифильные сероокисляющие бактерии были обнаружены только в содовых озерах в щелочных и соленых средах обитания. Однако Сорокин и его коллеги (2012) выделили и вырастили роман. Thioalkalivibrio sulfidiphilus, штамм HL-EbGr7T, из полномасштабного биореактора сточных вод после удаления сероводорода /^[5]

Структура

В Штамм Thioalkalivibrio sulfidiphilus HL-EbGr7T клетки - длинные, тонкие, слегка изогнутые, палочковидные бактерии с полярным жгутиком для подвижности. Он имеет грамотрицательную клеточную стенку и колонии до 2 мм в диаметре.^[5]

Генетика

Штамм Thioalkalivibrio sulfidiphilus HL-EbGr7T тесно связан с Thioalkalivibrio denitrificans внутри Gammaproteobacteria на основе гена 16S рРНК. Он содержит единственную хромосому размером 3,46 Мбит / с с содержанием G + C 65,06% и 3366 генов.^[6]

Метаболизм

Штамм HL-EBGrtT был обязательно аэробным, не мог использовать нитрит или нитрат в качестве источника азота, но мог использовать мочевину и аммиак. Он рос как на тиосульфате, так и на сульфиде, предпочитая сульфид. Он также окислял полисульфид, элементарную серу и тетратионат. Он был чувствителен к полностью аэробным условиям, оптимально рос при pH 10, содержании соли 0,4 M и оптимальной температуре 35 ° C. Он был чувствителен к хлорамфениколу и устойчив к ампициллину, канамицину, тетрациклину и рифампицину.^[5]

использованная литература

1. «Род Thioalkalivibrio». LPSN. Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре.
2. «Таксономия - Thioalkalivibrio». UniProt.
3. Бреннер Д. Д., Криг Н. Р., Стейли Д. Т. (2005). Руководство по систематической бактериологии Берджи (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. ISBN  0-387-28022-7.
4. Зекбах Дж, Орен А., Стан-Лоттер Х (2013). Жизнь полиэкстремофилов в условиях множественных стрессов. Дордрехт: Springe r. ISBN  978-94-007-6488-0.
5. Сорокин Д.Ю., Мунтян М.С., Пантелеева А.Н., Муйзер Г. (август 2012). «Thioalkalivibrio sulfidiphilus sp. Nov., Галоалкалифильная, окисляющая серу гаммапротеобактерия из щелочных сред обитания». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 62 (Pt 8): 1884–9. Дои:10.1099 / ijs.0.034504-0. PMID  21984678.
6. Муйзер Г., Сорокин Д.Ю., Мавроматис К., Лапидус А., Клам А., Иванова Н. и др. (Февраль 2011 г.). «Полная последовательность генома« Thioalkalivibrio sulfidophilus »HL-EbGr7». Стандарты геномных наук. 4 (1): 23–35. Дои:10.4056 / sigs.1483693. ЧВК  3072093. PMID  21475584.

дальнейшее чтение

• Бербен Т., Сорокин Д.Ю., Иванова Н., Пати А., Кирпидес Н., Гудвин Л.А. и др. (26 октября 2015 г.). «Неполная последовательность генома Thioalkalivibrio thiocyanodenitrificans ARhD 1 (T), хемолитоавтотрофной галоалкалифильной сероокисляющей бактерии, способной к полной денитрификации». Стандарты геномных наук. 10 (1): 84. Дои:10.1186 / s40793-015-0080-3. ЧВК  4624374. PMID  26512309.
• Коки Х., Гарабед А., Алан Т. Б., Фрэнк Т. Р., Карл О. С. (2010). Справочник экстремофилов. Springer Science & Business Media. ISBN  978-4-431-53897-4.
• Атлас РМ (2010). Справочник микробиологических сред (4-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: Бока-Ратон, Флорида. ISBN  978-1-4398-0408-7.
• Кронек П.М., Торрес М.Э. (2014). Металлическая биогеохимия газообразных соединений окружающей среды. Springer. ISBN  978-94-017-9269-1.