Минорная сплайсосомная РНК U4atac - U4atac minor spliceosomal RNA

Минорная сплайсосомная РНК U4atac
RF00618.jpg
Идентификаторы
СимволU4atac
РфамRF00618
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; сращивание
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000274
PDB структурыPDBe

Минорная сплайсосомная РНК U4atac это нкРНК который является важным компонентом минорная сплайсосома типа U12 сложный. Сплайсосома типа U12 необходима для удаления более редкого класса эукариотический интроны (AT-AC, тип U12).[1]

Предполагается, что мяРНК U4atac образует спаренный по основанию комплекс с другой сплайсосомальной РНК. U6atac через два стержень петля регионы. Было показано, что эти взаимодействующие петли стержня необходимы для in vivo сращивание.[2] U4atac также содержит 3' Sm белок сайт связывания, который, как было показано, важен для активности сплайсинга.[2] U4atac - функциональный аналог Сплайсосомная РНК U4 в основной сплайсосомный U2-тип сложный.[2]

В Дрозофила МнРНК U4atac имеет дополнительную предполагаемую 3'-концевую петлю ствола по отношению к сайту связывания Sm.[3]

Болезнь

Было показано, что мутации в мяРНК U4atac могут вызывать микроцефальный остеодиспластический примордиальный карликовость I типа (MOPD I), также называемый синдромом Тайби-Линдера (TALS). MOPD I - это нарушение развития, связанное с аномалиями мозга и скелета. Было показано, что мутации вызывают дефектный сплайсинг U12.[4][5]

Рекомендации

  1. ^ Лоркович З.Дж., Ленер Р., Форстнер С., Барта А. (2005). «Эволюционное сохранение сплайсосомы минорного типа U12 между растениями и людьми». РНК. 11 (7): 1095–1107. Дои:10.1261 / rna.2440305. ЧВК  1370794. PMID  15987817.
  2. ^ а б c Шукла Г.К., Коул А.Дж., Дитрих Р.К., Пэджетт Р.А. (2002). «Домены человеческой мяРНК U4atac, необходимые для U12-зависимого сплайсинга in vivo». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (21): 4650–4657. Дои:10.1093 / nar / gkf609. ЧВК  135832. PMID  12409455.
  3. ^ Паджетт Р.А., Шукла Г.К. (2002). «Пересмотренная модель спаривания оснований мяРНК U4atac / U6atac». РНК. 8 (2): 125–128. Дои:10.1017 / S1355838202017156. ЧВК  1370236. PMID  11911359.
  4. ^ Он, Н; и другие. (2011). «Мутации в мяРНК U4atac, компонента малой сплайсосомы, при нарушении развития MOPD I». Наука. 332 (6026): 238–240. Дои:10.1126 / science.1200587. ЧВК  3380448. PMID  21474760.
  5. ^ Эдери, П; и другие. (2011). «Ассоциация нарушения развития TALS с дефектом минорного компонента сплайсинга U4atac snRNA». Наука. 332 (6026): 240–243. Дои:10.1126 / science.1202205. PMID  21474761.

внешняя ссылка