UTY (ген) - UTY (gene)

UTY
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3ZLI, 3ZPO, 4UF0, 5FY0, 5FXW, 5FXX, 5FXZ, 5FY1, 5FY7, 5FYM, 5FXV, 5A1L
Идентификаторы
Псевдонимы	UTY, KDM6AL, UTY1, повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, содержащий, Y-связанный, KDM6C
Внешние идентификаторы	OMIM: 400009 Генные карты: UTY
Расположение гена (человек) Chr. Y-хромосома (человек)[1] Группа Yq11.221 Начинать 13,248,379 бп[1] Конец 13,480,673 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • активность диоксигеназы • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K27) • связывание ионов металлов • гистоновая деметилаза активность • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание хроматина • связывание хроматина с ДНК • последовательное связывание ДНК Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • Комплекс MLL3 / 4 Биологический процесс • регуляция экспрессии генов • окислительно-восстановительный процесс • деметилирование гистона H3-K27 • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7404	н / д
Ансамбль	ENSG00000183878	н / д
UniProt	O14607	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001258249 NM_001258250 NM_001258251 NM_001258252 NM_001258253 NM_001258254 NM_001258255 NM_001258256 NM_001258257 NM_001258258 NM_001258259 NM_001258260 NM_001258261 NM_001258262 NM_001258263 NM_001258264 NM_001258265 NM_001258266 NM_001258267 NM_001258268 NM_001258269 NM_001258270 NM_007125 NM_182659 NM_182660	н / д
RefSeq (белок)	NP_001245178 NP_001245179 NP_001245180 NP_001245181 NP_001245182 NP_001245183 NP_001245184 NP_001245185 NP_001245186 NP_001245187 NP_001245188 NP_001245189 NP_001245190 NP_001245191 NP_001245192 NP_001245193 NP_001245194 NP_001245195 NP_001245196 NP_001245197 NP_001245198 NP_001245199 NP_009056 NP_872600 NP_872601 NP_001245196.1 NP_001245192.1 NP_001245178.1 NP_001245194.1 NP_001245186.1 NP_001245191.1 NP_001245187.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr Y: 13.25 - 13.48 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Гистоновая деметилаза UTY является фермент что у людей кодируется UTY ген.^[3][4][5]

Этот ген кодирует белок, содержащий тетратрикопептидные повторы которые считаются причастными к белок-белковые взаимодействия. Этот белок второстепенный гистосовместимость антиген, который может индуцировать отторжение трансплантата мужчины стволовая клетка прививки. Альтернативная сварка приводит к множеству вариантов транскрипции, кодирующих разные изоформы.^[5]

Взаимодействия

УТЙ было показано взаимодействовать с TLE1^[6] и WDR90.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183878 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Гринфилд А., Скотт Д., Пенниси Д., Эрманн И., Эллис П., Купер Л. и др. (Декабрь 1996 г.). «Эпитоп H-YDb кодируется новым геном Y-хромосомы мыши». Природа Генетика. 14 (4): 474–8. Дои:10.1038 / ng1296-474. PMID  8944031.
4. Гринфилд А., Каррел Л., Пенниси Д., Филипп С., Квадери Н., Сиггерс П. и др. (Апрель 1998 г.). «Ген UTX избегает инактивации X у мышей и людей». Молекулярная генетика человека. 7 (4): 737–42. Дои:10,1093 / чмг / 7,4,737. PMID  9499428.
5. «Ген Entrez: UTY, повсеместно транскрибируемый ген тетратрикопептидного повтора, Y-связанный».
6. Грбавец Д., Ло Р., Лю Ю., Гринфилд А., Стифани С. (январь 1999 г.). «Граучо / трансдуцин-подобный энхансер расщепленных членов семейства (TLE) взаимодействуют с дрожжевым корепрессором транскрипции SSN6 и белками, связанными с SSN6 млекопитающих: последствия для эволюционного сохранения механизмов репрессии транскрипции». Биохимический журнал. 337 (Pt 1) (1): 13–7. Дои:10.1042/0264-6021:3370013. ЧВК  1219929. PMID  9854018.
7. "STRING: функциональные сети ассоциации белков". string-db.org. Получено 2015-05-07.

дальнейшее чтение

• Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (октябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука. 278 (5338): 675–80. Bibcode:1997Sci ... 278..675L. Дои:10.1126 / наука.278.5338.675. PMID  9381176.
• Грбавец Д., Ло Р., Лю Ю., Гринфилд А., Стифани С. (январь 1999 г.). «Граучо / трансдуцин-подобный энхансер расщепленных членов семейства (TLE) взаимодействуют с дрожжевым корепрессором транскрипции SSN6 и белками, связанными с SSN6 млекопитающих: последствия для эволюционного сохранения механизмов репрессии транскрипции». Биохимический журнал. 337 (Pt 1) (1): 13–7. Дои:10.1042/0264-6021:3370013. ЧВК  1219929. PMID  9854018.
• Уоррен Э.Х., Гэвин М.А., Симпсон Э., Чендлер П., Пейдж Д.К., Disteche C и др. (Март 2000 г.). «Ген UTY человека кодирует новый HLA-B8-рестриктированный антиген H-Y». Журнал иммунологии. 164 (5): 2807–14. Дои:10.4049 / jimmunol.164.5.2807. PMID  10679124.
• Фореста С., Ферлин А., Моро Е. (май 2000 г.). «Анализ делеции и экспрессии генов AZFa в Y-хромосоме человека показал важную роль DBY в мужском бесплодии». Молекулярная генетика человека. 9 (8): 1161–9. Дои:10.1093 / hmg / 9.8.1161. PMID  10767340.
• Шен П., Ван Ф., Андерхилл П.А., Франко К., Ян У.Х., Рохас А. и др. (Июнь 2000 г.). «Популяционные генетические последствия изменения последовательности в четырех генах Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (13): 7354–9. Bibcode:2000PNAS ... 97.7354S. Дои:10.1073 / пнас.97.13.7354. ЧВК  16549. PMID  10861003.
• Vogt MH, Goulmy E, Kloosterboer FM, Blokland E, de Paus RA, Willemze R, Falkenburg JH (ноябрь 2000 г.). «Ген UTY кодирует HLA-B60-ограниченный человеческий мужской специфический минорный антиген гистосовместимости, участвующий в отторжении трансплантата стволовых клеток: характеристика критических полиморфных аминокислотных остатков для распознавания Т-клетками». Кровь. 96 (9): 3126–32. PMID  11049993.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801.
• Агат Р.Дж., Чхве М., Арнольд А.П. (февраль 2004 г.). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых зябликов». Молекулярная биология и эволюция. 21 (2): 384–96. Дои:10.1093 / молбев / мш027. PMID  14660691.
• Джеррард Д.Т., Филатов Д.А. (июнь 2005 г.). «Положительный и отрицательный отбор по Y-хромосомам млекопитающих». Молекулярная биология и эволюция. 22 (6): 1423–32. Дои:10.1093 / molbev / msi128. PMID  15758204.