Элемент посттранскрипционного ответа WHP - WHP Posttranscriptional Response Element

Вирус гепатита сурка (WHP) Регуляторный элемент посттранскрипции (WPRE) это Последовательность ДНК что при расшифровке создает третичная структура усиление выражение. Последовательность обычно используется в молекулярная биология увеличить выражение гены доставлено вирусные векторы.[1] WPRE - это трехсторонний регулирующий элемент с гамма, альфа, и бета-компоненты. Альфа-компонент длиной 80 бп:

GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGT[2]

При использовании отдельно без гамма- и бета-компонентов WPRE альфа-компонент всего на 9% активнее полного трехстороннего WPRE. Последовательность для полного трехстороннего WPRE:

AATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Эта последовательность имеет 100% гомология с парами оснований от 1093 до 1684 Вирус гепатита В сурка (WHV8) геном. При использовании в 3'-нетранслируемой области (UTR) млекопитающего кассета экспрессии, он может значительно повысить стабильность мРНК и выход белка.[2]

Рекомендации

  1. ^ Lee, YB; Гловер, КП; Cosgrave, AS; Биенеманн, А; Юней, Дж. Б. (январь 2005 г.). «Оптимизация экспрессии регулируемых генов с использованием аденовирусных векторов». Опыт Физиол. 90 (1): 33–7. Дои:10.1113 / expphysiol.2004.028209. PMID  15542617.
  2. ^ а б Донелло, Дж. Э .; Loeb, JE; Надежда, Т.Дж. (июнь 1998 г.). «Вирус гепатита сурка содержит трехсторонний посттранскрипционный регуляторный элемент». Дж. Вирол. 72 (6): 5085–92. ЧВК  110072. PMID  9573279.