Белковый домен YceI - YceI protein domain
| YceI | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура полиизопреноид-связывающего белка TT1927B из Thermus thermophilus hb8 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | YceI | ||||||||
| Pfam | PF04264 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR007372 | ||||||||
| SCOP2 | 1uf6 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 101 | ||||||||
| Белок OPM | 3 л.с. | ||||||||
| |||||||||
В молекулярная биология, Yce-I белковый домен это предполагаемый периплазматический белок. Эта запись представляет липид -обвязка белок YceI из кишечная палочка [1] и полиизопреноид -связывающий белок TTHA0802 из Термус термофильный.[2] Его роль - помогать биосинтез из изопреноид, важная молекула, обнаруженная во всех живых организмы.
Структура
Оба эти белка имеют общий домен с 8-жильным бета-баррель складывать. Это похоже на липокалин сбросить, хотя нет гомология последовательностей существует с липокалинами. В TTHA0802 белок связывает полиизопреноид цепь внутри поры ствола через гидрофобный взаимодействия.[2] Последовательность гомологи этого ядра структура присутствуют в широком диапазоне бактерии и археи.
Функция
В кристаллические структуры предполагает, что это семейство белков играет важную роль в изопреноиде хинон метаболизм или в транспорт или хранения. В обоих случаях белок является гомодимером, каждый мономер характеризуется липокалиновой складкой.[2]
Рекомендации
- ^ Станчик Л.М., Станчик Д.М., Шмидт Б., Барнхарт Д.М., Йончева Ю.Н., Слончевский Ю.Л. (август 2002 г.). «pH-зависимая экспрессия периплазматических белков и катаболизм аминокислот в Escherichia coli». J. Bacteriol. 184 (15): 4246–58. Дои:10.1128 / jb.184.15.4246-4258.2002. ЧВК 135203. PMID 12107143.
- ^ а б c Ханда Н., Терада Т., Дои-Катаяма Й., Хирота Х., Тейм-младший, Пак С.И., Курамицу С., Широузу М., Йокояма С. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура нового полиизопреноидсвязывающего белка из Thermus thermophilus HB8». Белковая наука. 14 (4): 1004–10. Дои:10.1110 / пс. 041183305. ЧВК 2253440. PMID 15741337.