Yfr1 - Yfr1

Цианобактериальная функциональная РНК 1
Yfr1 вторичная структура.jpg
Идентификаторы
СимволYfr1
РфамRF01116
Прочие данные
РНК типГен; мРНК
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0001263
PDB структурыPDBe

Yfr1 цианобактерий функциональная РНК что было идентифицировано сравнительный геном основанный экран для РНК в цианобактерии.[1] Дальнейший анализ показал, что РНК хорошо консервативна и высокоэффективна. выразил у цианобактерий.[2] и требуется для роста в условиях нескольких стрессов[3] Биоинформатика исследования в сочетании с последующими экспериментами показали, что Yfr1 ингибирует трансляцию белков PMM1119 и PMM1121 за счет антисмыслового взаимодействия за счет спаривания оснований в сайт связывания рибосом.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Axmann IM, Kensche P, Vogel J, Kohl S, Herzel H, Hess WR (2005). «Идентификация цианобактериальных некодирующих РНК с помощью сравнительного анализа генома». Геном Биол. 6 (9): R73. Дои:10.1186 / gb-2005-6-9-r73. ЧВК  1242208. PMID  16168080.
  2. ^ Восс Б., Гирга Г., Аксманн И.М., Гесс В.Р. (2007). «Поиск на основе мотивов в бактериальных геномах позволяет идентифицировать ортолог малой РНК Yfr1 во всех линиях цианобактерий». BMC Genomics. 8: 375. Дои:10.1186/1471-2164-8-375. ЧВК  2190773. PMID  17941988.
  3. ^ Накамура Т., Наито К., Йокота Н., Сугита С., Сугита М. (2007). «Цианобактериальная некодирующая РНК, Yfr1, необходима для роста в условиях множественного стресса». Физиология растительной клетки. 48 (9): 1309–1318. Дои:10,1093 / pcp / pcm098. PMID  17664182.
  4. ^ Рихтер А.С., Шлебергер С., Бэкофен Р., Штеглих С. ​​(2010). «Прогнозирование INTARNA на основе семян в сочетании с системой GFP-репортер идентифицирует мишени мРНК малой РНК Yfr1». Биоинформатика. 26 (1): 1–5. Дои:10.1093 / биоинформатика / btp609. ЧВК  2796815. PMID  19850757.

внешняя ссылка