AFAP1 - AFAP1

AFAP1
Идентификаторы
Псевдонимы	AFAP1, AFAP, AFAP-110, AFAP110, белок 1, связанный с актиновыми филаментами
Внешние идентификаторы	OMIM: 608252 MGI: 1917542 ГомолоГен: 11009 Генные карты: AFAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п16.1 Начните 7,758,714 бп[1] Конец 7,939,926 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 B3 Начните 35,893,319 бп[2] Конец 36,003,923 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актина • Привязка домена SH3 • Привязка домена SH2 Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет • очаговая адгезия • цитозоль • актиновый цитоскелет Биологический процесс • регулирование передачи сигнала • регуляция организации цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	60312	70292
Ансамбль	ENSG00000196526	ENSMUSG00000029094
UniProt	Q8N556	Q80YS6
RefSeq (мРНК)	NM_001134647 NM_021638 NM_198595 NM_001371090 NM_001371091	NM_027373
RefSeq (белок)	NP_001128119 NP_940997 NP_001358019 NP_001358020	NP_081649
Расположение (UCSC)	Chr 4: 7.76 - 7.94 Мб	Chr 5: 35.89 - 36 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 1, связанный с актиновыми филаментами это белок что у людей кодируется AFAP1 ген.^[5][6][7][8]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой Src связывающий партнер. Он может представлять собой потенциальный модулятор целостности актиновых филаментов в ответ на клеточные сигналы и может действовать как адаптерный белок, связывая членов семейства Src и / или другие сигнальные белки с актиновыми филаментами. Идентифицированы два альтернативных транскрипта, кодирующих один и тот же белок.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196526 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029094 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цянь Ю., Гейтсман А.С., Байсден Дж. М., Зот Х. Г., Черезова Л., Кази И., Мазлум Н., Ли М. Ю., Гуаппоне-Коай А., Флинн, округ Колумбия (февраль 2004 г.). «Анализ роли мотива лейциновой застежки-молнии в регуляции способности AFAP-110 изменять целостность актинового филамента». J Cell Biochem. 91 (3): 602–20. Дои:10.1002 / jcb.10725. PMID  14755689. S2CID  38130241.
6. Байсден Дж. М., Гейтсман А. С., Черезова Л., Цзян Б. Х., Флинн, округ Колумбия (октябрь 2001 г.). «Внутренняя способность AFAP-110 изменять целостность актиновых волокон связана с его способностью также активировать клеточные тирозинкиназы». Онкоген. 20 (45): 6607–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1204802. PMID  11641786.
7. Байсден Дж. М., Цянь Ю., Зот Х. М., Флинн, округ Колумбия (октябрь 2001 г.). «Белок, связанный с актиновыми филаментами, AFAP-110 представляет собой адаптерный белок, который модулирует изменения целостности актиновых филаментов». Онкоген. 20 (44): 6435–47. Дои:10.1038 / sj.onc.1204784. PMID  11607843.
8. «Ген Entrez: белок 1, связанный с актиновыми филаментами AFAP1».

внешняя ссылка

• Человек AFAP1 расположение генома и AFAP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Исида Ю., Хадано С., Нагаяма Т. и др. (1995). «Выделение и характеристика 21 новой экспрессируемой последовательности ДНК из дистальной области хромосомы 4р человека». Геномика. 22 (2): 302–12. Дои:10.1006 / geno.1994.1388. PMID  7545969.
• Цянь Ю., Байсден Дж. М., Вестин Э. Х. и др. (1998). «Src может регулировать карбоксиконцевые взаимодействия с AFAP-110, которые влияют на самоассоциацию, локализацию клеток и целостность актиновых филаментов». Онкоген. 16 (17): 2185–95. Дои:10.1038 / sj.onc.1201753. PMID  9619827.
• Guappone AC, Weimer T, Flynn DC (1998). «Образование стабильного комплекса src-AFAP-110 через амино-концевой или карбокси-концевой SH2-связывающий мотив». Мол. Канцероген. 22 (2): 110–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199806) 22: 2 <110 :: AID-MC6> 3.0.CO; 2-Q. PMID  9655255.
• Цянь Ю., Байсден Дж. М., Зот Х. Г. и др. (2000). «Карбокси-конец AFAP-110 модулирует прямые взаимодействия с актиновыми филаментами и регулирует его способность изменять целостность актиновых филаментов и индуцировать образование ламеллиподий». Exp. Cell Res. 255 (1): 102–13. Дои:10.1006 / excr.1999.4795. PMID  10666339.
• Qian Y, Baisden JM, Cherezova L, et al. (2003). «Фосфорилирование ПК увеличивает способность AFAP-110 сшивать актиновые филаменты». Мол. Биол. Клетка. 13 (7): 2311–22. Дои:10.1091 / mbc.E01-12-0148. ЧВК  117315. PMID  12134071.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Клетка. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Dorfleutner A, Stehlik C, Zhang J, et al. (2007). «AFAP-110 необходим для образования актиновых стрессовых волокон и клеточной адгезии в клетках рака молочной железы MDA-MB-231». J. Cell. Физиол. 213 (3): 740–9. CiteSeerX  10.1.1.636.3591. Дои:10.1002 / jcp.21143. PMID  17520695. S2CID  15344259.