ANKRD17 - ANKRD17

ANKRD17
Идентификаторы
Псевдонимы	ANKRD17, GTAR, NY-BR-16, MASK2, домен анкиринового повтора 17
Внешние идентификаторы	OMIM: 615929 MGI: 1932101 ГомолоГен: 82403 Генные карты: ANKRD17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q13.3 Начинать 73,073,376 бп[1] Конец 73,258,798 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E1 Начинать 90,227,166 бп[2] Конец 90,366,577 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • хроматин • мембрана • ядро клетки • не мембрана Биологический процесс • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • положительная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • врожденная иммунная система • GO: 0022415 вирусный процесс • положительная регуляция клеточного цикла • положительная регуляция сигнального пути RIG-I • защитный ответ на бактерию • положительная регуляция сигнального пути MDA-5 • отрицательная регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток • регулирование репликации ДНК • иммунная система • созревание кровеносных сосудов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26057	81702
Ансамбль	ENSG00000132466	ENSMUSG00000055204
UniProt	O75179	Q99NH0
RefSeq (мРНК)	NM_001286771 NM_032217 NM_198889 NM_015574	NM_030886 NM_198010
RefSeq (белок)	NP_001273700 NP_056389 NP_115593 NP_942592	NP_112148 NP_932127
Расположение (UCSC)	Chr 4: 73.07 - 73.26 Мб	Chr 5: 90.23 - 90.37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 17, содержащий домен анкиринового повтора это белок что у людей кодируется ANKRD17 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок с анкириновыми повторами, которые связаны с белок-белковыми взаимодействиями. Исследования на мышах показывают, что этот белок участвует в развитии печени. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132466 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055204 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ватт А.Дж., Джонс Е.А., Уре Дж. М., Педди Д., Уилсон Д. И., Форрестер Л. М. (февраль 2001 г.). «Интеграция генной ловушки обеспечивает ранний in situ маркер печеночной спецификации энтодермы передней кишки». Мех Дев. 100 (2): 205–15. Дои:10.1016 / S0925-4773 (00) 00530-X. PMID  11165478. S2CID  18601209.
6. «Ген Entrez: домен 17 анкиринового повтора ANKRD17».

внешняя ссылка

• Человек ANKRD17 расположение генома и ANKRD17 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Джонс Э.А., Тош Д., Уилсон Д.И. и др. (2002). «Печеночная дифференцировка эмбриональных стволовых клеток мыши». Exp. Cell Res. 272 (1): 15–22. Дои:10.1006 / excr.2001.5396. PMID  11740861.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, et al. (2003). «Гуморальный иммунитет к раку груди человека: определение антигена и количественный анализ экспрессии мРНК». Иммунный против рака. 1: 4. PMID  12747765.
• Пулин Ф, Брюшке А, Зоненберг Н (2004). «Слияние генов и перекрывающиеся рамки считывания в генах млекопитающих для 4E-BP3 и MASK». J. Biol. Chem. 278 (52): 52290–7. Дои:10.1074 / jbc.M310761200. PMID  14557257.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.