ANKRD25 - ANKRD25

KANK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4HBD
Идентификаторы
Псевдонимы	KANK2, ANKRD25, MXRA3, SIP, PPKWH, мотив KN и домены 2 анкириновых повторов, NPHS16
Внешние идентификаторы	OMIM: 614610 MGI: 2384568 ГомолоГен: 9163 Генные карты: KANK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начинать 11,164,267 бп[1] Конец 11,197,791 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A3 Начинать 21,766,784 бп[2] Конец 21,798,744 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • митохондрия Биологический процесс • отрицательная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • отрицательная регуляция запрограммированной гибели клеток • отрицательная регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора витамина D • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательное регулирование пролиферации клеток • апоптотический процесс • развитие эпителия почек • гломерулярная миграция висцеральных эпителиальных клеток • регуляция передачи сигнала белка Rho Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25959	235041
Ансамбль	ENSG00000197256	ENSMUSG00000032194
UniProt	Q63ZY3	Q8BX02
RefSeq (мРНК)	NM_015493 NM_001136191 NM_001329451	NM_145611
RefSeq (белок)	NP_001129663 NP_001316380 NP_056308 NP_001366477 NP_001366478 NP_001366479 NP_001366480 NP_001366481 NP_001366482 NP_001366483 NP_001366484 NP_001366485 NP_001366486 NP_001366487 NP_001366488 NP_001366489 NP_001366490 NP_001366491 NP_001366492	NP_663586
Расположение (UCSC)	Chr 19: 11.16 - 11.2 Мб	Chr 9: 21,77 - 21,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Мотив KN и белок 2, содержащий домен анкиринового повтора это белок что у людей кодируется KANK2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197256 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032194 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (сентябрь 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
6. Чжу И, Какинума Н., Ван И, Кияма Р. (январь 2008 г.). «Канк белки: новое семейство белков, содержащих анкирин-повторяющийся домен». Biochim Biophys Acta. 1780 (2): 128–33. Дои:10.1016 / j.bbagen.2007.09.017. PMID  17996375.
7. «Ген Entrez: домен 25 анкиринового повтора ANKRD25».

внешняя ссылка

• Человек KANK2 расположение генома и KANK2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемой последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Zhang Y, Zhang H, Liang J и др. (2007). "SIP, новый белок, содержащий анкириновые повторы, изолирует коактиваторы стероидных рецепторов в цитоплазме". EMBO J. 26 (11): 2645–57. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601710. ЧВК  1888672. PMID  17476305.