AP1B1 - AP1B1 - Wikipedia

AP1B1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4HMY, 4П6З
Идентификаторы
Псевдонимы	AP1B1, ADTB1, AP105A, BAM22, CLAPB2, субъединица 1 бета 1 адапторного белкового комплекса, 1 бета 1 субъединица адапторного белкового комплекса, KIDAR
Внешние идентификаторы	OMIM: 600157 MGI: 1096368 ГомолоГен: 21972 Генные карты: AP1B1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.2 Начинать 29,327,680 бп[1] Конец 29,423,179 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начинать 4,986,824 бп[2] Конец 5,042,791 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • транспортная деятельность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • клатриновое связывание Сотовый компонент • мембрана транс-сети Гольджи • мембрана • Мембрана Гольджи • лизосомальная мембрана • мембрана везикул, покрытая клатрином • мембранное пальто • мембрана цитоплазматических везикул • цитоплазматический пузырек • клатриновый адаптерный комплекс • аппарат Гольджи • цитозоль • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • регулирование защитной реакции вируса на вирус • развитие сердца • определение левой / правой симметрии • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	162	11764
Ансамбль	ENSG00000100280	ENSMUSG00000009090
UniProt	Q10567	O35643
RefSeq (мРНК)	NM_145730 NM_001127 NM_001166019	NM_001243043 NM_001243044 NM_007454 NM_001355659 NM_001355660
RefSeq (белок)	NP_001118 NP_001159491 NP_663782 NP_001365491 NP_001365492 NP_001365493 NP_001365494 NP_001365495	NP_001229972 NP_001229973 NP_031480 NP_001342588 NP_001342589
Расположение (UCSC)	Chr 22: 29.33 - 29.42 Мб	Chr 11: 4.99 - 5.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-1 комплексная субъединица АР-1 это белок что у людей кодируется AP1B1 ген.^[5][6][7]

Адаптерный белковый комплекс 1 обнаруживается на цитоплазматической стороне покрытых везикул, расположенных в комплексе Гольджи, где он опосредует как рекрутирование клатрина на мембрану, так и распознавание сигналов сортировки внутри цитозольных хвостов трансмембранных рецепторов. Этот комплекс представляет собой гетеротетрамер, состоящий из двух больших, одной средней и одной малой субъединиц адаптина. Белок, кодируемый этим геном, служит одной из крупных субъединиц этого комплекса и является членом семейства белков адаптинов. Этот ген является кандидатом менингиома ген. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, и существуют варианты, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования.^[7]

Взаимодействия

AP1B1 был показан взаимодействовать с KIF13A^[8] и AP1G1.^[9][10][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100280 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009090 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пейрард М., Франссон И., Се Ю.Г., Хан Ф.Й., Раттледж М.Х., Сван С., Коллинз Дж. Э., Данэм И., Коллинз В. П., Думански Дж. П. (январь 1995 г.). «Характеристика нового члена семейства генов бета-адаптина человека из хромосомы 22q12, гена кандидата менингиомы». Хум Мол Генет. 3 (8): 1393–9. Дои:10.1093 / hmg / 3.8.1393. PMID  7987321.
6. Пейрард М., Pan HQ, Кедра Д., Франссон И., Сван С., Хартман К., Клифтон С.В., Роу Б.А., Думански Д.П. (февраль 1997 г.). «Структура промотора и геномная организация гена бета-адаптина человека (BAM22) из ​​хромосомы 22q12». Геномика. 36 (1): 112–7. Дои:10.1006 / geno.1996.0431. PMID  8812422.
7. «Ген Entrez: AP1B1-родственный белковый комплекс 1, субъединица бета 1».
8. Накагава, Т; Setou M; Seog D; Огасавара К; Dohmae N; Такио К; Хирокава Н. (ноябрь 2000 г.). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Клетка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 103 (4): 569–81. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. ISSN  0092-8674. PMID  11106728.
9. Такацу, H; Sakurai M; Шин H W; Мураками К; Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 273 (38): 24693–700. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24693. ISSN  0021-9258. PMID  9733768.
10. Fölsch, H; Оно H; Bonifacino J S; Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Клетка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 99 (2): 189–98. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. ISSN  0092-8674. PMID  10535737.
11. Пейдж, L J; Робинсон МС (ноябрь 1995 г.). «Направляющие сигналы и субъединичные взаимодействия в адапторных комплексах везикул с покрытием». J. Cell Biol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 131 (3): 619–30. Дои:10.1083 / jcb.131.3.619. ISSN  0021-9525. ЧВК  2120623. PMID  7593184.

дальнейшее чтение

• Кирххаузен Т (2000). «Клатрин». Анну. Преподобный Biochem. 69: 699–727. Дои:10.1146 / annurev.biochem.69.1.699. PMID  10966473.
• Гейер М., Факлер О. Т., Петерлин Б. М. (2001). «Структура - функция взаимоотношений в ВИЧ-1 Неф». EMBO Rep. 2 (7): 580–5. Дои:10.1093 / embo-reports / kve141. ЧВК  1083955. PMID  11463741.
• Бенишу С., Бенмера А. (2003). «[Nef ВИЧ и белки K3 / K5 вируса Капоши-саркомы:« паразиты »пути эндоцитоза]». Med Sci (Париж). 19 (1): 100–6. Дои:10.1051 / medsci / 2003191100. PMID  12836198.
• Лим Д.С., Кирш Д.Г., Канман С.Е. и др. (1998). «АТМ связывается с бета-адаптином в цитоплазматических везикулах». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (17): 10146–51. Дои:10.1073 / пнас.95.17.10146. ЧВК  21476. PMID  9707615.
• Такацу Х., Сакураи М., Шин Х.В. и др. (1998). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина». J. Biol. Chem. 273 (38): 24693–700. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24693. PMID  9733768.
• Крейг Х.М., Пандори М.В., Гуателли Дж.С. (1998). «Взаимодействие Nef ВИЧ-1 с клеточным путем сортировки на основе дилейцина необходимо для подавления CD4 и оптимальной вирусной инфекционности». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (19): 11229–34. Дои:10.1073 / пнас.95.19.11229. ЧВК  21624. PMID  9736718.
• Бреснахан П.А., Йонемото В., Феррелл С. и др. (1999). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 действует как сигнал интернализации для подавления CD4 и связывает адаптер клатрина AP-1». Curr. Биол. 8 (22): 1235–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00517-9. PMID  9811606.
• Гринберг М., ДеТуллео Л., Рапопорт И. и др. (1999). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 важен для сортировки ямок, покрытых клатрином, и для подавления CD4». Curr. Биол. 8 (22): 1239–42. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00518-0. PMID  9811611.
• Laporte SA, Oakley RH, Zhang J, et al. (1999). «Комплекс бета2-адренергический рецептор / бетааррестин привлекает клатриновый адаптер AP-2 во время эндоцитоза». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (7): 3712–7. Дои:10.1073 / pnas.96.7.3712. ЧВК  22359. PMID  10097102.
• Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (1999). «Новый адаптерный комплекс клатрина обеспечивает базолатеральное нацеливание в поляризованных эпителиальных клетках». Клетка. 99 (2): 189–98. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. PMID  10535737.
• Ким С.Т., Лим Д.С., Канман CE, Кастан МБ (2000). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID  10608806.
• Лай М.М., Луо Х.Р., Бернетт П.Е. и др. (2000). «Кальциневрин-связывающий белок каин является негативным регулятором эндоцитоза синаптических везикул». J. Biol. Chem. 275 (44): 34017–20. Дои:10.1074 / jbc.C000429200. PMID  10931822.
• Накагава Т., Сетоу М., Сог Д. и др. (2001). «Новый мотор, KIF13A, транспортирует маннозо-6-фосфатный рецептор к плазматической мембране посредством прямого взаимодействия с комплексом AP-1». Клетка. 103 (4): 569–81. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. PMID  11106728.
• Такацу Х., Футацумори М., Йошино К. и др. (2001). «Подобные субъединичные взаимодействия способствуют сборке адаптерных комплексов клатрина и комплекса COPI: анализ с использованием дрожжевой трехгибридной системы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 284 (4): 1083–9. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5081. PMID  11409905.
• Дорей Б., Корнфельд С. (2001). «Гамма-субъединица адапторного комплекса AP-1 связывает клатрин: значение для кооперативного связывания в сборке покрытых везикул». Мол. Биол. Клетка. 12 (7): 1925–35. Дои:10.1091 / mbc.12.7.1925. ЧВК  55640. PMID  11451993.
• Джардин Х, Макни В., Дональдсон К., Рахман I (2002). «Молекулярный механизм трансформирующего фактора роста (TGF) -beta1-индуцированного истощения глутатиона в альвеолярных эпителиальных клетках. Участие AP-1 / ARE и Fra-1». J. Biol. Chem. 277 (24): 21158–66. Дои:10.1074 / jbc.M112145200. PMID  11912197.

внешняя ссылка

• Человек AP1B1 расположение генома и AP1B1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.