ARFGAP3 - ARFGAP3

ARFGAP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CRW
Идентификаторы
Псевдонимы	ARFGAP3, ARFGAP1, фактор рибозилирования АДФ, белок 3, активирующий ГТФазу
Внешние идентификаторы	OMIM: 612439 MGI: 1913501 ГомолоГен: 134103 Генные карты: ARFGAP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.2 Начинать 42,796,502 бп[1] Конец 42,858,106 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E1 Начинать 83,299,739 бп[2] Конец 83,350,247 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитозоль • Мембрана Гольджи • аппарат Гольджи • мембрана • цитоплазма • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи • сеть транс-Гольджи • Покрытие везикул COPI Биологический процесс • транспорт белка • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт • секреция белка • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • транспорт • Покрытие COPI везикулы Гольджи Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26286	66251
Ансамбль	ENSG00000242247	ENSMUSG00000054277
UniProt	Q9NP61	Q9D8S3
RefSeq (мРНК)	NM_001142293 NM_014570	NM_025445 NM_001357756 NM_001357757
RefSeq (белок)	NP_001135765 NP_055385	NP_079721 NP_001344685 NP_001344686
Расположение (UCSC)	Chr 22: 42,8 - 42,86 Мб	Chr 15: 83,3 - 83,35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор АДФ-рибозилирования Белок, активирующий ГТФазу 3 это белок что у людей кодируется ARFGAP3 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой GTPase -активирующий белок (GAP), который связывается с аппарат Гольджи и который, как считается, взаимодействует с АДФ-рибозилирование фактор 1 (ARF1 ). Закодированный белок, вероятно, способствует гидролиз ARF1-связанного GTP, что требуется для диссоциация из белки оболочки от Гольджи мембраны и пузырьки. Диссоциация белков оболочки является предпосылкой слияния этих пузырьков с целевыми отсеки. Активность этого белка чувствительна к фосфолипиды. Первоначально этот ген был известен как ARFGAP1, но теперь это название родственного, но другого гена.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000242247 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000054277 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Zhang C, Yu Y, Zhang S, Liu M, Xing G, Wei H, Bi J, Liu X, Zhou G, Dong C, Hu Z, Zhang Y, Luo L, Wu C, Zhao S, He F (июль 2000 г. ). «Характеристика, хромосомная принадлежность и тканевая экспрессия нового человеческого гена, принадлежащего к семейству ARF GAP». Геномика. 63 (3): 400–8. Дои:10.1006 / geno.1999.6095. PMID  10704287.
6. Лю X, Чжан Ц., Син Г, Чен Цюй, Хэ Ф (февраль 2001 г.). «Функциональная характеристика нового человеческого ARFGAP3». FEBS Lett. 490 (1–2): 79–83. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02134-2. PMID  11172815.
7. «Ген Entrez: ARFGAP3, фактор ADP-рибозилирования, белок 3, активирующий GTPase».

внешняя ссылка

• Человек ARFGAP1 расположение генома и ARFGAP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек ARFGAP3 расположение генома и ARFGAP3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Ген. 146 (2): 199–207. Дои:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID  8076819.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Коллинз Дж. Э., Говард М. Е., Коул К. Г. и др. (2003). «Переоценка аннотации человеческого гена: анализ второго поколения хромосомы 22». Genome Res. 13 (1): 27–36. Дои:10.1101 / гр.695703. ЧВК  430954. PMID  12529303.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.