ARGminer - ARGminer
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | База данных ориентирована на краудсорсинговое курирование ARG, полученное из нескольких источников. |
| Типы данных захвачен | Устойчивость к противомикробным препаратам |
| Организмы | Бактерии |
| Доступ | |
| Интернет сайт | скамейка |
| Разное | |
| Закладки сущности | да |
ARGminer является база данных фокусируется на новом методе краудсорсингового курирования вместо ручного курирования Гены устойчивости к антибиотикам (ARG) получено из нескольких источников, таких как КАРТА, ARDB, NDARO, DeepARG, Uniprot, ResFinder, и SARG.[1] Кроме того, из-за наличия Мобильные генетические элементы (MGE), ARGminer также взаимодействует с ПАТРИК и ACLAME.[1] ARGminer аннотировал гены, используя их названия, антибиотик категория, механизм устойчивости, данные о подвижности и встречаемости у клинически важных штаммов бактерий.[1] Есть две группы краудсорсинговых кураторов. Один был нанят на Amazon Mechanical Turk который предлагает широкую аудиторию краудсорсинговых экспертов и неспециалистов, которые могут комментировать за денежное вознаграждение. Из-за наличия смешанного опыта каждому пользователю разрешено размещать не более 20 аннотаций. Другая группа - это класс микробиологии для выпускников.[1]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c d Zhang, L .; Vikesland, P.J .; Pruden, A .; Heath, L. S .; Riquelme, M. V .; Гарнер, Э .; Guron, G.K.P .; Аранго-Арготы, Г.А. (06.03.2019). «ARGminer: веб-платформа для лечения генов устойчивости к антибиотикам на основе краудсорсинга». bioRxiv: 274282. Дои:10.1101/274282.