ARHGEF2 - ARHGEF2 - Wikipedia

ARHGEF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5EFX
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF2, GEF, GEF-H1, GEFH1, LFP40, P40, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 2 Rho / Rac, NEDMHM, Lfc
Внешние идентификаторы	OMIM: 607560 MGI: 103264 ГомолоГен: 3468 Генные карты: ARHGEF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q22 Начинать 155,946,851 бп[1] Конец 156,007,070 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F1 Начинать 88,605,966 бп[2] Конец 88,648,052 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rac • Связывание Rac GTPase • связывание микротрубочек • связывание ионов цинка • связывание фактора транскрипции • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание Rho GTPase • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • везикул • цитозоль • аппарат Гольджи • проекция клетки • мембрана • очаговая адгезия • двухклеточное плотное соединение • шпиндель • клеточная мембрана • дендритный вал • мембрана с оборками • соединение клеток • тело нейрональной клетки • микротрубочки • цитоскелет • цитоплазматический пузырек • подосомы • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • макромолекулярный комплекс • глутаматергический синапс • постсинаптическая плотность, внутриклеточный компонент Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • отрицательная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на осмотический стресс • отрицательная регуляция некроптозного процесса • организация актиновых филаментов • иммунная система • отрицательная регуляция нейрогенеза • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • деление клеток • клеточный ответ на мурамилдипептид • клеточный гиперосмотический ответ • отрицательная регуляция деполимеризации микротрубочек • регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути через рецепторы домена смерти • клеточный морфогенез • установление ориентации митотического веретена • положительная регуляция продукции интерлейкина-6 • положительное регулирование выработки фактора некроза опухоли • положительная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина • клеточный цикл • регуляция передачи сигнала белка Rho • внутриклеточный транспорт белка • врожденная иммунная система • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция сборки подосом • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • положительная регуляция дифференцировки нейронов • асимметричное деление нейробластов • положительная регуляция миграции нейронов • развитие многоклеточного организма • развитие нервной системы • дифференциация клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9181	16800
Ансамбль	ENSG00000116584	ENSMUSG00000028059
UniProt	Q92974	Q60875
RefSeq (мРНК)	NM_001162383 NM_001162384 NM_004723 NM_001350110 NM_001350111 NM_001350112	NM_001198911 NM_001198912 NM_001198913 NM_008487 NM_001377126
RefSeq (белок)	NP_001155855 NP_001155856 NP_004714 NP_001337039 NP_001337040 NP_001337041	NP_001185840 NP_001185841 NP_001185842 NP_032513 NP_001364055
Расположение (UCSC)	Chr 1: 155.95 - 156.01 Мб	Chr 3: 88.61 - 88.65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 2 это белок что у людей кодируется ARHGEF2 ген.^[5][6][7]

Функция

Rho GTPases играют фундаментальную роль во многих клеточных процессах, которые инициируются внеклеточными стимулами, которые работают через рецепторы, связанные с G-белком. Кодируемый белок может образовывать комплекс с G-белками и стимулировать rho-зависимые сигналы.^[7]

Взаимодействия

ARHGEF2 было показано взаимодействовать с PAK1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116584 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028059 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рен Й, Ли Р., Чжэн И, Буш Х (февраль 1999 г.). «Клонирование и характеристика GEF-H1, фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, ассоциированного с микротрубочками, для Rac и Rho GTPases». J Biol Chem. 273 (52): 34954–60. Дои:10.1074 / jbc.273.52.34954. PMID  9857026.
6. Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
7. «Ген Entrez: фактор обмена rho / rac-гуанин-нуклеотида ARHGEF2 (GEF) 2».
8. Zenke FT, Krendel M, DerMardirossian C, King CC, Bohl BP, Bokoch GM (апрель 2004 г.). «p21-активированная киназа 1 фосфорилирует и регулирует связывание 14-3-3 с GEF-H1, фактором обмена Rho, локализованным в микротрубочках». J. Biol. Chem. 279 (18): 18392–400. Дои:10.1074 / jbc.M400084200. PMID  14970201.

внешняя ссылка

• Человек ARHGEF2 расположение генома и ARHGEF2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Эрхардт А., Эрхардт Г.Р., Гуо Х, Шредер Дж. В. (2002). «Рас и родственники - совместная работа и нетворкинг поддерживают старую семью». Exp. Гематол. 30 (10): 1089–106. Дои:10.1016 / S0301-472X (02) 00904-9. PMID  12384139.
• Редди А.Б., Чаттерджи А., Ротблюм Л.И., Блэк А., Буш Н. (1989). «Выделение и характеристика комплементарной ДНК для ядрышкового антигена P40 пролиферирующих клеток». Рак Res. 49 (7): 1763–7. PMID  2466560.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Гао Y, Xing J, Streuli M, Leto TL, Zheng Y (2002). «Trp (56) rac1 определяет взаимодействие с подмножеством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов». J. Biol. Chem. 276 (50): 47530–41. Дои:10.1074 / jbc.M108865200. PMID  11595749.
• Крендель М, Зенке Ф.Т., Бокоч Г.М. (2002). «Фактор обмена нуклеотидов GEF-H1 опосредует перекрестную связь между микротрубочками и актиновым цитоскелетом». Nat. Cell Biol. 4 (4): 294–301. Дои:10.1038 / ncb773. PMID  11912491.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б., Бауместер Т., Дрюс Г. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Штейн М.А., Бауэр А., Касари Дж., Дрюс Дж., Гэвин А.С., Джексон Д. Б., Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кустер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216.
• Zenke FT, Krendel M, DerMardirossian C, King CC, Bohl BP, Bokoch GM (2004). «p21-активированная киназа 1 фосфорилирует и регулирует связывание 14-3-3 с GEF-H1, фактором обмена Rho, локализованным в микротрубочках». J. Biol. Chem. 279 (18): 18392–400. Дои:10.1074 / jbc.M400084200. PMID  14970201.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Д. Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Callow MG, Zozulya S, Gishizky ML, Jallal B, Smeal T (2005). «PAK4 опосредует морфологические изменения посредством регуляции GEF-H1». J. Cell Sci. 118 (Pt 9): 1861–72. Дои:10.1242 / jcs.02313. PMID  15827085.
• Aijaz S, D'Atri F, Citi S, Balda MS, Matter K (2005). «Связывание GEF-H1 с адаптером, связанным с плотными контактами, цингулином, приводит к ингибированию передачи сигналов Rho и фазового перехода G1 / S». Dev. Клетка. 8 (5): 777–86. Дои:10.1016 / j.devcel.2005.03.003. PMID  15866167.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.