ARIH1 - ARIH1

ARIH1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WD2, 2М9Г, 4 КБЛ, 4KC9
Идентификаторы
Псевдонимы	ARIH1, ARI, HARI, HHARI, UBCH7BP, ariadne RBR E3 убиквитин протеин-лигаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605624 MGI: 1344363 ГомолоГен: 111871 Генные карты: ARIH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q24.1 Начинать 72,474,330 бп[1] Конец 72,602,987 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 млрд Начинать 59,388,258 бп[2] Конец 59,486,618 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность убиквитин-подобной протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность • связывание конъюгированного с убиквитином фермента • связывание ионов цинка Сотовый компонент • цитоплазма • убиквитинлигазный комплекс • цитозоль • ядро клетки • Тело Кахала • ядерное тело • SCF убиквитин-лигазный комплекс • Cul2-RING убиквитинлигазный комплекс • Cul3-RING убиквитинлигазный комплекс • Cul4A-RING E3 убиквитинлигазный комплекс • Тело Леви Биологический процесс • полиубиквитинирование белков • положительная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • убиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25820	23806
Ансамбль	ENSG00000166233	ENSMUSG00000025234
UniProt	Q9Y4X5	Q9Z1K5
RefSeq (мРНК)	NM_005744	NM_019927
RefSeq (белок)	NP_005735	NP_064311
Расположение (UCSC)	Chr 15: 72,47 - 72,6 Мб	Chr 9: 59.39 - 59.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог белка ариадне-1 это белок что у людей кодируется ARIH1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

Было показано, что ARIH1 взаимодействовать с:

• EIF4E2,^[7] и
• UBE2L3.^[5][7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166233 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025234 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мойнихан Т.П., Ардли ХК, Нубер У., Роуз С.А., Джонс П.Ф., Маркхэм А.Ф., Шеффнер М., Робинсон ПА (ноябрь 1999 г.). «Убиквитин-конъюгирующие ферменты UbcH7 и UbcH8 взаимодействуют с доменами HHARI и H7-AP1, содержащими RING finger / IBR». J Biol Chem. 274 (43): 30963–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30963. PMID  10521492.
6. «Ген Entrez: ARIH1 гомолог ариадны, убиквитин-конъюгированный фермент, связывающий белок E2, 1 (Drosophila)».
7. Тан Н.Г., Ардли Х.С., Скотт ГБ, Роуз С.А., Маркхэм А.Ф., Робинсон ПА (ноябрь 2003 г.). «Человеческий гомолог ариадна способствует убиквитилированию гомологичного белка фактора инициации трансляции 4E, 4EHP». FEBS Lett. 554 (3): 501–4. Дои:10.1016 / s0014-5793 (03) 01235-3. PMID  14623119.
8. Ardley HC, Tan NG, Rose SA, Markham AF, Robinson PA (июнь 2001 г.). «Характеристики паркин / ариадноподобной убиквитинлигазы, HHARI, которые регулируют ее взаимодействие с убиквитин-конъюгированным ферментом, Ubch7». J. Biol. Chem. 276 (22): 19640–7. Дои:10.1074 / jbc.M011028200. PMID  11278816.

внешняя ссылка

• Человек ARIH1 расположение генома и ARIH1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Агилера М., Оливерос М., Мартинес-Падрон М., Барбас Дж. А., Феррус А. (2000). «Ариадне-1: жизненно важный ген дрозофилы необходим в разработке и определяет новое консервативное семейство белков безымянного пальца». Генетика. 155 (3): 1231–44. ЧВК  1461160. PMID  10880484.
• Чжан Ю., Редина О., Альтшуллер Ю.М., Ямадзаки М., Рамос Дж., Чнейвейс Х., Канахо Ю., Фроман М.А. (2001). «Регулирование экспрессии фосфолипазы D1 и D2 с помощью PEA-15, нового белка, который с ними взаимодействует». J. Biol. Chem. 275 (45): 35224–32. Дои:10.1074 / jbc.M003329200. PMID  10926929.
• Тан Н.Г., Ардли ХК, Роуз С.А., Лик JP, Маркхэм А.Ф., Робинсон ПА (2001). «Характеристика человеческих и мышиных ортологов гена Drosophila ariadne». Cytogenet. Cell Genet. 90 (3–4): 242–5. Дои:10.1159/000056780. PMID  11124525.
• Stanchi F, Bertocco E, Toppo S, Dioguardi R, Simionati B, Cannata N, Zimbello R, Lanfranchi G, Valle G (2001). «Характеристика 16 новых генов человека, показывающих высокое сходство с последовательностями дрожжей». Дрожжи. 18 (1): 69–80. Дои:10.1002 / 1097-0061 (200101) 18: 1 <69 :: AID-YEA647> 3.0.CO; 2-H. PMID  11124703.
• Ардли ХК, Тан Н.Г., Роуз С.А., Маркхэм А.Ф., Робинсон ПА (2001). «Характеристики паркин / ариадноподобной убиквитинлигазы, HHARI, которые регулируют ее взаимодействие с убиквитин-конъюгированным ферментом, Ubch7». J. Biol. Chem. 276 (22): 19640–7. Дои:10.1074 / jbc.M011028200. PMID  11278816.
• Вонг ES, Фонг CW, Лим Дж., Юсофф П., Лоу BC, Лэнгдон, Вайоминг, Гай Г.Р. (2002). «Sprouty2 ослабляет убиквитилирование рецептора эпидермального фактора роста и эндоцитоз, и, следовательно, усиливает передачу сигналов Ras / ERK». EMBO J. 21 (18): 4796–808. Дои:10.1093 / emboj / cdf493. ЧВК  126289. PMID  12234920.
• Тан Н.Г., Ардли ХК, Скотт ГБ, Роуз С.А., Маркхэм А.Ф., Робинсон ПА (2003). «Человеческий гомолог ариадна способствует убиквитилированию гомологичного белка фактора инициации трансляции 4E, 4EHP». FEBS Lett. 554 (3): 501–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01235-3. PMID  14623119.
• Capili AD, Edghill EL, Wu K, Borden KL (2004). «Структура C-концевого пальца RING из мотива RING-IBR-RING / TRIAD обнаруживает новый цинк-связывающий домен, отличный от RING». J. Mol. Биол. 340 (5): 1117–29. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.05.035. PMID  15236971.
• Парелкар С.С., Кадена Дж. Г., Ким С., Ван З., Сугал Р., Бентли Б., Мораль Л., Ардли Х. С., Шварц Л. М. (2012). «Паркиноподобный человеческий гомолог Drosophila ariadne-1 (HHARI) может индуцировать образование агресом в клетках млекопитающих и иммунологически обнаруживается в тельцах Леви». J. Mol. Неврологи. 46 (1): 109–21. Дои:10.1007 / s12031-011-9535-1. PMID  21590270.