ARMCX5 - ARMCX5

ARMCX5 является броненосец повторить –Содержащий белок который закодирован Х-связанный Ген ARMCX5. Сохраняется только в Евтерия,[1] особая группа плацентарных млекопитающих, но не более ранней эволюции. ARMCX5 содержит 3 ARM-подобных повтора, DUF364 и складку типа ARM.[2]

Функции

Регистрационный номерNC_0002.10
ПсевдонимыFLJ12969, FLJ13382 и RP4-769N13.3
Хромосомное расположениеXq22.1-q22.3
Размер гена4991 пара оснований
размер мРНК2924 пары оснований
Размер белка588 аминокислот

[3]


Варианты соединения

ARMCX5 имеет 6 вариантов соединения.

Сплайсинг изоформа / вариант транскриптадлина последовательности мРНКРегистрационный номер
12924NM_001168479.1
22695NM_022838.3
32808NM_001168478.1
42918NM_001168480.1
52805NM_001168485.1
62707NM_001168482.1

[3]

ОРТОЛОГИ

ARMCX5 имеет десять ортологов.

Название рода ортологРаспространенное имяРегистрационный номерДлина последовательностиИдентичность последовательностиСходство последовательностей
Понго АбеллиОрангатуXP_002831961.154797.1%99%
Макака мулатаОбезьяна-резусEHH30927.155895.3%97%
Макака fascicularisКраб ест макакуEHH61076.155895%97%
Каллитрикс ЯкхОбыкновенная мартышкаXP_002763850.156889.4%93%
Equus CaballusЛошадьNC009175.260980%85%
Canis семейная волчанкасобакаXP_538116.260879%85%
Sus ScrofaОбыкновенная свиньяXP_003135327.273278%85%
Ориктолаг куникусОбыкновенный кроликXP_00272091.154776.8%85%
Раттус NorvegicusОбыкновенная крысаXP_001499348.256761.1%76%
Mus MusculusМышьNP_001009575.260657%71%

[4]

Паралоги

ARMCX5 имеет 8 паралоги перечислено генокартами: GPRASP2, ARMCX1, BHLHB9, ARMCX2, GPRASP1, ARMCX6, ARMCX10, и ARMCX3.[2]

Функция

Белки, содержащие этот домен ARMCX5, взаимодействуют с множеством других белков. Посредством этих взаимодействий они участвуют в большом количестве процессов, включая канцерогенез, контроль клеточного старения и выживаемости, регуляцию циркадного ритма и лизосомную сортировку рецепторов, связанных с G-белком.[2]

Поскольку DUF364 содержит PLP-зависимую трансферазоподобную складку, геномный контекст предполагает, что он может играть роль в анаэробном биосинтезе витамина B12.[5]

Выражение

ARMCX5 - это широко экспрессируемый ген, который проявил экспрессию во многих тканях.

Сайт телаСтенограмм на миллионGene EST / Total EST в пуле
Мозг2528/1092524
Костный мозг824/48711
Рот604/66139
Сосудистый583/51637
Селезенка563/53365
Молочная железа528/151228
Пищевод491/20152
Гортань421/23489
Трахеи382/51769
Мышцы374/106323
Семенники3311/327305

[6]

Рекомендации

  1. ^ «БЛАТ». UCSC Genome Bioinformatics.
  2. ^ а б c «ARMCX5». Генные карты.
  3. ^ а б «NCBI-нуклеотид».
  4. ^ "NCBI BLAST".
  5. ^ «NCBI-белок».
  6. ^ «Профили NCBI-EST».