ARMCX3 - ARMCX3

ARMCX3
Идентификаторы
Псевдонимы	ARMCX3, ALEX3, GASP6, dJ545K15.2, повтор броненосца, содержащий, X-связанный 3, повтор броненосный, содержащий X-связанный 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 300364 MGI: 1918953 ГомолоГен: 9588 Генные карты: ARMCX3
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.1 Начинать 101,622,797 бп[1] Конец 101,627,843 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X E3 Начинать 134,756,595 бп[2] Конец 134,761,455 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51566	71703
Ансамбль	ENSG00000102401	ENSMUSG00000049047
UniProt	Q9UH62	Q8BHS6
RefSeq (мРНК)	NM_016607 NM_177947 NM_177948	NM_027870 NM_001358520 NM_001358521
RefSeq (белок)	NP_057691 NP_808816 NP_808817 NP_057691.1 NP_808816.1 NP_808817.1	NP_082146 NP_001345449 NP_001345450
Расположение (UCSC)	Chr X: 101,62 - 101,63 Мб	Chr X: 134,76 - 134,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Х-связанный белок 3, содержащий повторы броненосца это белок что у людей кодируется ARMCX3 ген.^[5][6][7][8]

Этот ген кодирует член семейства белков ALEX, который может играть роль в подавление опухоли. Кодируемый белок содержит потенциальную N-концевой трансмембранный домен и один Армадилло повторяется. Другие белки, содержащие повтор руки, участвуют в развитии, поддержании целостности ткани и туморогенез. Этот ген тесно локализован с другими членами семьи на Х хромосома. Для этого гена были идентифицированы три варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102401 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000049047 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Курочкин И.В., Йонемицу Н., Фунахаши С.И., Номура Н. (февраль 2001 г.). «ALEX1, новый белок с повторами броненосца человека, который дифференциально экспрессируется в нормальных тканях и карциномах». Biochem Biophys Res Commun. 280 (1): 340–7. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4125. PMID  11162520.
6. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
7. Mou Z, Tapper AR, Gardner PD (май 2009 г.). «Белок, содержащий повторы Armadillo, ARMCX3, физически и функционально взаимодействует с фактором регуляции развития Sox10». J Biol Chem. 284 (20): 13629–40. Дои:10.1074 / jbc.M901177200. ЧВК  2679464. PMID  19304657.
8. «Ген Entrez: содержащий повтор броненосца ARMCX3, X-связанный 3».

внешняя ссылка

• Человек ARMCX3 расположение генома и ARMCX3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемой последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.