ARMCX6 - ARMCX6
| ARMCX6 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ARMCX6, GASP10, повтор броненосца, содержащий, X-связанный 6, повтор броненосный, содержащий X-связанный 6 | ||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | MGI: 2147993 ГомолоГен: 10373 Генные карты: ARMCX6 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
| Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ансамбль | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (белок) | |||||||||||||||||||||||||
| Расположение (UCSC) | Chr X: 101,62 - 101,62 Мб | Chr X: 134,75 - 134,75 Мб | |||||||||||||||||||||||
| PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Повтор Armadillo, содержащий X-связанный 6 это белок что у людей кодируется ARMCX6 ген расположен на Х-хромосоме.[5]
Это один из шести броненосец повторяет содержащие Х-связанные белки (ARMCX1, ARMCX2, ARMCX3, ARMCX4, ARMCX5, и ARMCX6 (этот белок)).
Функция этого белка в настоящее время неизвестна.
Белковая последовательность
1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 301 FMSLFIRNGN REILLETPAP
Гомология
ARMCX6 консервативен у многих эукариотических организмов.
Ортологи
| таксономическое название | распространенное имя | Запись NCBI | Процент сходства последовательностей | Длина (AA) | Комментарии |
| Homo sapiens | Человек | [2] | 100% | 300 | повтор броненосца, содержащий X-связанный 6 |
| Macaca mulatta | Обезьяна-резус | [3] | 97.0% | 300 | ПРОГНОЗИРОВАННЫЙ: аналогично повторению амрмадилло, содержащему X-связанную 6 (H. sapiens) -подобную изоформу 1 |
| Equus caballus | Лошадь | [4] | 90.0% | 300 | ПРЕДНАЗНАЧЕН: аналогично повторению броненосца, содержащему X-связанный 6 |
| Данио Рерио | данио | [5] | 84.0% | 301 | Похож на RIKEN cDNA 0610039K22 |
| Mus musculus | Дом мышь | [6] | 97.7% | 393 | содержащий повтор броненосца, Х-связанный 6 (H. sapiens) -подобный |
| Bos taurus | корова | [7] | 83.0% | 301 | содержащий повтор броненосца, Х-связанный 6 |
| Mus musculus | Мышь | [8] | 82.0% | 301 | содержащий повтор броненосца, Х-связанный 6 |
| Такифугу рубрипс | Tetradontoidea | [9] | 66.0% | 818 | арилуглеводородный рецептор 2C |
| Caenorhabditis elegans | C. elegans | [10] | 50.0% | 332 | Змеиный рецептор, член семейства класса H (srh-216) |
| Saccharomyces cerevisiae | Дрожжи | [11] | 70.0% | 910 | Hul5p |
| Gallus gallus | Курица | [12] | 52.0% | 317 | ПРОГНОЗ: гипотетический белок |
Вторичная структура
В вторичная структура ARMCX6, как предполагается, будет похож на цианазу. Сравнение двух последовательностей показано ниже.[6][7]
10 20 30 40 .... * .... | .... * .... | .... * .... | .... * .... | .... *. .ARMCX6 231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 2771DW9_A 19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65 + + ++ + + + + ++ + + +
Сегмент цианазы, идентичный ARMCX6.
Выражение
Данные микрочипов показывают, что ARMCX6 высоко экспрессируется на самых ранних стадиях сперматогенеза у мышей.[8][9][10]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198960 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050394 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Entrez Gene: повторение броненосца, содержащее".
- ^ SDSC Biology Workbench 2.0
- ^ [1]
- ^ EST Profile Viewer - Человек
- ^ EST Profile Viewer - Мышь
- ^ Су А.И., Уилтшир Т., Баталов С., Лапп Х. и др. (Апрель 2004 г.). «Атлас генов транскриптомов, кодирующих белки человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (16): 6062–7. Дои:10.1073 / pnas.0400782101. ЧВК 395923. PMID 15075390.
внешняя ссылка
- Человек ARMCX6 расположение генома и ARMCX6 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК 2665286. PMID 15772651.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
 | Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |