Мотив РНК АТПК - ATPC RNA motif - Wikipedia

Мотив РНК АТПК
Вторичная структура ATPC.jpg
Идентификаторы
СимволATPC
РфамRF01067
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0001263
PDB структурыPDBe

В Мотив РНК АТПК консервированный РНК структура найдена в некоторых цианобактерии.[1] Это очевидно повсеместно в Prochlorococcus marinus, и присутствует у многих видов рода Синехококк. РНК всегда находится внутри оперон кодирующие субъединицы АТФ-синтаза, и он всегда располагается ниже гена, кодирующего субъединицу А АТФ-синтазы, и выше гена Субъединица С ген. Это место соответствует цис-регуляторный элемент, но также с некодирующая РНК который транскрибируется генами АТФ-синтазы.

Простые структуры РНК, называемые стебель-петли были обнаружены в оперонах АТФ-синтазы различных цианобактерий,[2] но не структуры, такие как 3-стержневое соединение, которое является основным признаком мотива РНК АТПК.

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Баррик Дж. Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 кандидатных структурированных РНК в бактериях с использованием системы сравнительной геномики CMfinder». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (14): 4809–4819. Дои:10.1093 / нар / гкм487. ЧВК  1950547. PMID  17621584.
  2. ^ Кертис С.Е. (1988). «Структура, организация и экспрессия генов АТФ-синтазы цианобактерий». Фотосинт. Res. 18 (1–2): 223–244. Дои:10.1007 / BF00042986. PMID  24425167.

внешняя ссылка