Гомолог 3 Alkb, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа - Alkb homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase - Wikipedia

ALKBH3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2IUW
Идентификаторы
Псевдонимы	ALKBH3, ABH3, DEPC-1, DEPC1, PCA1, hABH3, гомолог 3 alkB, альфа-кетоглутарат-зависимая диоксигеназа, гомолог 3 alkB, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа, гомолог 3 alkB, альфа-кетоглутарат-зависимая диоксигеназа
Внешние идентификаторы	OMIM: 610603 MGI: 1916363 ГомолоГен: 16393 Генные карты: ALKBH3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p11.2 Начинать 43,880,811 бп[1] Конец 43,920,274 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E1 Начинать 93,980,550 бп[2] Конец 94,010,807 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание L-аскорбиновой кислоты • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • ДНК-N1-метиладениндиоксигеназная активность • оксидоредуктазная активность • связка двухвалентного железа • Активность РНК N1-метиладенозиндиоксигеназы • оксидоредуктазная активность, действующая на парные доноры, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, 2-оксоглутарат в качестве одного донора и включение одного атома кислорода в оба донора • активность цитозин-C-5 ДНК-деметилазы Сотовый компонент • ядро клетки • митохондрия • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • окислительно-восстановительный процесс • клеточная пролиферация • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Деалкилирование ДНК участвует в репарации ДНК • окислительное деметилирование одноцепочечной ДНК • окислительное деметилирование одноцепочечной РНК • Ремонт ДНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	221120	69113
Ансамбль	ENSG00000166199	ENSMUSG00000040174
UniProt	Q96Q83	Q8K1E6
RefSeq (мРНК)	NM_139178	NM_026944
RefSeq (белок)	NP_631917	NP_081220
Расположение (UCSC)	Chr 11: 43,88 - 43,92 Мб	Chr 2: 93.98 - 94.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог 3 AlkB, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа это белок что у человека кодируется ALKBH3 ген.^[5]

Функция

Белок Escherichia coli AlkB защищает от цитотоксичности метилирующих агентов путем репарации специфических повреждений ДНК, образовавшихся в одноцепочечной ДНК. ALKBH2 (MIM 610602) и ALKBH3 являются гомологами AlkB E. coli, которые катализируют удаление 1-метиладенина и 3-метилцитозина (Duncan et al., 2002 [PubMed 12486230]).

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166199 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040174 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гомолог 3 AlkB, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа». Получено 2017-03-04.

дальнейшее чтение

• Sundheim O, Vågbø CB, Bjørås M, Sousa MM, Talstad V, Aas PA, Drabløs F, Krokan HE, Tainer JA, Slupphaug G (2006). «Структура человеческого ABH3 и ключевые остатки для окислительного деметилирования для устранения повреждений ДНК / РНК». EMBO J. 25 (14): 3389–97. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601219. ЧВК  1523172. PMID  16858410.
• Лю Б.К., Ву Ю.Д., Ли П.Х., Вэй Дж.С., Чжан Т., Лю Р.Л. (2007). «Антиген-1 рака простаты как потенциальный новый маркер рака простаты». Азиат Дж. Андрол. 9 (6): 821–6. Дои:10.1111 / j.1745-7262.2007.00279.x. PMID  17968469.
• Monsen VT, Sundheim O, Aas PA, Westbye MP, Sousa MM, Slupphaug G, Krokan HE (2010). «Дивергентные ß-шпильки определяют распознавание двухцепочечного субстрата по сравнению с одноцепочечным субстратом для человеческих гомологов 2 и 3 AlkB». Нуклеиновые кислоты Res. 38 (19): 6447–55. Дои:10.1093 / nar / gkq518. ЧВК  2965238. PMID  20525795.
• Чен Б., Лю Х., Сунь X, Ян К.Г. (2010). «Механистическое понимание распознавания одноцепочечных и двухцепочечных ДНК-субстратов ABH2 и ABH3». Мол Биосист. 6 (11): 2143–9. Дои:10.1039 / c005148a. PMID  20714506.
• Малки К., Ухер Р., Пайя-Кано Дж., Биндер Е., Ритчел М., Зобель А., Морс О, Хаузер Дж., Хенигсберг Н., Джерман Б., Суэри Д., Плацентино А, Нг М.Я., Коэн-Вудс С., Слейтер Ф., фермер A, Эйчисон К.Дж., Крейг И.В., Льюис К.М., Макгаффин П., Шалквик Л.К. (2011). «Конвергентные данные, полученные от животных и людей, предполагают роль гена PPM1A в ответе на антидепрессанты». Биол. Психиатрия. 69 (4): 360–5. Дои:10.1016 / j.biopsych.2010.08.011. PMID  20970119. S2CID  41571515.
• Тасаки М, Шимада К., Кимура Х, Цудзикава К., Кониси Н. (2011). «ALKBH3, гомолог AlkB человека, способствует выживанию клеток при немелкоклеточном раке легкого человека». Br. J. Рак. 104 (4): 700–6. Дои:10.1038 / sj.bjc.6606012. ЧВК  3049579. PMID  21285982.
• Данго С., Мосаммапараст Н., Сова М.Э., Сюн Л.Дж., Ву Ф., Парк К., Рубин М., Гиги С., Харпер Дж. В., Ши Й. (2011). «Раскручивание ДНК с помощью геликазы ASCC3 связано с ALKBH3-зависимой репарацией алкилирования ДНК и пролиферацией раковых клеток». Мол. Клетка. 44 (3): 373–84. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.08.039. ЧВК  3258846. PMID  22055184.
• Койке К., Уэда Й, Хасэ Х, Китае К., Фусамае Й, Масаи С., Инагаки Т., Сайго Ю., Хирасава С., Накадзима К., Охшио И., Макино И., Кониси Н., Ямамото Х, Цудзикава К. (2012). «Противоопухолевый эффект нокдауна AlkB гомолога 3 в гормононезависимых раковых клетках простаты». Цели лекарств от рака Curr. 12 (7): 847–56. Дои:10.2174/156800912802429283. PMID  22515525.
• Ямато И., Шо М., Шимада К., Хотта К., Уэда Й, Ясуда С., Шиги Н., Кониси Н., Цудзикава К., Накадзима Ю. (2012). «PCA-1 / ALKBH3 способствует развитию рака поджелудочной железы, поддерживая устойчивость к апоптозу и ангиогенез». Рак Res. 72 (18): 4829–39. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-12-0328. PMID  22826605.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.