Аргининдеиминаза - Arginine deiminase

аргининдеиминаза
Идентификаторы
Номер ЕС	3.5.3.6
Количество CAS	9027-98-9
Базы данных
IntEnz	Просмотр IntEnz
БРЕНДА	BRENDA запись
ExPASy	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	Запись в KEGG
MetaCyc	метаболический путь
ПРИАМ	профиль
PDB структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	AmiGO / QuickGO
Поиск ЧВК статьи PubMed статьи NCBI белки

В энзимология, аргининдеиминаза (EC 3.5.3.6 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

L-аргинин + H₂О ${displaystyle ightleftharpoons }$ L-цитруллин + NH₃

Таким образом, два субстраты этого фермента L-аргинин и ЧАС₂О, а его два товары находятся L-цитруллин и NH₃.

Этот фермент принадлежит к семейству гидролазы, те, которые действуют на связи углерод-азот, отличные от пептидных связей, особенно в линейных амидинах. В систематическое название этого класса ферментов L-аргинин иминогидролаза. Другие широко используемые имена включают аргинин дигидролаза, цитруллин иминаза, и L-аргинин деиминаза. Этот фермент участвует в метаболизм аргинина и пролина. Этот фермент широко экспрессируется в бактериях, включая стрептококк и актиномицеты. Экспрессия бактериальной аргининдезиминазы может регулироваться различными факторами окружающей среды.

Недавно появился новый фермент который катализирует то химическая реакция

L-аргинин + 2H₂О ${displaystyle ightleftharpoons }$ L-орнитин + 2NH₃ + CO₂ был идентифицирован в цианобактерии^[1] который следует назвать как аргинин дигидролаза.

Структурные исследования

На конец 2007 г. 7 структуры были решены для этого класса ферментов, с PDB коды доступа 1LXY, 1RXX, 1S9R, 2A9G, 2AAF, 2ABR, и 2ACI.

Рекомендации

1. Чжан Х, Лю Й.Дж., Не XQ, Лю LX, Хуа Ц., Чжао ГП, Ян С. (апрель 2018 г.). «Цианобактериальный орнитин-аммиачный цикл включает аргининдигидролазу». Природа Химическая Биология. 14 (6): 575–581. Дои:10.1038 / s41589-018-0038-z. PMID  29632414. S2CID  4937151.

• ОГИНСКИЙ Е.Л., ГЕРИГ РФ (1952). «Аргининдигидролазная система Streptococcus faecalis. II Свойства аргининдезимидазы». J. Biol. Chem. 198 (2): 799–805. PMID  12999797.
• ЛИУ И, БЕРН РА (2009). «Множественные двухкомпонентные системы модулируют образование щелочи в Streptococcus gordonii в ответ на стрессы окружающей среды». J. Bacteriol. 191 (23): 7353–7362. Дои:10.1128 / JB.01053-09. ЧВК  2786566. PMID  19783634.
• ПЕТРАК Б, СУЛЛИАН Л., НАЗАД S (1957). «Поведение очищенной аргининдезиминазы из S. faecalis». Arch. Biochem. Биофизы. 69: 186–197. Дои:10.1016 / 0003-9861 (57) 90485-X. PMID  13445192.
• РАТНЕР С (1954). Синтез мочевины и метаболизм аргинина и цитруллина. Adv. Энзимол. Relat. Subj. Биохим. Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. 15. С. 319–87. Дои:10.1002 / 9780470122600.ch8. ISBN  9780470122600. PMID  13158183.
• ЛИУ И, БЕРН РА (2008). «Экологическая регуляция и регуляция фазы роста генов аргининдезиминазы Streptococcus gordonii». Appl Environ Microbiol. 74 (16): 5023–5030. Дои:10.1128 / AEM.00556-08. ЧВК  2519279. PMID  18552185.