Азуроцидин 1 - Azurocidin 1

AZU1
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A7S, 1AE5, 1FY1, 1ФГ3
Идентификаторы
Псевдонимы	AZU1, AZAMP, AZU, CAP37, HBP, HUMAZUR, NAZC, hHBP, азуроцидин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 162815 ГомолоГен: 74404 Генные карты: AZU1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 825,097 бп[1] Конец 832,018 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гепарина • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • гепарансульфат связывание протеогликанов • связывание токсичных веществ • активность эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • мембрана • азурофильная гранула • мембрана азурофильных гранул • внеклеточная экзосома • внешний компонент мембраны • внеклеточная область • внеклеточный • просвет азурофильных гранул Биологический процесс • положительная регуляция биосинтетического процесса MHC класса II • положительная регуляция фагоцитоза • отрицательная регуляция апоптотического процесса • передача сигналов протеинкиназы C • активация микроглиальных клеток • протеолиз • индукция положительного хемотаксиса • активация моноцитов • хемотаксис • регулирование проницаемости сосудов • положительная регуляция экспрессии генов • хемотаксис макрофагов • сигнальный путь рецептора, активирующего протеинкиназу С, сопряженного с G-белком • защитная реакция на бактерию • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • нейтрофил-опосредованное уничтожение бактерий • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • хемотаксис клеток • клеточная экстравазация • воспалительная реакция • кальций-опосредованная передача сигналов с использованием внутриклеточного источника кальция • миграция глиальных клеток • положительная регуляция клеточной адгезии • положительная регуляция активности протеинкиназы • дегрануляция нейтрофилов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	566	н / д
Ансамбль	ENSG00000278624 ENSG00000172232	н / д
UniProt	P20160	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001700	н / д
RefSeq (белок)	NP_001691	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 0,83 - 0,83 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Азуроцидин также известный как катионный антимикробный белок CAP37 или же гепарин-связывающий белок (HBP) - это белок что у людей кодируется AZU1 ген.^[3][4]

Функция

Азурофильные гранулы, специализированный лизосомы из нейтрофил, содержат не менее 10 белков, участвующих в уничтожении микроорганизмов. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой антимикробный белок азурофильных гранул, обладающий хемотаксической и антибактериальной активностью моноцитов. Это также важный многофункциональный медиатор воспаления.^[5] Гены, кодирующие этот белок, эластазу 2 нейтрофилов и протеиназу 3, находятся в кластере, расположенном на хромосоме 19pter. Все 3 гена экспрессируются согласованно, и их белковые продукты упаковываются вместе в гранулы азурофилов во время дифференцировки нейтрофилов.^[4]

Структура

Сравнение структуры азуроцидина 1 (псевдопротеазы) и химотрипсина (функциональная протеаза) того же суперсемейства

Этот кодируемый белок является членом клана протеаз PA, но не сериновой протеиназой, потому что остатки серина и гистидина в активном центре заменены, что делает его псевдофермент.^[6]

Клиническое значение

У пациентов с лихорадкой высокий уровень HBP в плазме указывает на то, что пациент находится в группе высокого риска развития сепсис с кровообращение.^[7]

Рекомендации

1. ENSG00000172232 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278624, ENSG00000172232 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Morgan JG, Sukiennicki T, Pereira HA, Spitznagel JK, Guerra ME, Larrick JW (ноябрь 1991 г.). «Клонирование кДНК гомолога сериновой протеазы CAP37 / азуроцидин, микробицидного и хемотаксического белка из гранулоцитов человека». J Immunol. 147 (9): 3210–4. PMID  1919011.
4. «Ген Entrez: азуроцидин 1 AZU1 (катионный антимикробный белок 37)».
5. Зёнляйн, Оливер; Линдбом, Леннарт (2009). «Азуроцидин, полученный из нейтрофилов, вызывает тревогу у иммунной системы». Журнал биологии лейкоцитов. 85 (3): 344–351. Дои:10.1189 / jlb.0808495. ISSN  1938-3673. PMID  18955543. S2CID  23637918.
6. Иверсен, Л. Ф .; Kastrup, J. S .; Bjørn, S.E .; Расмуссен, П. Б .; Wiberg, F.C .; Flodgaard, H.J .; Ларсен, И. К. (1997). «Структура HBP, многофункционального белка со складкой сериновой протеиназы». Структурная биология природы. 4 (4): 265–268. Дои:10.1038 / nsb0497-265. ISSN  1072-8368. PMID  9095193. S2CID  19949043.
7. Линдер А., Кристенсон Б., Хервальд Х., Бьорк Л., Акессон П. (октябрь 2009 г.). «Гепарин-связывающий белок: ранний маркер недостаточности кровообращения при сепсисе». Clin. Заразить. Dis. 49 (7): 1044–50. Дои:10.1086/605563. PMID  19725785.

внешняя ссылка

• Человек AZU1 расположение генома и AZU1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Morgan JG, Pereira HA, Sukiennicki T, et al. (1992). «Катионный белок CAP37 гранул нейтрофилов человека представляет собой специфический хемотаксин макрофагов, который имеет гомологию с воспалительными протеиназами». Adv. Exp. Med. Биол. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 305: 89–96. Дои:10.1007/978-1-4684-6009-4_11. ISBN  978-1-4684-6011-7. PMID  1755383.
• Ваторек В. (2004). «Азуроцидин - неактивный гомолог сериновой протеиназы, действующий как многофункциональный медиатор воспаления». Acta Biochim. Pol. 50 (3): 743–52. Дои:10.18388 / abp.2003_3665. PMID  14515154.
• Циммер М., Медкалф Р.Л., Финк TM и др. (1992). «Три гена, подобных эластазе человека, координированно экспрессируемые в линии миеломоноцитов, организованы как единый генетический локус на 19-м уровне».. Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (17): 8215–9. Дои:10.1073 / пнас.89.17.8215. ЧВК  49888. PMID  1518849.
• Грин Б.Г., Уэстон Х., Эш Б.М. и др. (1991). «Эластазы PMN: сравнение специфичности изоферментов человека и ферментов других видов по отношению к субстратам и ингибиторам». Arch. Biochem. Биофизы. 286 (1): 284–92. Дои:10.1016 / 0003-9861 (91) 90042-Н. PMID  1897955.
• Flodgaard H, Ostergaard E, Bayne S и др. (1991). «Ковалентная структура двух новых нейтрофильных лейкоцитарных белков свиного и человеческого происхождения. Нейтрофильные гомологи эластазы с сильной хемотаксической активностью моноцитов и фибробластов». Евро. J. Biochem. 197 (2): 535–47. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb15942.x. PMID  2026172.
• Алмейда Р.П., Мельхиор М., Кампанелли Д. и др. (1991). «Дополнительная последовательность ДНК нейтрофилов человека азуроцидина, антибиотика с обширной гомологией с сериновыми протеазами». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 177 (2): 688–95. Дои:10.1016 / 0006-291X (91) 91843-2. PMID  2049091.
• Поль Дж., Перейра Х.А., Мартин Н.М., Шпицнагель Дж. К. (1990). «Аминокислотная последовательность CAP37, антибактериального и моноцит-специфичного хемотаксического гликопротеина, полученного из гранул нейтрофилов человека, структурно аналогичного эластазе нейтрофилов». FEBS Lett. 272 (1–2): 200–4. Дои:10.1016 / 0014-5793 (90) 80484-Z. PMID  2226832. S2CID  36779510.
• Кампанелли Д., Детмерс П.А., Натан С.Ф., Габай Д.Э. (1990). «Азуроцидин и гомологичная сериновая протеаза из нейтрофилов. Разные антимикробные и протеолитические свойства». J. Clin. Вкладывать деньги. 85 (3): 904–15. Дои:10.1172 / JCI114518. ЧВК  296509. PMID  2312733.
• Pereira HA, Shafer WM, Pohl J, et al. (1990). «CAP37, хемотаксический фактор человеческого нейтрофила со специфической активностью моноцитов». J. Clin. Вкладывать деньги. 85 (5): 1468–76. Дои:10.1172 / JCI114593. ЧВК  296594. PMID  2332502.
• Уайлд CG, Снабл JL, Гриффит JE, Скотт RW (1990). «Характеристика двух протеаз гранул азурфилов с гомологией активного центра с эластазой нейтрофилов». J. Biol. Chem. 265 (4): 2038–41. PMID  2404977.
• Pereira HA, Spitznagel JK, Pohl J, et al. (1990). «CAP 37, катионный белок нейтрофильных гранул человека массой 37 кДа, имеет гомологию с воспалительными протеиназами». Life Sci. 46 (3): 189–96. Дои:10.1016 / 0024-3205 (90) 90104-У. PMID  2406527.
• Габай Дж. Э., Скотт Р. В., Кампанелли Д. и др. (1989). «Антибиотические белки полиморфно-ядерных лейкоцитов человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (14): 5610–4. Дои:10.1073 / pnas.86.14.5610. ЧВК  297672. PMID  2501794.
• Перейра Х.А., Эрдем I, Поль Дж., Шпицнагель Дж. К. (1993). "Синтетический бактерицидный пептид на основе CAP37: катионный антимикробный белок, связанный с гранулами нейтрофилов человека 37 кДа, хемотаксис для моноцитов". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (10): 4733–7. Дои:10.1073 / пнас.90.10.4733. ЧВК  46587. PMID  8506327.
• Чертов О., Михиль Д.Ф., Сюй Л. и др. (1996). «Идентификация дефенсина-1, дефенсина-2 и CAP37 / азуроцидина как хемоаттрактантных белков Т-клеток, высвобождаемых из нейтрофилов, стимулированных интерлейкином-8». J. Biol. Chem. 271 (6): 2935–40. Дои:10.1074 / jbc.271.6.2935. PMID  8621683.
• Иверсен Л. Ф., Каструп Дж. С., Бьорн С. Е. и др. (1997). «Структура HBP, многофункционального белка со складкой сериновой протеиназы». Nat. Struct. Биол. 4 (4): 265–8. Дои:10.1038 / nsb0497-265. PMID  9095193. S2CID  19949043.
• Карлсен С., Иверсен Л.Ф., Ларсен И.К. и др. (1998). «Структура атомного разрешения HBP / CAP37 / азуроцидина человека». Acta Crystallogr. D. 54 (Pt 4): 598–609. Дои:10.1107 / S0907444997016193. PMID  9761855.
• Олофссон AM, Вестберг М., Хервальд Х. и др. (1999). «Гепарин-связывающий белок, нацеленный на митохондриальные компартменты, защищает эндотелиальные клетки от апоптоза». J. Clin. Вкладывать деньги. 104 (7): 885–94. Дои:10.1172 / JCI6671. ЧВК  408551. PMID  10510329.
• Линдмарк А., Гарвич Д., Расмуссен П.Б. и др. (1999). «Характеристика биосинтеза, обработки и сортировки человеческого HBP / CAP37 / азуроцидина». J. Leukoc. Биол. 66 (4): 634–43. Дои:10.1002 / jlb.66.4.634. PMID  10534120. S2CID  27897421.