BED цинковый палец - BED zinc finger
| zf-кровать | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура раствора домена цинкового пальца BED домена цинкового пальца, содержащего белок 1 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | zf-кровать | ||||||||
| Pfam | PF02892 | ||||||||
| Pfam клан | CL0361 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003656 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии Домен с цинковыми пальцами типа BED это белковый домен который был назван в честь Дрозофила белки БЫТЬAF и DREF находится в одной или нескольких копиях в сотовый регулирующий факторы и транспозиции из растений, животные и грибы. Размер пальца BED составляет от 50 до 60 аминокислота остатки домен, содержащий характерный мотив с двумя очень консервативный ароматические позиции, а также общий образец цистеины и гистидины предсказано, что он образует цинковый палец. Поскольку различные пальцы BED способны связывать ДНК, было высказано предположение, что связывание с ДНК является общей функцией этого домена.[1] Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен BED, включают животные, растение и грибы AC1 и Hobo-подобные транспозазы; Caenorhabditis elegans Белок Dpy-20, предсказанный кутикулярный ген транскрипционный регулятор; Drosophila BEAF (фактор, связанный с граничными элементами), который, как полагают, участвует в изоляции хроматина; Drosophila DREF, регулятор транскрипции генов S-фазы; и табак 3AF1 и E4 / E8-BP1 томата, белки связывания ДНК, регулируемые светом и этиленом, которые содержат два пальца BED. Считается, что большинство генов этого семейства произошли от шляпа семья Транспозоны ДНК.[2]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Аравинд Л (сентябрь 2000 г.). «Палец BED, новый ДНК-связывающий домен в белках и транспозазах, связывающих граничные элементы хроматина». Тенденции в биохимических науках. 25 (9): 421–3. Дои:10.1016 / s0968-0004 (00) 01620-0. PMID 10973053.
- ^ Хейворд, Александр; Газаль, Авайса; Андерссон, Горан; Андерссон, Лейф; Джерн, Патрик; Робинсон-Рехави, Марк (22 марта 2013 г.). «Эволюция ZBED: многократное использование транспозонов ДНК в качестве регуляторов разнообразных функций хозяина». PLOS ONE. 8 (3): e59940. Дои:10.1371 / journal.pone.0059940. ЧВК 3606216. PMID 23533661.