BIRC7 - BIRC7

BIRC7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OXN, 1OXQ, 1OY7, 1TW6, 2I3H, 2I3I, 3F7G, 3F7H, 3F7I, 3GT9, 3GTA, 3UW5, 4AUQ
Идентификаторы
Псевдонимы	BIRC7, KIAP, LIVIN, ML-IAP, MLIAP, RNF50, бакуловирусный повтор IAP, содержащий 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 605737 MGI: 2676458 ГомолоГен: 51405 Генные карты: BIRC7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.33 Начните 63,235,883 бп[1] Конец 63,240,495 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H4 Начните 180,929,023 бп[2] Конец 180,934,010 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • трансферазная активность • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • аппарат Гольджи • ядро клетки • центр организации микротрубочек • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция активности пептидазы • активация активности киназы JUN • ингибирование активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • отрицательная регуляция апоптотического процесса • регуляция процесса апоптоза естественных клеток-киллеров • сборка митотического веретена • регулирование пролиферации клеток • регулирование передачи сигнала • убиквитинирование белков • апоптотический процесс • положительная регуляция убиквитинирования белков • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	79444	329581
Ансамбль	ENSG00000101197	ENSMUSG00000038840
UniProt	Q96CA5	A2AWP0
RefSeq (мРНК)	NM_139317 NM_022161	NM_001163247
RefSeq (белок)	NP_071444 NP_647478	NP_001156719
Расположение (UCSC)	Chr 20: 63.24 - 63.24 Мб	Chr 2: 180.93 - 180.93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бакуловирусный белок 7, содержащий повторы IAP это белок что у людей кодируется BIRC7 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства ингибиторов белков апоптоза (IAP) и содержит единственную копию бакуловирусного повтора IAP (BIR), а также домен цинкового пальца типа RING. Домен BIR необходим для ингибирующей активности и взаимодействует с каспазами, тогда как домен пальца RING иногда усиливает антиапоптотическую активность, но не ингибирует только апоптоз. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. Две изоформы обладают разными антиапоптотическими свойствами: изоформа альфа защищает клетки от апоптоза, вызванного стауроспорином, а изоформа b защищает клетки от апоптоза, индуцированного этопозидом.^[7]В меланома, Экспрессия гена BIRC7 регулируется Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией.^[8][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101197 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038840 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kasof GM, Gomes BC (май 2001 г.). «Ливин, новый ингибитор члена семейства белков апоптоза». J Biol Chem. 276 (5): 3238–46. Дои:10.1074 / jbc.M003670200. PMID  11024045.
6. Линь Дж. Х., Дэн Дж., Хуанг К., Морсер Дж. (Февраль 2001 г.). «KIAP, новый член семейства ингибиторов апоптоза». Biochem Biophys Res Commun. 279 (3): 820–31. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4027. PMID  11162435.
7. "Ген Entrez: BIRC7 бакуловирусный повтор IAP, содержащий 7 (ливин)".
8. Динек Дж. Н., Чан С. М., Лю Дж. И др. (2008). «Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией, является важным регулятором транскрипции меланомы, ингибитор апоптоза в меланомах». Рак Res. 68 (9): 3124–32. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6622. PMID  18451137.
9. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Пигментная клетка Melanoma Res. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.

внешние ссылки

• Человек BIRC7 расположение генома и BIRC7 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Бавыкин А.С., Коротаева А.А., Поярков С.В. и др. (2013). «Двойное нацеливание на миРНК cIAP2 и LIVIN приводит к синергетической сенсибилизации клеток HCT-116 к лечению оксалиплатином». OncoTargets Ther. 6 (6): 1333–40. Дои:10.2147 / OTT.S44893. ЧВК  3789649. PMID  24098083.
• Vucic D, Stennicke HR, Pisabarro MT, et al. (2001). «ML-IAP, новый ингибитор апоптоза, который предпочтительно экспрессируется в меланомах человека». Curr. Биол. 10 (21): 1359–66. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00781-8. PMID  11084335. S2CID  10381671.
• Ашхаб И., Алиан А., Поллиак А. и др. (2001). «Два варианта сплайсинга нового ингибитора гена апоптоза с разными биологическими свойствами и характером распределения в тканях». FEBS Lett. 495 (1–2): 56–60. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02366-3. PMID  11322947. S2CID  46380628.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Вучич Д., Дешайес К., Акерли Х. и др. (2002). «SMAC негативно регулирует антиапоптотическую активность ингибитора апоптоза меланомы (ML-IAP)». J. Biol. Chem. 277 (14): 12275–9. Дои:10.1074 / jbc.M112045200. PMID  11801603.
• Санна М.Г., да Силва Коррейя Дж., Дукрей О. и др. (2002). «Подавление апоптоза IAP включает различные механизмы: сигнальный каскад TAK1 / JNK1 и ингибирование каспаз». Мол. Cell. Биол. 22 (6): 1754–66. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1754-1766.2002. ЧВК  135597. PMID  11865055.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Газзанига П., Градилон А., Джулиани Л. и др. (2003). «Экспрессия и прогностическое значение LIVIN, SURVIVIN и других генов, связанных с апоптозом, в прогрессировании поверхностного рака мочевого пузыря». Анна. Онкол. 14 (1): 85–90. Дои:10.1093 / annonc / mdg002. PMID  12488298.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Црнкович-Мертенс I, Хоппе-Зейлер Ф, Бутц К. (2004). «Индукция апоптоза в опухолевых клетках посредством siRNA-опосредованного подавления гена livin / ML-IAP / KIAP». Онкоген. 22 (51): 8330–6. Дои:10.1038 / sj.onc.1206973. PMID  14614456.
• Андерсен М.Х., Рекер С., Беккер Дж. К., Тор Стратен П. (2004). «Меланомный ингибитор апоптозного белка: мишень для спонтанных цитотоксических Т-клеточных ответов». J. Invest. Дерматол. 122 (2): 392–9. Дои:10.1046 / j.0022-202X.2004.22242.x. PMID  15009721.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Танабе Х., Ягихаши А., Цуджи Н. и др. (2005). «Экспрессия мРНК сурвивина и мРНК ливина при немелкоклеточном раке легкого». Рак легких. 46 (3): 299–304. Дои:10.1016 / j.lungcan.2004.05.002. PMID  15541814.
• Ягихаши А., Омура Т., Асанума К. и др. (2006). «Обнаружение аутоантител к сурвивину и ливину в сыворотке крови больных раком груди». Clin. Чим. Acta. 362 (1–2): 125–30. Дои:10.1016 / j.cccn.2005.06.009. PMID  16026775.
• Црнкович-Мертенс I, Семцов Дж., Хоппе-Зейлер Ф., Бутц К. (2006). «Изоформ-специфическое подавление гена Livin посредством РНК-интерференции определяет Livin beta как ключевой медиатор ингибирования апоптоза в клетках HeLa». J. Mol. Med. 84 (3): 232–40. Дои:10.1007 / s00109-005-0021-5. PMID  16437214. S2CID  28468027.
• Ма Л, Хуанг Й, Сонг Зи и др. (2007). «Ливин способствует деградации Smac / DIABLO по пути убиквитин-протеасома». Разница в гибели клеток. 13 (12): 2079–88. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401959. PMID  16729033.
• Ян Х., Бруха Б., Лю Т. и др. (2006). «Протеолитическое расщепление Ливина (ML-IAP) в апоптотических клетках меланомы, потенциально опосредованное неканонической каспазой». J. Dermatol. Наука. 43 (3): 189–200. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2006.05.007. ЧВК  2292408. PMID  16806840.
• Wu H, Ma Y, Zhu Y и др. (2007). «Экспрессия белка и мРНК BIRC7 в неходжкинской лимфоме». Лейк. Лимфома. 47 (6): 1110–6. Дои:10.1080/10428190500472271. PMID  16840203. S2CID  24671993.
• Црнкович-Мертенс И., Мули Т., Мейстер М. и др. (2007). «Антиапоптотический ген ливина является важным фактором, определяющим устойчивость к апоптозу немелкоклеточных клеток рака легкого». Рак легких. 54 (2): 135–42. Дои:10.1016 / j.lungcan.2006.07.018. PMID  16965834.