BOC (ген) - BOC (gene)

BOC
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3N1G, 3Н1М, 3Н1П
Идентификаторы
Псевдонимы	BOC, CDON2, ассоциированная адгезия BOC-клеток, регулируется онкогеном
Внешние идентификаторы	OMIM: 608708 MGI: 2151153 ГомолоГен: 32819 Генные карты: BOC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q13.2 Начинать 113,211,003 бп[1] Конец 113,287,459 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B4 Начинать 44,485,049 бп[2] Конец 44,558,897 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • конус роста аксонов • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • нуклеоплазма Биологический процесс • сглаженный сигнальный путь • клеточная адгезия • положительная регуляция дифференцировки миобластов • положительное регулирование дифференцировки мышечных клеток • управление аксоном Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	91653	117606
Ансамбль	ENSG00000144857	ENSMUSG00000022687
UniProt	Q9BWV1	Q6AZB0
RefSeq (мРНК)	NM_001301861 NM_001301867 NM_033254 NM_001378073 NM_001378074 NM_001378075	NM_172506
RefSeq (белок)	NP_001288790 NP_001288796 NP_150279 NP_001365002 NP_001365003 NP_001365004	NP_766094
Расположение (UCSC)	Chr 3: 113.21 - 113.29 Мб	Chr 16: 44,49 - 44,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Брат CDO это белок что у людей кодируется BOC ген.^[5][6]

CDON (MIM 608707 ) и BOC являются рецепторами клеточной поверхности иммуноглобулин (Ig) /фибронектин тип III (FNIII; см. MIM 135600 ) повторяющееся семейство, участвующее в миогенной дифференцировке. CDON и BOC коэкспрессируются во время развития, образуют комплексы друг с другом в СНГ моды и связаны друг с другом своими эктодоменами, но у каждого из них есть уникальный длинный цитоплазматический хвост. [предоставлено OMIM]^[6]

Взаимодействия

BOC (ген) показал взаимодействовать с CDON.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144857 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022687 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Канг Дж. С., Мульери П. Дж., Ху Й., Талиана Л., Краусс Р. С. (январь 2002 г.). «BOC, член суперсемейства Ig, ассоциируется с CDO, чтобы положительно регулировать миогенную дифференцировку». EMBO J. 21 (1–2): 114–24. Дои:10.1093 / emboj / 21.1.114. ЧВК  125805. PMID  11782431.
6. «Ген Entrez: гомолог BOC Boc (мышь)».

внешняя ссылка

• Человек BOC расположение генома и BOC страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Канг Дж. С., Фейнлейб Дж. Л., Нокс С. и др. (2003). «Промиогенные члены семейств Ig и кадгерина связываются, чтобы положительно регулировать дифференцировку». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (7): 3989–94. Дои:10.1073 / pnas.0736565100. ЧВК  153035. PMID  12634428.
• Wegorzewska M, Krauss RS, Kang JS (2003). «Сверхэкспрессия членов суперсемейства иммуноглобулинов CDO и BOC усиливает дифференцировку линии RD клеток рабдомиосаркомы человека». Мол. Канцероген. 37 (1): 1–4. Дои:10.1002 / mc.10121. PMID  12720294. S2CID  46652847.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кан Дж. С., Йи М. Дж., Чжан В. и др. (2004). «Нетрины и неогенин способствуют образованию миотрубок». J. Cell Biol. 167 (3): 493–504. Дои:10.1083 / jcb.200405039. ЧВК  2172498. PMID  15520228.
• Тензен Т., Аллен Б.Л., Коул Ф. и др. (2006). «Белки мембран клеточной поверхности Cdo и Boc являются компонентами и мишенями сигнального пути Hedgehog и сети обратной связи у мышей». Dev. Клетка. 10 (5): 647–56. Дои:10.1016 / j.devcel.2006.04.004. PMID  16647304.