BTAF1 - BTAF1

BTAF1
Идентификаторы
Псевдонимы	BTAF1, MOT1, TAF (II) 170, TAF172, TAFII170, B-TFIID Фактор 1, связанный с TATA-боксом, связывающим белок
Внешние идентификаторы	OMIM: 605191 MGI: 2147538 ГомолоГен: 31978 Генные карты: BTAF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 10 (человек)
Конец	92,030,325 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	37,012,752 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Связывание ДНК; • связывание нуклеотидов; • гидролазная активность; • Связывание АТФ; • GO: 0008026 геликазная активность; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция связывания хроматина;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9044
	107182
	ENSG00000095564
	ENSMUSG00000040565
	O14981; Q2M1V9
	E9QAE3
	NM_003972
	NM_001080706
	NP_003963; NP_003963.1
	NP_001074175
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

TATA-связывающий белок-ассоциированный фактор 172 это белок что у людей кодируется BTAF1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Инициирование транскрипции с помощью РНК-полимеразы II требует помощи TATA-бокса-связывающего белка (TBP; MIM 600075) и TBP-ассоциированных факторов или TAF (например, TAF2B; MIM 604912) в 2 отдельных комплексах, TFIID и B-TFIID. Комплекс TFIID состоит из TBP и более 8 TAF. Однако большая часть ТВР присутствует в комплексе B-TFIID, который состоит из ТВР и TAFII170, также называемого TAF172, и обладает ДНК-зависимой АТФазной активностью. [Поставляется OMIM]^[7]

Взаимодействия

BTAF1 показал взаимодействовать с участием Связывающий белок ТАТА.^[6]^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095564 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040565 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ван дер Кнаап Дж. А., Борст Дж. В., ван дер Влит П. К., Генц Р., Тиммерс Х. Т. (декабрь 1997 г.). «Клонирование кДНК субъединицы фактора II170, связанного с ТАТА-связывающим белком, фактора транскрипции B-TFIID обнаруживает гомологию с глобальными регуляторами транскрипции у дрожжей и дрозофилы». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. Дои:10.1073 / пнас.94.22.11827. ЧВК 23617. PMID 9342322.
^ ^а ^б Чикка Дж. Дж., Обле Д. Т., Пью Б. Ф. (март 1998 г.). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1». Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1701. ЧВК 108885. PMID 9488487.
^ ^а ^б «Ген Entrez: BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанный с фактором транскрипции B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae)».
^ Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (11): 5605–10. Дои:10.1073 / пнас.94.11.5605. ЧВК 20825. PMID 9159119.

внешние ссылки

Человек BTAF1 расположение генома и BTAF1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Чжоу Кью, Шарп PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции Tat ВИЧ-1». EMBO J. 14 (2): 321–8. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. ЧВК 398086. PMID 7835343.
Parada CA, Юн JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне элонгации in vitro». J. Biol. Chem. 270 (5): 2274–83. Дои:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
Ou SH, Гарсия-Мартинес LF, Паулссен EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека 1 типа». Дж. Вирол. 68 (11): 7188–99. Дои:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. ЧВК 237158. PMID 7933101.
Кашанчи Ф., Пирас Дж., Радонович М.Ф., Дюваль Дж. Ф., Фаттей А., Чанг С.М., Рёдер Р.Г., Брэди Дж. Н. (1994). «Прямое взаимодействие человеческого TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа. 367 (6460): 295–9. Дои:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
Ван З., Моррис Г. Ф., Райс А. П., Сюн В., Моррис С. Б. (1996). «Мутанты дикого типа и трансактивационные дефектные мутанты белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 связывают человеческий TATA-связывающий белок in vitro». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. Гм. Ретровирол. 12 (2): 128–38. Дои:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
Пендерграст П.С., Моррисон Д., Тэнси В.П., Эрнандес Н. (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене ТВР одинаково влияют на синтез полноразмерных и коротких транскриптов вируса иммунодефицита человека типа 1». Дж. Вирол. 70 (8): 5025–34. Дои:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. ЧВК 190456. PMID 8764009.
Кашанчи Ф., Хлейф С.Н., Дюваль Дж.Ф., Садаи М.Р., Радонович М.Ф., Чо М., Мартин М.А., Чен С.Ю., Вайнманн Р., Брэди Дж. Н. (1996). «Взаимодействие Tat вируса иммунодефицита человека 1 типа с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор Dr1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA». Дж. Вирол. 70 (8): 5503–10. Дои:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. ЧВК 190508. PMID 8764062.
Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор РБ (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2». J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. Дои:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (1997). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (11): 5605–10. Дои:10.1073 / пнас.94.11.5605. ЧВК 20825. PMID 9159119.
Ван дер Кнаап Дж. А., Ван Ден Бум В., Кейперс Дж., Ван Эйк М. Дж., Ван дер Влиет П. К., Тиммерс Х. Т. (2000). «Ген человеческого фактора, связанного с ТАТА-связывающим белком (TAFII) 170: структура, промотор и хромосомная локализация». Biochem. J. 345 (3): 521–7. Дои:10.1042/0264-6021:3450521. ЧВК 1220786. PMID 10642510.
Вадхва Р., Ягути Т., Хасан М.К., Тайра К., Каул С.К. (2003). «Взаимодействия Mortalin-MPD (мевалонатпирофосфатдекарбоксилаза) и их роль в контроле клеточной пролиферации». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 302 (4): 735–42. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00226-2. PMID 12646231.
Перейра Л.А., Клейман М.П., Рулманн К., Кавелаарс Ф., Улад-Абдельгани М., Тиммерс Х.Т., Шульц П. (2004). «Молекулярная архитектура базального фактора транскрипции B-TFIID». J. Biol. Chem. 279 (21): 21802–7. Дои:10.1074 / jbc.M313519200. PMID 14988402.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Клейман М.П., Перейра Л.А., ван Зеебург Х.Дж., Гилфиллан С., Мейстерернст М., Тиммерс ХТ (2004). «NC2α взаимодействует с BTAF1 и стимулирует его АТФ-зависимую ассоциацию с TATA-связывающим белком». Мол. Cell. Биол. 24 (22): 10072–82. Дои:10.1128 / MCB.24.22.10072-10082.2004. ЧВК 525489. PMID 15509807.
Grob P, Cruse MJ, Inouye C, Peris M, Penczek PA, Tjian R, Nogales E (2006). «Криоэлектронные микроскопические исследования человеческого TFIID: конформационное дыхание в интеграции генных регуляторных сигналов». Структура. 14 (3): 511–20. Дои:10.1016 / j.str.2005.11.020. PMID 16531235.

Эта статья о ген на хромосома человека 10 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095564 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040565 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9342322-5] ван дер Кнаап Дж. А., Борст Дж. В., ван дер Влит П. К., Генц Р., Тиммерс Х. Т. (декабрь 1997 г.). «Клонирование кДНК субъединицы фактора II170, связанного с ТАТА-связывающим белком, фактора транскрипции B-TFIID обнаруживает гомологию с глобальными регуляторами транскрипции у дрожжей и дрозофилы». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. Дои:10.1073 / пнас.94.22.11827. ЧВК 23617. PMID 9342322.

[pmid9488487-6] а ^б Чикка Дж. Дж., Обле Д. Т., Пью Б. Ф. (март 1998 г.). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1». Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1701. ЧВК 108885. PMID 9488487.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанный с фактором транскрипции B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae)».

[pmid9159119-8] Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Е Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (11): 5605–10. Дои:10.1073 / пнас.94.11.5605. ЧВК 20825. PMID 9159119.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]