CADM3 - CADM3

CADM3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Z9M
Идентификаторы
Псевдонимы	CADM3, BIgR, IGSF4B, NECL1, Necl-1, TSLL1, synCAM3, молекула клеточной адгезии 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609743 MGI: 2137858 ГомолоГен: 10919 Генные карты: CADM3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.2 Начинать 159,171,609 бп[1] Конец 159,203,313 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 H3 Начинать 173,333,258 бп[2] Конец 173,367,695 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • активность гомодимеризации белков • связывание молекул клеточной адгезии Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • соединение клеток • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • межклеточное соединение • параллельное волокно синапсу клетки Пуркинье • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны Биологический процесс • локализация белка • гетерофильная клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • клеточная адгезия • распознавание клеток • организация стыковки приверженцев • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57863	94332
Ансамбль	ENSG00000162706	ENSMUSG00000005338
UniProt	Q8N126	Q99N28
RefSeq (мРНК)	NM_021189 NM_001127173 NM_001346510	NM_053199
RefSeq (белок)	NP_001120645 NP_001333439 NP_067012	NP_444429
Расположение (UCSC)	Chr 1: 159.17 - 159,2 Мб	Chr 1: 173.33 - 173.37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Молекула клеточной адгезии 3 это белок что у людей кодируется CADM3 ген.^[5][6]

IGSF4B - это специфический для мозга белок, связанный с кальций-независимыми молекулами клеточно-клеточной адгезии, известными как нектины (см. PVRL3; MIM 607147) (Kakunaga et al., 2005).^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162706 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005338 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фукухара Х., Курамоти М., Нобукуни Т., Фуками Т., Сайно М., Маруяма Т., Номура С., Секия Т., Мураками Ю. (сентябрь 2001 г.). «Выделение генов TSLL1 и TSLL2, членов семейства генов супрессоров опухолей TSLC1, кодирующих трансмембранные белки». Онкоген. 20 (38): 5401–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1204696. PMID  11536053.
6. «Ген Entrez: молекула клеточной адгезии CADM3 3».

внешняя ссылка

• Человек CADM3 расположение генома и CADM3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Шингаи Т., Икеда В., Какунага С. и др. (2003). «Влияние нектин-подобной молекулы-2 / IGSF4 / RA175 / SgIGSF / TSLC1 / SynCAM1 на межклеточную адгезию и локализацию трансмембранного белка в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 278 (37): 35421–7. Дои:10.1074 / jbc.M305387200. PMID  12826663.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Фуками Т., Сато Х., Уильямс Ю.Н. и др. (2004). «Выделение мышиных генов Tsll1 и Tsll2, ортологов TSLC1-подобных генов 1 и 2 человека (TSLL1 и TSLL2)». Ген. 323: 11–8. Дои:10.1016 / j.gene.2003.09.018. PMID  14659875.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Какунага С., Икеда В., Ито С. и др. (2005). «Нектин-подобная молекула-1 / TSLL1 / SynCAM3: иммуноглобулиноподобная молекула клеточно-клеточной адгезии, специфичная для нервной ткани, локализованная в местах несвязанного контакта пресинаптических нервных окончаний, аксонов и отростков глиальных клеток». J. Cell Sci. 118 (Pt 6): 1267–77. Дои:10.1242 / jcs.01656. PMID  15741237.
• Чжоу Ю., Ду Г, Ху Х и др. (2005). «Нектин-подобная молекула 1 представляет собой белок, связанный с белком 4.1N, и привлекает белок 4.1N из цитоплазмы в плазматическую мембрану». Биохим. Биофиз. Acta. 1669 (2): 142–54. Дои:10.1016 / j.bbamem.2005.01.013. PMID  15893517.
• Дун Х, Сюй Ф, Гонг И и др. (2006). «Кристаллическая структура V-домена нектин-подобной молекулы человека-1 / Syncam3 / Tsll1 / Igsf4b, иммуноглобулиноподобной молекулы клеточно-клеточной адгезии, специфичной для нервной ткани». J. Biol. Chem. 281 (15): 10610–7. Дои:10.1074 / jbc.M513459200. PMID  16467305.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.