CALML5 - CALML5

CALML5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Б1У
Идентификаторы
Псевдонимы	CALML5, CLSP, кальмодулин типа 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 605183 MGI: 1931464 ГомолоГен: 49485 Генные карты: CALML5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п15.1 Начинать 5,498,697 бп[1] Конец 5,499,570 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A1 Начинать 3,837,757 бп[2] Конец 3,838,673 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание ионов кальция • GO: 0010576 ферментный регулятор активности Сотовый компонент • внеклеточная область • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • ядро клетки Биологический процесс • преобразование сигнала • развитие эпидермиса • дегрануляция нейтрофилов • кальций-опосредованная передача сигналов • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • организация корпуса полюса шпинделя Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51806	80796
Ансамбль	ENSG00000178372	ENSMUSG00000033765
UniProt	Q9NZT1	Q9JM83
RefSeq (мРНК)	NM_017422	NM_020036
RefSeq (белок)	NP_059118	NP_064420
Расположение (UCSC)	Chr 10: 5.5 - 5.5 Мб	Chr 13: 3.84 - 3.84 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальмодулиноподобный белок 5 это белок что у людей кодируется CALML5 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует роман кальций связывающий белок, экспрессируемый в эпидермис и связанные с кальмодулин семья кальций-связывающие белки. Функциональные исследования с рекомбинантным белком показывают, что он действительно связывает кальций и при этом претерпевает конформационные изменения. Обильная экспрессия обнаруживается только в реконструированном эпидермисе и ограничивается дифференцировкой кератиноциты. Кроме того, он может ассоциироваться с трансглутаминаза 3, который является ключевым ферментом в терминальной дифференцировке кератиноциты.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178372 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033765 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мехул Б., Бернард Д., Симонетти Л., Бернард М.А., Шмидт Р. (июнь 2000 г.). «Идентификация и клонирование нового кальмодулиноподобного белка из эпидермиса человека». J Biol Chem. 275 (17): 12841–7. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12841. PMID  10777582.
6. «Энтрез Ген: CALML5, подобный кальмодулину 5».

внешняя ссылка

• Человек CALML5 расположение генома и CALML5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NZT1 (Человеческий кальмодулиноподобный белок 5) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Мехул Б., Бернар Д., Шмидт Р. (2001). «Кальмодулиноподобный белок кожи: новый маркер дифференцировки кератиноцитов». J. Invest. Дерматол. 116 (6): 905–9. Дои:10.1046 / j.0022-202x.2001.01376.x. PMID  11407979.
• Дюруссель I, Мехул Б., Бернар Д. и др. (2002). «Свойства связывания катионов и пептидов кальмодулиноподобного кожного белка человека». Биохимия. 41 (17): 5439–48. Дои:10.1021 / bi016062z. PMID  11969404.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Мехул Б., Бернар Д., Бруард М. и др. (2006). «Влияние кальция на протеолитическое разложение кальмодулиноподобного кожного белка (кальмодулиноподобный белок 5) в псориатическом эпидермисе». Exp. Дерматол. 15 (6): 469–77. Дои:10.1111 / j.1600-0625.2006.00433.x. PMID  16689864. S2CID  32717375.
• Бабини Э., Бертини И., Капоцци Ф. и др. (2006). «Структурная и динамическая характеристика белка руки EF CLSP». Структура. 14 (6): 1029–38. Дои:10.1016 / j.str.2006.04.004. PMID  16765896.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.