CCDC80 - CCDC80

CCDC80
Идентификаторы
Псевдонимы	CCDC80, DRO1, SSG1, URB, окурибин, домен coiled-coil, содержащий 80, CL2, LINC01279
Внешние идентификаторы	OMIM: 608298 MGI: 1915146 ГомолоГен: 12206 Генные карты: CCDC80
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q13.2 Начинать 112,596,794 бп[1] Конец 112,649,530 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B5 Начинать 45,093,402 бп[2] Конец 45,128,077 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фибронектина • связывание гликозаминогликанов • связывание гепарина Сотовый компонент • внеклеточная область • базальная мембрана • промежуточная матрица • внеклеточный матрикс Биологический процесс • организация внеклеточного матрикса • положительное регулирование адгезии клетки к субстрату • реакция на бактерии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	151887	67896
Ансамбль	ENSG00000091986	ENSMUSG00000022665
UniProt	Q76M96	Q8R2G6
RefSeq (мРНК)	NM_199512 NM_199511	NM_026439
RefSeq (белок)	NP_955805 NP_955806	NP_080715
Расположение (UCSC)	Chr 3: 112,6 - 112,65 Мб	Chr 16: 45.09 - 45.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий домен спиральной спирали 80 это белок что у людей кодируется CCDC80 ген.^[5][6][7] Биоинформатический анализ показывает, что белок CCDC80 является пероксиредоксин.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000091986 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022665 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (май 1997 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
6. Лю Ю., Монтиконе М., Тоначини Л., Мастрогиакомо М., Мариго В., Канедедда Р., Кастаньола П. (август 2004 г.). «Экспрессия URB в стромальных клетках костного мозга человека и во время развития мышей». Biochem Biophys Res Commun. 322 (2): 497–507. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.161. PMID  15325258.
7. «Ген Энтреза: домен спиральной спирали CCDC80, содержащий 80».
8. Павловский К., Мушевская А., Ленарт А. и др. (2010). «Широко распространенный пероксиредоксиноподобный домен, присутствующий в белках, участвующих в подавлении и прогрессировании опухоли». BMC Genomics. 11: 590. Дои:10.1186/1471-2164-11-590. ЧВК  3091736. PMID  20964819.

внешняя ссылка

• Человек CCDC80 расположение генома и CCDC80 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Окада Т., Нисизава Х., Курата А. и др. (2008). «URB в изобилии экспрессируется в жировой ткани и не регулируется при ожирении». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 367 (2): 370–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.12.164. PMID  18178152.
• Ча СИ, Сунг Ю.К., Им С. и др. (2005). «Экспрессия URB в клетках кожного сосочка человека». J. Dermatol. Наука. 39 (2): 128–30. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2005.05.005. PMID  15998583.
• Bommer GT, Jäger C, Dürr EM и др. (2005). «DRO1, ген, подавляемый онкогенами, опосредует ингибирование роста раковых клеток толстой кишки и поджелудочной железы». J. Biol. Chem. 280 (9): 7962–75. Дои:10.1074 / jbc.M412593200. PMID  15563452.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Аоки К., Сун Ю.Дж., Аоки С. и др. (2002). «Клонирование, экспрессия и картирование гена, который активируется в жировой ткани мышей с дефицитом рецептора бомбезина подтипа-3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 290 (4): 1282–8. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6337. PMID  11812002.