CCNC (ген) - CCNC (gene)

CCNC
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3RGF, 4Ф6С, 4Ф6У, 4F6W, 4F70, 4F7J, 4F7L, 4F7N, 4F7S, 4G6L, 4CRL, 5HBE, 5HBH, 5BNJ, 5HBJ, 5ФГК, 5CEI, 5HNB, 5HVY, 5I5Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CCNC, CycC, циклин C, hSRB11, SRB11
Внешние идентификаторы	OMIM: 123838 MGI: 1858199 ГомолоГен: 3803 Генные карты: CCNC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q16.2 Начните 99,542,387 бп[1] Конец 99,568,825 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A3 Начните 21,727,701 бп[2] Конец 21,759,922 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность протеин-серин / треонинкиназы • активность регулятора циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы Сотовый компонент • посреднический комплекс • холоферментный комплекс циклинзависимой протеинкиназы • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • позитивная регуляция фосфорилирования С-концевого домена РНК-полимеразы II • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • фосфорилирование белков • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция активности протеинкиназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	892	51813
Ансамбль	ENSG00000112237	ENSMUSG00000028252
UniProt	P24863	Q62447
RefSeq (мРНК)	NM_001013399 NM_005190 NM_001363537	NM_001122982 NM_001290420 NM_001290422 NM_016746
RefSeq (белок)	NP_001013417 NP_005181 NP_001350466	NP_001116454 NP_001277349 NP_001277351 NP_058026
Расположение (UCSC)	Chr 6: 99,54 - 99,57 Мб	Chr 4: 21.73 - 21.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Циклин-С это белок что у людей кодируется CCNC ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков циклинов. Кодируемый белок взаимодействует с циклин-зависимой киназой 8 и индуцирует фосфорилирование карбоксиконцевого домена большой субъединицы РНК-полимераза II. Уровень мРНК этого гена достигает пика в фазе G1 клеточного цикла. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

CCNC (ген), как было показано, взаимодействовать с участием Рецептор эстрогена альфа^[7] и Циклинзависимая киназа 8.^{[7][8][9][10][11]}

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112237 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028252 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лью Д. Д., Дулич В., Рид С. И. (октябрь 1991 г.). «Выделение трех новых циклинов человека путем восстановления функции циклина G1 (Cln) в дрожжах». Ячейка. 66 (6): 1197–206. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90042-В. PMID  1833066. S2CID  12166415.
6. «Энтрез Ген: CCNC циклин C».
7. Кан, Юн Кён; Гермах Мохамед; Юань Чао-Син; Roeder Robert G (март 2002 г.). «Коактиваторный комплекс TRAP / медиатор напрямую взаимодействует с рецепторами эстрогена α и β через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2642–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.2642K. Дои:10.1073 / pnas.261715899. ISSN  0027-8424. ЧВК  122401. PMID  11867769.
8. Zhang, Y; Иратни Р; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Рейнберг Д. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса Sin3 человека». Ячейка. 89 (3): 357–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80216-0. ISSN  0092-8674. PMID  9150135.
9. Чо, Н; Орфаниды G; Солнце X; Ян Х Дж; Огрызко В; Lees E; Nakatani Y; Рейнберг Д. (сентябрь 1998 г.). «Комплекс человеческой РНК-полимеразы II, содержащий факторы, которые изменяют структуру хроматина». Мол. Cell. Биол. 18 (9): 5355–63. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. ISSN  0270-7306. ЧВК  109120. PMID  9710619.
10. Ванга, G; Cantin G T; Стивенс Дж. Л.; Berk A J (июль 2001 г.). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток HeLa». Мол. Cell. Биол. 21 (14): 4604–13. Дои:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. ISSN  0270-7306. ЧВК  87123. PMID  11416138.
11. Тассан, Дж. П.; Jaquenoud M; Леопольд П; Шульц С. Дж .; Нигг Е.А. (сентябрь 1995 г.). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина C». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. Дои:10.1073 / пнас.92.19.8871. ISSN  0027-8424. ЧВК  41069. PMID  7568034.

внешние ссылки

• Человек CCNC расположение генома и CCNC страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Нодзава Т., Хатано М., Ямамото Х., Кван Т. (1976). «Магнитный круговой дихроизм при обратимом оксигенации диметилмезопорфирин-IX-атопиридинкобальта (II)». Биоинорганическая химия. 5 (3): 267–73. Дои:10.1016 / S0006-3061 (00) 82025-6. PMID  1260071.
• Тассан Дж. П., Жакен М., Леопольд П. и др. (1995). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина C». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. Дои:10.1073 / пнас.92.19.8871. ЧВК  41069. PMID  7568034.
• Деметрик Д. Д., Мацумото С., Ханнон Г. Дж. И др. (1995). «Хромосомное картирование генов белков клеточного цикла человека циклина C (CCNC), циклина E (CCNE), p21 (CDKN1) и KAP (CDKN3)». Cytogenet. Cell Genet. 69 (3–4): 190–2. Дои:10.1159/000133960. PMID  7698009.
• Йошизуми М., Ли В.С., Се СМ и др. (1995). «Исчезновение циклина А коррелирует с постоянным выводом кардиомиоцитов из клеточного цикла в сердцах человека и крысы». J. Clin. Вкладывать деньги. 95 (5): 2275–80. Дои:10.1172 / JCI117918. ЧВК  295840. PMID  7738192.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Рикерт П., Сегеззи В., Шанахан Ф. и др. (1996). «Циклин C / CDK8 представляет собой новую киназу CTD, связанную с РНК-полимеразой II». Онкоген. 12 (12): 2631–40. PMID  8700522.
• Ли Х., Лахти Дж. М., Валентин М. и др. (1997). «Молекулярное клонирование и хромосомная локализация генов циклина C человека (CCNC) и циклина E (CCNE): делеция гена CCNC в опухолях человека». Геномика. 32 (2): 253–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0112. PMID  8833152.
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, et al. (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II». Мол. Cell. Биол. 17 (4): 1817–23. Дои:10.1128 / MCB.17.4.1817. ЧВК  232028. PMID  9121429.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Нейш А.С., Андерсон С.Ф., Шлегель Б.П. и др. (1998). «Факторы, связанные с холоферментом РНК-полимеразы II млекопитающих». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (3): 847–53. Дои:10.1093 / nar / 26.3.847. ЧВК  147327. PMID  9443979.
• Cho H, Orphanides G, Sun X и др. (1998). «Комплекс человеческой РНК-полимеразы II, содержащий факторы, которые изменяют структуру хроматина». Мол. Cell. Биол. 18 (9): 5355–63. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. ЧВК  109120. PMID  9710619.
• Sun X, Zhang Y, Cho H и др. (1998). «NAT, человеческий комплекс, содержащий полипептиды Srb, который действует как негативный регулятор активированной транскрипции». Мол. Ячейка. 2 (2): 213–22. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80131-8. PMID  9734358.
• Гу В., Малик С., Ито М. и др. (1999). «Новый человеческий SRB / MED-содержащий кофакторный комплекс, SMCC, участвующий в регуляции транскрипции». Мол. Ячейка. 3 (1): 97–108. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80178-1. PMID  10024883.
• Ито М., Юань С.Х., Малик С. и др. (1999). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Ячейка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
• Рашез К., Лимон Б.Д., Сулдан З. и др. (1999). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–8. Bibcode:1999Натура.398..824р. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266. S2CID  204992765.
• Ван Г, Кантин GT, Стивенс Дж. Л., Берк А. Дж. (2001). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток HeLa». Мол. Cell. Биол. 21 (14): 4604–13. Дои:10.1128 / MCB.21.14.4604-4613.2001. ЧВК  87123. PMID  11416138.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния и др. (2003). «Идентификация медиаторных субъединиц млекопитающих с подобием дрожжевых медиаторных субъединиц Srb5, Srb6, Med11 и Rox3». J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–7. Дои:10.1074 / jbc.C300054200. PMID  12584197.
• Ueberham U, Hessel A, Arendt T (2003). «Экспрессия циклина С участвует в патогенезе болезни Альцгеймера». Neurobiol. Старение. 24 (3): 427–35. Дои:10.1016 / S0197-4580 (02) 00132-X. PMID  12600719. S2CID  12604491.