CDK5RAP1 - CDK5RAP1

CDK5RAP1
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK5RAP1, C20orf34, C42, CGI-05, HSPC167, белок 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5
Внешние идентификаторы	OMIM: 608200 MGI: 1914221 ГомолоГен: 9502 Генные карты: CDK5RAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.21 Начните 33,358,839 бп[1] Конец 33,401,561 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H1 Начните 154,335,380 бп[2] Конец 154,373,010 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • трансферазная активность • железо-серное кластерное связывание • каталитическая активность • связывание протеинкиназы • связывание ионов металлов • Активность N6-изопентениладенозинметилтиотрансферазы • 4 железа, 4 связки серы Сотовый компонент • цитоплазма • митохондрия • клеточный компонент Биологический процесс • регуляция дифференцировки нейронов • развитие мозга • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • модификация тРНК • положительная регуляция митохондриальной трансляции • модификация митохондриальной тРНК • положительное регулирование точности перевода • тРНК метилтиолирование • GO: 0016547 Модификация РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51654	66971
Ансамбль	ENSG00000101391	ENSMUSG00000027487
UniProt	Q96SZ6	Q8BTW8
RefSeq (мРНК)	NM_001278167 NM_001278168 NM_001278169 NM_016082 NM_016408 NM_001365728	NM_025876
RefSeq (белок)	NP_001265096 NP_001265097 NP_001265098 NP_057166 NP_057492 NP_001352657	NP_080152
Расположение (UCSC)	Chr 20: 33,36 - 33,4 Мб	Chr 2: 154.34 - 154.37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5 это белок что у людей кодируется CDK5RAP1 ген.^[5][6][7][8]

Нейронный CDC2-подобный киназа, который участвует в регуляции нейронального дифференциация, состоит из каталитической субъединицы, CDK5 и активирующую субъединицу p25NCK5A. Белок, кодируемый этим геном, связывается с p25NCK5A и, следовательно, может участвовать в дифференцировке нейронов. Несколько варианты расшифровки существуют для этого гена, но полноразмерная природа только двух была определена.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101391 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027487 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цзин Ю.П., Ци З., Ван Дж.Х. (апрель 2000 г.). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Ген. 242 (1–2): 285–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.
6. Чинг Ю.П., Пан А.С., Лам У.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (апрель 2002 г.). «Идентификация нейронального белка, связывающего активатор Cdk5, в качестве ингибитора Cdk5». J Biol Chem. 277 (18): 15237–40. Дои:10.1074 / jbc.C200032200. PMID  11882646.
7. Цзоу X, Цзи Си, Цзинь Ф, Лю Дж, У М, Чжэн Х, Ван И, Ли Х, Сю Дж, Гу С, Се Y, Мао Y (август 2004 г.). «Клонирование, характеристика и экспрессия CDK5RAP1_v3 и CDK5RAP1_v4, двух новых вариантов сплайсинга человеческого CDK5RAP1». Гены Genet Syst. 79 (3): 177–82. Дои:10.1266 / ggs.79.177. PMID  15329498.
8. «Ген Entrez: белок 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5RAP1 CDK5».

внешняя ссылка

• Человек CDK5RAP1 расположение генома и CDK5RAP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH и др. (2000). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5». J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. Дои:10.1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.