CHMP6 - CHMP6

CHMP6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2K3W, 3HTU
Идентификаторы
Псевдонимы	CHMP6, VPS20, заряженный мультивезикулярный белок тела 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 610901 MGI: 3583942 ГомолоГен: 11607 Генные карты: CHMP6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.3 Начните 80,991,598 бп[1] Конец 81,009,517 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E2 Начните 119,913,441 бп[2] Конец 119,919,548 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с N-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • ESCRT III комплекс • цитозоль • эндосома • мембрана • мембрана поздней эндосомы • эндосомная мембрана • внеклеточная экзосома • эндомембранная система Биологический процесс • GO: 0019067 жизненный цикл вируса • ядро организации • регуляция экзосомальной секреции • мультивезикулярная сборка тела • Сборка комплекса ESCRT III • эндосомный транспорт • транспорт белка • разделение клеток после цитокинеза • конгресс митотической метафазной пластинки • вакуолярный транспорт • макроавтофагия • отрицательная регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста • транспорт • регуляция белкового катаболического процесса • опущение средней части тела Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79643	208092
Ансамбль	ENSG00000176108	ENSMUSG00000025371
UniProt	Q96FZ7	P0C0A3
RefSeq (мРНК)	NM_024591	NM_001085498
RefSeq (белок)	NP_078867	NP_001078967
Расположение (UCSC)	Chr 17: 80.99 - 81.01 Мб	Chr 11: 119.91 - 119.92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Заряженный мультивезикулярный белок тела 6 это белок что у людей кодируется CHMP6 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000176108 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025371 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Говард Т.Л., Штауфер Д.Р., Дегнин С.Р., Холленберг С.М. (сентябрь 2001 г.). «CHMP1 функционирует как член недавно определенного семейства белков транспорта везикул». J Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID  11559748.
6. Йорикава К., Шибата Х, Вагури С., Хатта К., Хории М., Катох К., Кобаяши Т., Учияма Ю., Маки М. (март 2005 г.). «Человеческий CHMP6, миристоилированный белок ESCRT-III, напрямую взаимодействует с компонентом EAP20 ESCRT-II и регулирует сортировку эндосомного груза». Biochem J. 387 (Пт 1): 17–26. Дои:10.1042 / BJ20041227. ЧВК  1134928. PMID  15511219.
7. «Ген Entrez: белок 6, модифицирующий хроматин CHMP6».

внешняя ссылка

• Человек CHMP6 расположение генома и CHMP6 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Strack B, Calistri A, Craig S и др. (2003). «AIP1 / ALIX является партнером по связыванию p6 ВИЧ-1 и p9 EIAV, функционирующих в процессе отпочкования вируса». Клетка. 114 (6): 689–99. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID  14505569. S2CID  10733770.
• von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B и др. (2003). «Белковая сеть почкования ВИЧ». Клетка. 114 (6): 701–13. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID  14505570. S2CID  16894972.
• Мартин-Серрано Дж., Яровой А., Перес-Кабальеро Д. и др. (2003). «Дивергентные ретровирусные домены с поздним почкованием привлекают факторы сортировки вакуолярных белков с помощью альтернативных адаптерных белков». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (21): 12414–9. Дои:10.1073 / pnas.2133846100. ЧВК  218772. PMID  14519844.
• Пек JW, Bowden ET, Burbelo PD (2004). «Структура и функция белков Vps20 и Snf7 человека». Biochem. J. 377 (Pt 3): 693–700. Дои:10.1042 / BJ20031347. ЧВК  1223912. PMID  14583093.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Цанг Х. Т., Коннелл Дж. У., Браун С. Е. и др. (2006). «Систематический анализ человеческих взаимодействий с белками CHMP: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с множеством компонентов человеческого комплекса ESCRT III». Геномика. 88 (3): 333–46. Дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID  16730941.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.